MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	AATCCG	2	12	1864	1875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383499155
2	NC_017054	CTGACA	2	12	4107	4118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383499157
3	NC_017054	ACATCC	2	12	4419	4430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383499157
4	NC_017054	ACCGGC	2	12	5101	5112	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383499158
5	NC_017054	ACCACG	2	12	5707	5718	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383499159
6	NC_017054	TCCCCG	2	12	5910	5921	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383499159
7	NC_017054	CCGCTC	2	12	6036	6047	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383499159
8	NC_017054	TTGGTA	2	12	9206	9217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383499163
9	NC_017054	CACCGT	2	12	10195	10206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383499165
10	NC_017054	TATCCA	2	12	17277	17288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499170
11	NC_017054	ACAGTG	2	12	20009	20020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383499172
12	NC_017054	GACAGC	2	12	20021	20032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499172
13	NC_017054	AGCCTG	2	12	22443	22454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383499176
14	NC_017054	GGCGCA	2	12	24283	24294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383499179
15	NC_017054	ATTTTG	2	12	28711	28722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383499185
16	NC_017054	GGCGGT	2	12	28755	28766	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383499185
17	NC_017054	CAGCGC	2	12	29699	29710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383499185
18	NC_017054	ATTCAT	2	12	30804	30815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383499186
19	NC_017054	ATGCTG	2	12	32927	32938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383499189
20	NC_017054	CTTACC	2	12	34387	34398	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383499190
21	NC_017054	CGCTGG	2	12	40002	40013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499196
22	NC_017054	TTTTTC	2	12	43288	43299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383499199
23	NC_017054	CTGGCG	2	12	50737	50748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499209
24	NC_017054	AGGACG	2	12	51361	51372	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383499210
25	NC_017054	GGCGCT	2	12	55766	55777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499216
26	NC_017054	CAGGTG	2	12	55797	55808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383499216
27	NC_017054	TTTTAT	2	12	63313	63324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383499224
28	NC_017054	GCTGCC	2	12	64625	64636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383499226
29	NC_017054	GTGCCG	2	12	65114	65125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499226
30	NC_017054	CAGTGG	2	12	68399	68410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383499232
31	NC_017054	TTAAGG	2	12	68494	68505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499232
32	NC_017054	ACAGTT	2	12	80533	80544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383499246
33	NC_017054	ATGAAA	2	12	83134	83145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383499248
34	NC_017054	TAACTC	2	12	83532	83543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499248
35	NC_017054	ACAGCC	2	12	86110	86121	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383499249
36	NC_017054	AGCGGG	2	12	88450	88461	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383499252
37	NC_017054	ATGTGG	2	12	89872	89883	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383499252
38	NC_017054	ACGATG	2	12	92394	92405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383499254
39	NC_017054	GTGCTG	2	12	92871	92882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383499254

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.