MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP plasmid pMCC_1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017055	TA	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
2	NC_017055	AG	3	6	3720	3725	50 %	0 %	50 %	0 %	381356296
3	NC_017055	TA	3	6	3912	3917	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
4	NC_017055	TA	3	6	4010	4015	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
5	NC_017055	AT	3	6	4060	4065	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
6	NC_017055	AT	4	8	4737	4744	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
7	NC_017055	AT	3	6	4784	4789	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
8	NC_017055	AT	3	6	5055	5060	50 %	50 %	0 %	0 %	381356296
9	NC_017055	TA	3	6	5657	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	381356297
10	NC_017055	GT	3	6	5813	5818	0 %	50 %	50 %	0 %	381356297
11	NC_017055	AT	3	6	6671	6676	50 %	50 %	0 %	0 %	381356298
12	NC_017055	AG	4	8	6897	6904	50 %	0 %	50 %	0 %	381356298
13	NC_017055	AT	3	6	7425	7430	50 %	50 %	0 %	0 %	381356299
14	NC_017055	AT	3	6	8454	8459	50 %	50 %	0 %	0 %	381356300
15	NC_017055	AT	3	6	9413	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	381356301
16	NC_017055	AG	3	6	9593	9598	50 %	0 %	50 %	0 %	381356302
17	NC_017055	AT	3	6	9701	9706	50 %	50 %	0 %	0 %	381356302
18	NC_017055	TA	3	6	10109	10114	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
19	NC_017055	AT	3	6	10529	10534	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
20	NC_017055	AT	3	6	10896	10901	50 %	50 %	0 %	0 %	381356303
21	NC_017055	CT	3	6	12655	12660	0 %	50 %	0 %	50 %	381356305
22	NC_017055	TA	3	6	12700	12705	50 %	50 %	0 %	0 %	381356305
23	NC_017055	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	381356306
24	NC_017055	CT	3	6	13392	13397	0 %	50 %	0 %	50 %	381356307
25	NC_017055	AT	3	6	13575	13580	50 %	50 %	0 %	0 %	381356307
26	NC_017055	AT	3	6	13648	13653	50 %	50 %	0 %	0 %	381356307

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.