MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	AATCCG	2	12	1864	1875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383499155
2	NC_017054	CGTGGT	2	12	3589	3600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017054	CTGACA	2	12	4107	4118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383499157
4	NC_017054	ACATCC	2	12	4419	4430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383499157
5	NC_017054	ACCGGC	2	12	5101	5112	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383499158
6	NC_017054	ACCACG	2	12	5707	5718	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383499159
7	NC_017054	TCCCCG	2	12	5910	5921	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383499159
8	NC_017054	CCGCTC	2	12	6036	6047	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383499159
9	NC_017054	TTGGTA	2	12	9206	9217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383499163
10	NC_017054	CACCGT	2	12	10195	10206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383499165
11	NC_017054	TATCCA	2	12	17277	17288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499170
12	NC_017054	TTGTCC	2	12	17540	17551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017054	TCTGTT	2	12	18264	18275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017054	TAATTT	2	12	19388	19399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017054	ACAGTG	2	12	20009	20020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383499172
16	NC_017054	GACAGC	2	12	20021	20032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499172
17	NC_017054	AGCCTG	2	12	22443	22454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383499176
18	NC_017054	CCCTGT	2	12	22984	22995	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017054	GGCGCA	2	12	24283	24294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383499179
20	NC_017054	TTTAGA	2	12	27779	27790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017054	ATTTTG	2	12	28711	28722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383499185
22	NC_017054	GGCGGT	2	12	28755	28766	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383499185
23	NC_017054	CAGCGC	2	12	29699	29710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383499185
24	NC_017054	ATTCAT	2	12	30804	30815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383499186
25	NC_017054	AATCTG	2	12	31269	31280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017054	ATGCTG	2	12	32927	32938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383499189
27	NC_017054	CTTACC	2	12	34387	34398	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383499190
28	NC_017054	TCGGAC	2	12	37407	37418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017054	CGCTGG	2	12	40002	40013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499196
30	NC_017054	TTTTTC	2	12	43288	43299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383499199
31	NC_017054	CAAAAT	2	12	43636	43647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017054	CTGGCG	2	12	50737	50748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499209
33	NC_017054	AGGACG	2	12	51361	51372	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383499210
34	NC_017054	CCTGTT	7	42	53608	53649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017054	GGCGCT	2	12	55766	55777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499216
36	NC_017054	CAGGTG	2	12	55797	55808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383499216
37	NC_017054	ACTCCA	2	12	60563	60574	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017054	AAAATT	2	12	60624	60635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017054	TTCATA	2	12	62517	62528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017054	TTTTAT	2	12	63313	63324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383499224
41	NC_017054	GCTGCC	2	12	64625	64636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383499226
42	NC_017054	GTGCCG	2	12	65114	65125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499226
43	NC_017054	CAGTGG	2	12	68399	68410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383499232
44	NC_017054	TTAAGG	2	12	68494	68505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499232
45	NC_017054	ACAGTT	2	12	80533	80544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383499246
46	NC_017054	ATGAAA	2	12	83134	83145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383499248
47	NC_017054	TAACTC	2	12	83532	83543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499248
48	NC_017054	ACAGCC	2	12	86110	86121	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383499249
49	NC_017054	AGCGGG	2	12	88450	88461	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383499252
50	NC_017054	ATGTGG	2	12	89872	89883	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383499252
51	NC_017054	ACGATG	2	12	92394	92405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383499254
52	NC_017054	GTGCTG	2	12	92871	92882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383499254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.