MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP plasmid pMCC_1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017055	TATG	2	8	2330	2337	25 %	50 %	25 %	0 %	381356296
2	NC_017055	TTAT	2	8	2356	2363	25 %	75 %	0 %	0 %	381356296
3	NC_017055	AAAT	2	8	2891	2898	75 %	25 %	0 %	0 %	381356296
4	NC_017055	AACT	2	8	3800	3807	50 %	25 %	0 %	25 %	381356296
5	NC_017055	GATA	2	8	4004	4011	50 %	25 %	25 %	0 %	381356296
6	NC_017055	TATT	2	8	4085	4092	25 %	75 %	0 %	0 %	381356296
7	NC_017055	TGTA	2	8	4311	4318	25 %	50 %	25 %	0 %	381356296
8	NC_017055	TGAT	2	8	4320	4327	25 %	50 %	25 %	0 %	381356296
9	NC_017055	CATT	2	8	4417	4424	25 %	50 %	0 %	25 %	381356296
10	NC_017055	AAAC	2	8	4675	4682	75 %	0 %	0 %	25 %	381356296
11	NC_017055	TAAA	2	8	4724	4731	75 %	25 %	0 %	0 %	381356296
12	NC_017055	AGTT	2	8	6531	6538	25 %	50 %	25 %	0 %	381356298
13	NC_017055	TAGA	2	8	6692	6699	50 %	25 %	25 %	0 %	381356298
14	NC_017055	ATGG	2	8	6874	6881	25 %	25 %	50 %	0 %	381356298
15	NC_017055	TTTA	2	8	7469	7476	25 %	75 %	0 %	0 %	381356299
16	NC_017055	TAGC	2	8	7495	7502	25 %	25 %	25 %	25 %	381356299
17	NC_017055	TCTT	2	8	7862	7869	0 %	75 %	0 %	25 %	381356299
18	NC_017055	GCTC	2	8	8194	8201	0 %	25 %	25 %	50 %	381356299
19	NC_017055	TTTA	2	8	9565	9572	25 %	75 %	0 %	0 %	381356302
20	NC_017055	TGAT	2	8	9576	9583	25 %	50 %	25 %	0 %	381356302
21	NC_017055	TTCA	2	8	9669	9676	25 %	50 %	0 %	25 %	381356302
22	NC_017055	TATT	2	8	10626	10633	25 %	75 %	0 %	0 %	381356303
23	NC_017055	ATAC	2	8	10634	10641	50 %	25 %	0 %	25 %	381356303
24	NC_017055	TCAT	2	8	11388	11395	25 %	50 %	0 %	25 %	381356303
25	NC_017055	ATTA	2	8	11630	11637	50 %	50 %	0 %	0 %	381356304
26	NC_017055	TTAT	2	8	12367	12374	25 %	75 %	0 %	0 %	381356305
27	NC_017055	GTAG	2	8	12724	12731	25 %	25 %	50 %	0 %	381356305
28	NC_017055	CCTC	2	8	13078	13085	0 %	25 %	0 %	75 %	381356306
29	NC_017055	ATTA	2	8	13486	13493	50 %	50 %	0 %	0 %	381356307
30	NC_017055	CTTC	2	8	13517	13524	0 %	50 %	0 %	50 %	381356307
31	NC_017055	CTTT	2	8	13754	13761	0 %	75 %	0 %	25 %	381356307
32	NC_017055	AAGA	2	8	13898	13905	75 %	0 %	25 %	0 %	381356307
33	NC_017055	TAAA	2	8	14272	14279	75 %	25 %	0 %	0 %	381356308

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.