MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	CCGT	2	8	651	658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017054	TGGC	2	8	768	775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017054	AAGT	2	8	1180	1187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017054	AAAG	2	8	1404	1411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017054	AGTG	2	8	1540	1547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017054	TGGC	2	8	1578	1585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017054	TAAA	2	8	3006	3013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017054	GCCC	2	8	3056	3063	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017054	TCCC	2	8	4638	4645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017054	CCGG	2	8	4688	4695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017054	TAAA	2	8	8039	8046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017054	TGTT	2	8	8132	8139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017054	CTAA	2	8	8164	8171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017054	GCCT	2	8	8413	8420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017054	TAAA	2	8	13434	13441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017054	TGGC	2	8	14056	14063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017054	TTCC	2	8	14068	14075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017054	AAAC	2	8	14613	14620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017054	TGTT	2	8	14645	14652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017054	CAAA	2	8	14689	14696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017054	CATA	2	8	14754	14761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017054	CTTT	2	8	15317	15324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017054	TTGC	2	8	15329	15336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017054	TTCC	2	8	15780	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017054	GCAG	2	8	16012	16019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017054	TCAC	2	8	16286	16293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017054	ACAA	2	8	17516	17523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017054	CATC	2	8	18307	18314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017054	ATTT	2	8	18511	18518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017054	ACAG	2	8	18604	18611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017054	CAGT	2	8	18622	18629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017054	GGCA	2	8	22926	22933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017054	GCCT	2	8	23894	23901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017054	TATT	2	8	25590	25597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017054	GTAA	2	8	25674	25681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017054	CCCG	2	8	26085	26092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017054	ATGT	2	8	26570	26577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017054	GTAT	2	8	26627	26634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017054	TTTA	2	8	30921	30928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017054	CGAA	2	8	32669	32676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017054	AATC	2	8	36317	36324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017054	ATTT	2	8	36394	36401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017054	GTTT	2	8	38115	38122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017054	TGGT	2	8	38150	38157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017054	AATA	2	8	38261	38268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017054	ATTT	2	8	38758	38765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017054	TGTC	2	8	39310	39317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017054	CCCG	2	8	39403	39410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_017054	TTTG	2	8	39493	39500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017054	TTAG	2	8	39501	39508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017054	GTTT	2	8	39520	39527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017054	ATGA	2	8	41285	41292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017054	TGGC	2	8	41543	41550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017054	CTTT	2	8	43401	43408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017054	GCTT	2	8	43420	43427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017054	ATTT	2	8	43654	43661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017054	TGAA	2	8	49038	49045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017054	CCGG	2	8	49129	49136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017054	CGGG	2	8	50777	50784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017054	ATCA	2	8	50787	50794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017054	GAAA	2	8	51633	51640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017054	GCCG	2	8	51769	51776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017054	CATC	2	8	51832	51839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017054	TCCT	2	8	51892	51899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017054	TCAT	2	8	52559	52566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017054	ATTA	2	8	58856	58863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017054	TGCC	2	8	59073	59080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017054	CAGT	2	8	59938	59945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017054	TAAA	2	8	61343	61350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017054	AGAA	2	8	61528	61535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017054	TAAA	2	8	61554	61561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017054	ATTT	2	8	61875	61882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017054	GAAC	2	8	61954	61961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017054	ATTC	2	8	62112	62119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017054	TTAA	2	8	62198	62205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017054	GTCA	2	8	67309	67316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017054	GCCG	2	8	67333	67340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017054	CCTG	2	8	67358	67365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017054	TGAA	2	8	68181	68188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017054	TGGT	2	8	83110	83117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017054	CTGA	2	8	83897	83904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017054	GAAA	2	8	83934	83941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017054	AAAT	2	8	83975	83982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017054	GTTA	2	8	84179	84186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017054	AATT	2	8	84195	84202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017054	TCTT	2	8	84221	84228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.