MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 3490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383499257
2	NC_017056	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383499257
3	NC_017056	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017056	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017056	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383499259
6	NC_017056	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383499260
7	NC_017056	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
8	NC_017056	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383499260
9	NC_017056	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
10	NC_017056	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383499261
11	NC_017056	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383499261
12	NC_017056	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383499261
13	NC_017056	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383499261
14	NC_017056	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017056	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017056	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017056	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	383499262
18	NC_017056	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	383499262
19	NC_017056	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	383499262
20	NC_017056	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	383499262
21	NC_017056	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	383499264
22	NC_017056	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017056	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017056	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017056	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017056	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	383499265
27	NC_017056	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	383499265
28	NC_017056	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	383499265
29	NC_017056	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	383499265
30	NC_017056	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	383499265
31	NC_017056	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	383499266
32	NC_017056	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	383499266
33	NC_017056	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	383499266
34	NC_017056	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	383499266
35	NC_017056	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	383499268
36	NC_017056	GCTT	2	8	12460	12467	0 %	50 %	25 %	25 %	383499268
37	NC_017056	AATA	2	8	13373	13380	75 %	25 %	0 %	0 %	383499269
38	NC_017056	GCTC	2	8	13577	13584	0 %	25 %	25 %	50 %	383499269
39	NC_017056	TAAG	2	8	14774	14781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017056	ATTA	2	8	14795	14802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017056	AAAG	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017056	TTAT	2	8	15035	15042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017056	TAAG	2	8	15223	15230	50 %	25 %	25 %	0 %	383499270
44	NC_017056	AATA	2	8	15653	15660	75 %	25 %	0 %	0 %	383499270
45	NC_017056	GTAA	2	8	15801	15808	50 %	25 %	25 %	0 %	383499270
46	NC_017056	AGCA	2	8	16083	16090	50 %	0 %	25 %	25 %	383499271
47	NC_017056	AATT	2	8	16696	16703	50 %	50 %	0 %	0 %	383499271
48	NC_017056	AAAG	2	8	17166	17173	75 %	0 %	25 %	0 %	383499271
49	NC_017056	ATTC	2	8	17259	17266	25 %	50 %	0 %	25 %	383499271
50	NC_017056	TTCA	2	8	18311	18318	25 %	50 %	0 %	25 %	383499272
51	NC_017056	TAAA	2	8	18950	18957	75 %	25 %	0 %	0 %	383499272
52	NC_017056	TATT	2	8	19394	19401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017056	GTAA	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017056	TTAT	2	8	19646	19653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017056	TCAA	2	8	19678	19685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017056	GTAA	2	8	19847	19854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017056	ATAG	2	8	20082	20089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017056	ATTA	2	8	20186	20193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017056	ATCA	2	8	20750	20757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017056	AACA	2	8	21111	21118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017056	GTAT	2	8	21150	21157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017056	TGAT	2	8	21843	21850	25 %	50 %	25 %	0 %	383499275
63	NC_017056	TAAT	2	8	22423	22430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017056	ATAC	2	8	22469	22476	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
65	NC_017056	AACT	2	8	22657	22664	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
66	NC_017056	AAAT	2	8	22891	22898	75 %	25 %	0 %	0 %	383499277
67	NC_017056	CACT	2	8	22987	22994	25 %	25 %	0 %	50 %	383499277
68	NC_017056	AAGT	2	8	23040	23047	50 %	25 %	25 %	0 %	383499277
69	NC_017056	ATTA	2	8	23422	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	383499278
70	NC_017056	ATTT	2	8	23481	23488	25 %	75 %	0 %	0 %	383499279
71	NC_017056	TATT	2	8	23728	23735	25 %	75 %	0 %	0 %	383499279
72	NC_017056	TCTT	2	8	25038	25045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017056	AAAT	2	8	25629	25636	75 %	25 %	0 %	0 %	383499281
74	NC_017056	TAAA	2	8	26858	26865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017056	TTAA	2	8	27105	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	383499282
76	NC_017056	TAGT	2	8	27268	27275	25 %	50 %	25 %	0 %	383499282
77	NC_017056	ATTT	2	8	27287	27294	25 %	75 %	0 %	0 %	383499282
78	NC_017056	TTGC	2	8	27562	27569	0 %	50 %	25 %	25 %	383499282
79	NC_017056	ATTT	2	8	27712	27719	25 %	75 %	0 %	0 %	383499282
80	NC_017056	TTCC	2	8	27802	27809	0 %	50 %	0 %	50 %	383499282
81	NC_017056	GCTT	2	8	27940	27947	0 %	50 %	25 %	25 %	383499282
82	NC_017056	ATTT	3	12	28772	28783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017056	TACA	2	8	28914	28921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017056	ATAA	2	8	29089	29096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017056	AATA	2	8	29719	29726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017056	TTTG	2	8	31040	31047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017056	ATTA	2	8	31250	31257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017056	ATAG	2	8	31389	31396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017056	TTTG	2	8	31479	31486	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017056	ATTT	2	8	31805	31812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017056	TTCT	2	8	31847	31854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017056	AAAT	2	8	32608	32615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017056	TATT	2	8	32709	32716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017056	ATTT	2	8	32850	32857	25 %	75 %	0 %	0 %	383499284
95	NC_017056	ATTT	2	8	33290	33297	25 %	75 %	0 %	0 %	383499285
96	NC_017056	AAAT	2	8	33314	33321	75 %	25 %	0 %	0 %	383499285
97	NC_017056	ATAA	2	8	33790	33797	75 %	25 %	0 %	0 %	383499285
98	NC_017056	AGCA	2	8	34278	34285	50 %	0 %	25 %	25 %	383499286
99	NC_017056	TTTC	2	8	34946	34953	0 %	75 %	0 %	25 %	383499287
100	NC_017056	ATTT	2	8	35811	35818	25 %	75 %	0 %	0 %	383499287
101	NC_017056	TCGT	2	8	36090	36097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017056	AATC	2	8	36401	36408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017056	TGAT	2	8	36473	36480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017056	TTGA	2	8	36653	36660	25 %	50 %	25 %	0 %	383499288
105	NC_017056	AGTA	2	8	36772	36779	50 %	25 %	25 %	0 %	383499288
106	NC_017056	TACT	2	8	37122	37129	25 %	50 %	0 %	25 %	383499288
107	NC_017056	TCAA	2	8	37983	37990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017056	ATGT	2	8	38043	38050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017056	TTAA	2	8	38309	38316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017056	TTAT	2	8	38375	38382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017056	TAAA	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	383499289
112	NC_017056	GAGT	2	8	39879	39886	25 %	25 %	50 %	0 %	383499289
113	NC_017056	AATA	2	8	41063	41070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017056	AAAT	2	8	41129	41136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017056	ATTA	2	8	42004	42011	50 %	50 %	0 %	0 %	383499290
116	NC_017056	ACTT	2	8	42952	42959	25 %	50 %	0 %	25 %	383499291
117	NC_017056	AATA	2	8	43441	43448	75 %	25 %	0 %	0 %	383499291
118	NC_017056	TAAA	2	8	43497	43504	75 %	25 %	0 %	0 %	383499291
119	NC_017056	AAAC	2	8	43794	43801	75 %	0 %	0 %	25 %	383499291
120	NC_017056	ATTT	3	12	43809	43820	25 %	75 %	0 %	0 %	383499291
121	NC_017056	TTTA	2	8	43996	44003	25 %	75 %	0 %	0 %	383499291
122	NC_017056	TAAG	2	8	44388	44395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017056	GTTT	2	8	44780	44787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017056	AGAA	2	8	45032	45039	75 %	0 %	25 %	0 %	383499292
125	NC_017056	AAAG	2	8	45412	45419	75 %	0 %	25 %	0 %	383499293
126	NC_017056	TAAA	2	8	45479	45486	75 %	25 %	0 %	0 %	383499293
127	NC_017056	AAGA	2	8	46457	46464	75 %	0 %	25 %	0 %	383499295
128	NC_017056	TAAT	2	8	46964	46971	50 %	50 %	0 %	0 %	383499295
129	NC_017056	ATTA	2	8	47040	47047	50 %	50 %	0 %	0 %	383499295
130	NC_017056	TTAT	2	8	47235	47242	25 %	75 %	0 %	0 %	383499295
131	NC_017056	GAAT	2	8	47812	47819	50 %	25 %	25 %	0 %	383499296
132	NC_017056	CTTA	2	8	48086	48093	25 %	50 %	0 %	25 %	383499296
133	NC_017056	ATGG	2	8	48366	48373	25 %	25 %	50 %	0 %	383499296
134	NC_017056	TATG	2	8	49094	49101	25 %	50 %	25 %	0 %	383499296
135	NC_017056	TAAT	2	8	49487	49494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017056	GCTA	2	8	51865	51872	25 %	25 %	25 %	25 %	383499298
137	NC_017056	AATT	2	8	51961	51968	50 %	50 %	0 %	0 %	383499298
138	NC_017056	CGAC	2	8	51984	51991	25 %	0 %	25 %	50 %	383499298
139	NC_017056	AAAT	2	8	52058	52065	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
140	NC_017056	ATAA	2	8	52421	52428	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
141	NC_017056	ATAA	2	8	52750	52757	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
142	NC_017056	TAAT	2	8	52802	52809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017056	TGTT	2	8	53029	53036	0 %	75 %	25 %	0 %	383499300
144	NC_017056	TTAA	2	8	53067	53074	50 %	50 %	0 %	0 %	383499300
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