MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP chromosome

Total Repeats: 2441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017056	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383499257
2	NC_017056	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383499257
3	NC_017056	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383499259
4	NC_017056	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383499260
5	NC_017056	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
6	NC_017056	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383499260
7	NC_017056	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383499260
8	NC_017056	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383499261
9	NC_017056	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383499261
10	NC_017056	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383499261
11	NC_017056	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383499261
12	NC_017056	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	383499262
13	NC_017056	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	383499262
14	NC_017056	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	383499262
15	NC_017056	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	383499262
16	NC_017056	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	383499264
17	NC_017056	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	383499265
18	NC_017056	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	383499265
19	NC_017056	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	383499265
20	NC_017056	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	383499265
21	NC_017056	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	383499265
22	NC_017056	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	383499266
23	NC_017056	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	383499266
24	NC_017056	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	383499266
25	NC_017056	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	383499266
26	NC_017056	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	383499268
27	NC_017056	GCTT	2	8	12460	12467	0 %	50 %	25 %	25 %	383499268
28	NC_017056	AATA	2	8	13373	13380	75 %	25 %	0 %	0 %	383499269
29	NC_017056	GCTC	2	8	13577	13584	0 %	25 %	25 %	50 %	383499269
30	NC_017056	TAAG	2	8	15223	15230	50 %	25 %	25 %	0 %	383499270
31	NC_017056	AATA	2	8	15653	15660	75 %	25 %	0 %	0 %	383499270
32	NC_017056	GTAA	2	8	15801	15808	50 %	25 %	25 %	0 %	383499270
33	NC_017056	AGCA	2	8	16083	16090	50 %	0 %	25 %	25 %	383499271
34	NC_017056	AATT	2	8	16696	16703	50 %	50 %	0 %	0 %	383499271
35	NC_017056	AAAG	2	8	17166	17173	75 %	0 %	25 %	0 %	383499271
36	NC_017056	ATTC	2	8	17259	17266	25 %	50 %	0 %	25 %	383499271
37	NC_017056	TTCA	2	8	18311	18318	25 %	50 %	0 %	25 %	383499272
38	NC_017056	TAAA	2	8	18950	18957	75 %	25 %	0 %	0 %	383499272
39	NC_017056	TGAT	2	8	21843	21850	25 %	50 %	25 %	0 %	383499275
40	NC_017056	ATAC	2	8	22469	22476	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
41	NC_017056	AACT	2	8	22657	22664	50 %	25 %	0 %	25 %	383499277
42	NC_017056	AAAT	2	8	22891	22898	75 %	25 %	0 %	0 %	383499277
43	NC_017056	CACT	2	8	22987	22994	25 %	25 %	0 %	50 %	383499277
44	NC_017056	AAGT	2	8	23040	23047	50 %	25 %	25 %	0 %	383499277
45	NC_017056	ATTA	2	8	23422	23429	50 %	50 %	0 %	0 %	383499278
46	NC_017056	ATTT	2	8	23481	23488	25 %	75 %	0 %	0 %	383499279
47	NC_017056	TATT	2	8	23728	23735	25 %	75 %	0 %	0 %	383499279
48	NC_017056	AAAT	2	8	25629	25636	75 %	25 %	0 %	0 %	383499281
49	NC_017056	TTAA	2	8	27105	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	383499282
50	NC_017056	TAGT	2	8	27268	27275	25 %	50 %	25 %	0 %	383499282
51	NC_017056	ATTT	2	8	27287	27294	25 %	75 %	0 %	0 %	383499282
52	NC_017056	TTGC	2	8	27562	27569	0 %	50 %	25 %	25 %	383499282
53	NC_017056	ATTT	2	8	27712	27719	25 %	75 %	0 %	0 %	383499282
54	NC_017056	TTCC	2	8	27802	27809	0 %	50 %	0 %	50 %	383499282
55	NC_017056	GCTT	2	8	27940	27947	0 %	50 %	25 %	25 %	383499282
56	NC_017056	ATTT	2	8	32850	32857	25 %	75 %	0 %	0 %	383499284
57	NC_017056	ATTT	2	8	33290	33297	25 %	75 %	0 %	0 %	383499285
58	NC_017056	AAAT	2	8	33314	33321	75 %	25 %	0 %	0 %	383499285
59	NC_017056	ATAA	2	8	33790	33797	75 %	25 %	0 %	0 %	383499285
60	NC_017056	AGCA	2	8	34278	34285	50 %	0 %	25 %	25 %	383499286
61	NC_017056	TTTC	2	8	34946	34953	0 %	75 %	0 %	25 %	383499287
62	NC_017056	ATTT	2	8	35811	35818	25 %	75 %	0 %	0 %	383499287
63	NC_017056	TTGA	2	8	36653	36660	25 %	50 %	25 %	0 %	383499288
64	NC_017056	AGTA	2	8	36772	36779	50 %	25 %	25 %	0 %	383499288
65	NC_017056	TACT	2	8	37122	37129	25 %	50 %	0 %	25 %	383499288
66	NC_017056	TAAA	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	383499289
67	NC_017056	GAGT	2	8	39879	39886	25 %	25 %	50 %	0 %	383499289
68	NC_017056	ATTA	2	8	42004	42011	50 %	50 %	0 %	0 %	383499290
69	NC_017056	ACTT	2	8	42952	42959	25 %	50 %	0 %	25 %	383499291
70	NC_017056	AATA	2	8	43441	43448	75 %	25 %	0 %	0 %	383499291
71	NC_017056	TAAA	2	8	43497	43504	75 %	25 %	0 %	0 %	383499291
72	NC_017056	AAAC	2	8	43794	43801	75 %	0 %	0 %	25 %	383499291
73	NC_017056	ATTT	3	12	43809	43820	25 %	75 %	0 %	0 %	383499291
74	NC_017056	TTTA	2	8	43996	44003	25 %	75 %	0 %	0 %	383499291
75	NC_017056	AGAA	2	8	45032	45039	75 %	0 %	25 %	0 %	383499292
76	NC_017056	AAAG	2	8	45412	45419	75 %	0 %	25 %	0 %	383499293
77	NC_017056	TAAA	2	8	45479	45486	75 %	25 %	0 %	0 %	383499293
78	NC_017056	AAGA	2	8	46457	46464	75 %	0 %	25 %	0 %	383499295
79	NC_017056	TAAT	2	8	46964	46971	50 %	50 %	0 %	0 %	383499295
80	NC_017056	ATTA	2	8	47040	47047	50 %	50 %	0 %	0 %	383499295
81	NC_017056	TTAT	2	8	47235	47242	25 %	75 %	0 %	0 %	383499295
82	NC_017056	GAAT	2	8	47812	47819	50 %	25 %	25 %	0 %	383499296
83	NC_017056	CTTA	2	8	48086	48093	25 %	50 %	0 %	25 %	383499296
84	NC_017056	ATGG	2	8	48366	48373	25 %	25 %	50 %	0 %	383499296
85	NC_017056	TATG	2	8	49094	49101	25 %	50 %	25 %	0 %	383499296
86	NC_017056	GCTA	2	8	51865	51872	25 %	25 %	25 %	25 %	383499298
87	NC_017056	AATT	2	8	51961	51968	50 %	50 %	0 %	0 %	383499298
88	NC_017056	CGAC	2	8	51984	51991	25 %	0 %	25 %	50 %	383499298
89	NC_017056	AAAT	2	8	52058	52065	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
90	NC_017056	ATAA	2	8	52421	52428	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
91	NC_017056	ATAA	2	8	52750	52757	75 %	25 %	0 %	0 %	383499299
92	NC_017056	TGTT	2	8	53029	53036	0 %	75 %	25 %	0 %	383499300
93	NC_017056	TTAA	2	8	53067	53074	50 %	50 %	0 %	0 %	383499300
94	NC_017056	TTAT	2	8	53165	53172	25 %	75 %	0 %	0 %	383499300
95	NC_017056	AACT	2	8	53554	53561	50 %	25 %	0 %	25 %	383499300
96	NC_017056	TAAT	2	8	54305	54312	50 %	50 %	0 %	0 %	383499301
97	NC_017056	TTGG	2	8	54350	54357	0 %	50 %	50 %	0 %	383499301
98	NC_017056	TAAA	2	8	54428	54435	75 %	25 %	0 %	0 %	383499301
99	NC_017056	TAGT	2	8	54671	54678	25 %	50 %	25 %	0 %	383499301
100	NC_017056	ATTT	2	8	54761	54768	25 %	75 %	0 %	0 %	383499301
101	NC_017056	TAAG	2	8	55028	55035	50 %	25 %	25 %	0 %	383499301
102	NC_017056	TGTA	2	8	55631	55638	25 %	50 %	25 %	0 %	383499301
103	NC_017056	ATCT	2	8	55682	55689	25 %	50 %	0 %	25 %	383499301
104	NC_017056	TTAT	2	8	55873	55880	25 %	75 %	0 %	0 %	383499301
105	NC_017056	TAAT	2	8	55968	55975	50 %	50 %	0 %	0 %	383499301
106	NC_017056	TAGT	2	8	56284	56291	25 %	50 %	25 %	0 %	383499302
107	NC_017056	ATAG	2	8	57259	57266	50 %	25 %	25 %	0 %	383499304
108	NC_017056	TCTT	2	8	57475	57482	0 %	75 %	0 %	25 %	383499304
109	NC_017056	TATT	2	8	58683	58690	25 %	75 %	0 %	0 %	383499305
110	NC_017056	AAGA	2	8	59344	59351	75 %	0 %	25 %	0 %	383499306
111	NC_017056	GATG	2	8	60018	60025	25 %	25 %	50 %	0 %	383499306
112	NC_017056	TAAA	2	8	60759	60766	75 %	25 %	0 %	0 %	383499306
113	NC_017056	TAAA	2	8	60783	60790	75 %	25 %	0 %	0 %	383499306
114	NC_017056	TTGG	2	8	61059	61066	0 %	50 %	50 %	0 %	383499307
115	NC_017056	TCAA	2	8	61252	61259	50 %	25 %	0 %	25 %	383499307
116	NC_017056	CTCA	2	8	61286	61293	25 %	25 %	0 %	50 %	383499307
117	NC_017056	TGTT	2	8	61612	61619	0 %	75 %	25 %	0 %	383499307
118	NC_017056	TGTT	2	8	61629	61636	0 %	75 %	25 %	0 %	383499307
119	NC_017056	TATG	2	8	61821	61828	25 %	50 %	25 %	0 %	383499307
120	NC_017056	TGCC	2	8	63252	63259	0 %	25 %	25 %	50 %	383499309
121	NC_017056	AAAT	2	8	63795	63802	75 %	25 %	0 %	0 %	383499309
122	NC_017056	TGAT	2	8	63978	63985	25 %	50 %	25 %	0 %	383499309
123	NC_017056	ATTT	2	8	64407	64414	25 %	75 %	0 %	0 %	383499309
124	NC_017056	ATTT	2	8	64577	64584	25 %	75 %	0 %	0 %	383499309
125	NC_017056	AAGT	2	8	64837	64844	50 %	25 %	25 %	0 %	383499310
126	NC_017056	TAAT	2	8	64918	64925	50 %	50 %	0 %	0 %	383499310
127	NC_017056	TGGT	2	8	66985	66992	0 %	50 %	50 %	0 %	383499313
128	NC_017056	AAAC	2	8	67030	67037	75 %	0 %	0 %	25 %	383499313
129	NC_017056	ATGG	2	8	67372	67379	25 %	25 %	50 %	0 %	383499313
130	NC_017056	TGCT	2	8	67408	67415	0 %	50 %	25 %	25 %	383499313
131	NC_017056	ATCA	2	8	68140	68147	50 %	25 %	0 %	25 %	383499313
132	NC_017056	TAGA	2	8	68476	68483	50 %	25 %	25 %	0 %	383499313
133	NC_017056	AAAT	2	8	68787	68794	75 %	25 %	0 %	0 %	383499314
134	NC_017056	TTTA	2	8	68796	68803	25 %	75 %	0 %	0 %	383499314
135	NC_017056	ATTT	2	8	69125	69132	25 %	75 %	0 %	0 %	383499315
136	NC_017056	TGCT	2	8	71926	71933	0 %	50 %	25 %	25 %	383499317
137	NC_017056	AATG	2	8	72252	72259	50 %	25 %	25 %	0 %	383499317
138	NC_017056	TTAT	2	8	72646	72653	25 %	75 %	0 %	0 %	383499317
139	NC_017056	GAAA	2	8	72707	72714	75 %	0 %	25 %	0 %	383499317
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