MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP plasmid pMCC_1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017055	AT	3	6	345	350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017055	TA	3	6	495	500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017055	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017055	AT	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017055	AT	3	6	798	803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017055	TA	3	6	921	926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017055	GA	3	6	1378	1383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017055	AG	3	6	1698	1703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017055	AG	3	6	1929	1934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017055	TA	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
11	NC_017055	AG	3	6	3720	3725	50 %	0 %	50 %	0 %	381356296
12	NC_017055	TA	3	6	3912	3917	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
13	NC_017055	TA	3	6	4010	4015	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
14	NC_017055	AT	3	6	4060	4065	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
15	NC_017055	AT	4	8	4737	4744	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
16	NC_017055	AT	3	6	4784	4789	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
17	NC_017055	AT	3	6	5055	5060	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
18	NC_017055	TC	3	6	5229	5234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017055	TG	3	6	5479	5484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017055	TA	3	6	5588	5593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017055	CT	3	6	5633	5638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017055	TA	3	6	5657	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	381356297
23	NC_017055	GT	3	6	5813	5818	0 %	50 %	50 %	0 %	381356297
24	NC_017055	AT	3	6	6016	6021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017055	TA	3	6	6105	6110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017055	AT	3	6	6132	6137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017055	TA	3	6	6466	6471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017055	AT	3	6	6671	6676	50 %	50 %	0 %	0 %	381356298
29	NC_017055	AG	4	8	6897	6904	50 %	0 %	50 %	0 %	381356298
30	NC_017055	TA	3	6	7091	7096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017055	AT	3	6	7425	7430	50 %	50 %	0 %	0 %	381356299
32	NC_017055	AT	3	6	8454	8459	50 %	50 %	0 %	0 %	381356300
33	NC_017055	AG	3	6	9117	9122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017055	AT	3	6	9413	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	381356301
35	NC_017055	AG	3	6	9593	9598	50 %	0 %	50 %	0 %	381356302
36	NC_017055	AT	3	6	9701	9706	50 %	50 %	0 %	0 %	381356302
37	NC_017055	CT	3	6	9855	9860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017055	TA	3	6	10017	10022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017055	TA	3	6	10109	10114	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
40	NC_017055	AT	3	6	10529	10534	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
41	NC_017055	AT	3	6	10896	10901	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
42	NC_017055	TC	3	6	11401	11406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017055	CA	3	6	11529	11534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017055	AT	3	6	12303	12308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017055	GT	3	6	12312	12317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017055	CT	3	6	12655	12660	0 %	50 %	0 %	50 %	381356305
47	NC_017055	TA	3	6	12700	12705	50 %	50 %	0 %	0 %	381356305
48	NC_017055	AT	4	8	13021	13028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017055	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	381356306
50	NC_017055	CT	3	6	13392	13397	0 %	50 %	0 %	50 %	381356307
51	NC_017055	AT	3	6	13575	13580	50 %	50 %	0 %	0 %	381356307
52	NC_017055	AT	3	6	13648	13653	50 %	50 %	0 %	0 %	381356307
53	NC_017055	AT	3	6	13949	13954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017055	AT	4	8	14001	14008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017055	AT	3	6	14404	14409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017055	AT	3	6	14568	14573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017055	CT	3	6	14671	14676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.