MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	ACTGG	2	10	823	832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017054	TCGTC	2	10	1530	1539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017054	ACCAC	2	10	4750	4759	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017054	ATGTT	2	10	4819	4828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017054	GCTCC	2	10	4863	4872	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017054	GAATG	2	10	10010	10019	40 %	20 %	40 %	0 %	383499164
7	NC_017054	CCTTT	2	10	11734	11743	0 %	60 %	0 %	40 %	383499166
8	NC_017054	CTGTA	2	10	11854	11863	20 %	40 %	20 %	20 %	383499166
9	NC_017054	GGTCA	2	10	13870	13879	20 %	20 %	40 %	20 %	383499167
10	NC_017054	AATTT	2	10	14002	14011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017054	TGCAA	2	10	14805	14814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017054	GGCCC	2	10	15393	15402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017054	GCCGT	2	10	16213	16222	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017054	TGACA	2	10	16273	16282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017054	CTGGT	2	10	27322	27331	0 %	40 %	40 %	20 %	383499184
16	NC_017054	TGAGT	2	10	28094	28103	20 %	40 %	40 %	0 %	383499185
17	NC_017054	AGGTC	2	10	30194	30203	20 %	20 %	40 %	20 %	383499186
18	NC_017054	TGAAC	2	10	31534	31543	40 %	20 %	20 %	20 %	383499188
19	NC_017054	GTTGA	2	10	32501	32510	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017054	TTTAC	2	10	33017	33026	20 %	60 %	0 %	20 %	383499189
21	NC_017054	ACGGG	2	10	33494	33503	20 %	0 %	60 %	20 %	383499189
22	NC_017054	ATTTT	2	10	34814	34823	20 %	80 %	0 %	0 %	383499190
23	NC_017054	CGCAG	2	10	36015	36024	20 %	0 %	40 %	40 %	383499192
24	NC_017054	CTGTT	2	10	36939	36948	0 %	60 %	20 %	20 %	383499193
25	NC_017054	TCCGG	2	10	37092	37101	0 %	20 %	40 %	40 %	383499193
26	NC_017054	TAATG	2	10	37382	37391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017054	GTCTG	2	10	38624	38633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017054	CTGCC	2	10	39024	39033	0 %	20 %	20 %	60 %	383499195
29	NC_017054	TATAA	2	10	39531	39540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017054	GCACA	2	10	40163	40172	40 %	0 %	20 %	40 %	383499196
31	NC_017054	GGACG	2	10	41465	41474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017054	ACGGG	2	10	47962	47971	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017054	ACGGG	2	10	49139	49148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017054	GAACT	2	10	50362	50371	40 %	20 %	20 %	20 %	383499209
35	NC_017054	GGCCT	2	10	50664	50673	0 %	20 %	40 %	40 %	383499209
36	NC_017054	GAACC	2	10	51507	51516	40 %	0 %	20 %	40 %	383499210
37	NC_017054	GAACA	2	10	54179	54188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017054	GGCGC	2	10	56976	56985	0 %	0 %	60 %	40 %	383499216
39	NC_017054	GAACT	2	10	58513	58522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017054	CCCCG	2	10	58552	58561	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_017054	AAAAT	2	10	59457	59466	80 %	20 %	0 %	0 %	383499219
42	NC_017054	TAATT	2	10	60681	60690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017054	AATAA	2	10	60975	60984	80 %	20 %	0 %	0 %	383499221
44	NC_017054	TTGTG	2	10	61857	61866	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017054	ACGGT	2	10	62743	62752	20 %	20 %	40 %	20 %	383499222
46	NC_017054	ACATT	2	10	63751	63760	40 %	40 %	0 %	20 %	383499224
47	NC_017054	AAAAT	2	10	64411	64420	80 %	20 %	0 %	0 %	383499225
48	NC_017054	TCCGG	2	10	66194	66203	0 %	20 %	40 %	40 %	383499227
49	NC_017054	AGCGA	2	10	69461	69470	40 %	0 %	40 %	20 %	383499233
50	NC_017054	AAAAT	2	10	73461	73470	80 %	20 %	0 %	0 %	383499237
51	NC_017054	CTGAA	2	10	73600	73609	40 %	20 %	20 %	20 %	383499238
52	NC_017054	GCGCA	2	10	81536	81545	20 %	0 %	40 %	40 %	383499246
53	NC_017054	ATTTC	2	10	83950	83959	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017054	GACCT	2	10	85865	85874	20 %	20 %	20 %	40 %	383499249
55	NC_017054	GGCGC	2	10	88686	88695	0 %	0 %	60 %	40 %	383499252
56	NC_017054	GGCAG	2	10	88795	88804	20 %	0 %	60 %	20 %	383499252
57	NC_017054	CCGGA	2	10	88836	88845	20 %	0 %	40 %	40 %	383499252
58	NC_017054	CGAAA	2	10	90059	90068	60 %	0 %	20 %	20 %	383499252
59	NC_017054	GGGTT	2	10	91459	91468	0 %	40 %	60 %	0 %	383499253
60	NC_017054	GCCGT	2	10	91596	91605	0 %	20 %	40 %	40 %	383499253

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.