MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	ACAT	2	8	1396	1403	50 %	25 %	0 %	25 %	383499154
2	NC_017054	GCAG	2	8	1809	1816	25 %	0 %	50 %	25 %	383499155
3	NC_017054	TGAC	2	8	1820	1827	25 %	25 %	25 %	25 %	383499155
4	NC_017054	CGTT	3	12	1979	1990	0 %	50 %	25 %	25 %	383499155
5	NC_017054	TACC	2	8	2214	2221	25 %	25 %	0 %	50 %	383499155
6	NC_017054	CCGA	2	8	2257	2264	25 %	0 %	25 %	50 %	383499155
7	NC_017054	GATG	2	8	2391	2398	25 %	25 %	50 %	0 %	383499155
8	NC_017054	AAAT	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	383499157
9	NC_017054	TCAC	2	8	4155	4162	25 %	25 %	0 %	50 %	383499157
10	NC_017054	ACGG	2	8	4342	4349	25 %	0 %	50 %	25 %	383499157
11	NC_017054	TCTG	2	8	4503	4510	0 %	50 %	25 %	25 %	383499157
12	NC_017054	CAGC	2	8	5397	5404	25 %	0 %	25 %	50 %	383499158
13	NC_017054	TACA	2	8	5736	5743	50 %	25 %	0 %	25 %	383499159
14	NC_017054	TCAC	2	8	5824	5831	25 %	25 %	0 %	50 %	383499159
15	NC_017054	GTGG	2	8	6021	6028	0 %	25 %	75 %	0 %	383499159
16	NC_017054	GCCG	2	8	6318	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	383499159
17	NC_017054	GCCG	2	8	6867	6874	0 %	0 %	50 %	50 %	383499160
18	NC_017054	GGGC	2	8	7056	7063	0 %	0 %	75 %	25 %	383499160
19	NC_017054	CAGC	2	8	7153	7160	25 %	0 %	25 %	50 %	383499160
20	NC_017054	TGAA	2	8	7510	7517	50 %	25 %	25 %	0 %	383499161
21	NC_017054	TGTC	2	8	8486	8493	0 %	50 %	25 %	25 %	383499163
22	NC_017054	ACTG	2	8	9130	9137	25 %	25 %	25 %	25 %	383499163
23	NC_017054	CAGT	2	8	9712	9719	25 %	25 %	25 %	25 %	383499164
24	NC_017054	CCAG	2	8	9742	9749	25 %	0 %	25 %	50 %	383499164
25	NC_017054	GGTT	2	8	9997	10004	0 %	50 %	50 %	0 %	383499164
26	NC_017054	TCAT	2	8	10265	10272	25 %	50 %	0 %	25 %	383499165
27	NC_017054	TGGT	2	8	10697	10704	0 %	50 %	50 %	0 %	383499165
28	NC_017054	TTCT	2	8	10721	10728	0 %	75 %	0 %	25 %	383499165
29	NC_017054	TCCG	2	8	11029	11036	0 %	25 %	25 %	50 %	383499166
30	NC_017054	CCCA	2	8	11588	11595	25 %	0 %	0 %	75 %	383499166
31	NC_017054	CGAC	2	8	12207	12214	25 %	0 %	25 %	50 %	383499166
32	NC_017054	CCGG	2	8	13080	13087	0 %	0 %	50 %	50 %	383499166
33	NC_017054	CTGA	2	8	14294	14301	25 %	25 %	25 %	25 %	383499168
34	NC_017054	GTGG	2	8	15449	15456	0 %	25 %	75 %	0 %	383499169
35	NC_017054	AGAT	2	8	15628	15635	50 %	25 %	25 %	0 %	383499169
36	NC_017054	TGGC	2	8	16635	16642	0 %	25 %	50 %	25 %	383499170
37	NC_017054	TGAC	2	8	17155	17162	25 %	25 %	25 %	25 %	383499170
38	NC_017054	GAAT	2	8	17243	17250	50 %	25 %	25 %	0 %	383499170
39	NC_017054	GCAG	2	8	21396	21403	25 %	0 %	50 %	25 %	383499175
40	NC_017054	GCGG	2	8	21669	21676	0 %	0 %	75 %	25 %	383499175
41	NC_017054	CAGC	2	8	21714	21721	25 %	0 %	25 %	50 %	383499175
42	NC_017054	ACCG	2	8	21856	21863	25 %	0 %	25 %	50 %	383499175
43	NC_017054	GCTG	2	8	22273	22280	0 %	25 %	50 %	25 %	383499176
44	NC_017054	GCCG	2	8	22410	22417	0 %	0 %	50 %	50 %	383499176
45	NC_017054	TCCG	2	8	22471	22478	0 %	25 %	25 %	50 %	383499176
46	NC_017054	CCCG	2	8	23209	23216	0 %	0 %	25 %	75 %	383499177
47	NC_017054	CCGG	2	8	23243	23250	0 %	0 %	50 %	50 %	383499177
48	NC_017054	GTGA	2	8	23259	23266	25 %	25 %	50 %	0 %	383499177
49	NC_017054	CCCG	2	8	23305	23312	0 %	0 %	25 %	75 %	383499177
50	NC_017054	GGCA	2	8	23344	23351	25 %	0 %	50 %	25 %	383499177
51	NC_017054	GGCA	2	8	23488	23495	25 %	0 %	50 %	25 %	383499178
52	NC_017054	CTGC	2	8	23644	23651	0 %	25 %	25 %	50 %	383499178
53	NC_017054	GCGA	2	8	23754	23761	25 %	0 %	50 %	25 %	383499178
54	NC_017054	GCCA	2	8	24527	24534	25 %	0 %	25 %	50 %	383499179
55	NC_017054	CAGC	2	8	25026	25033	25 %	0 %	25 %	50 %	383499180
56	NC_017054	CTGA	2	8	25087	25094	25 %	25 %	25 %	25 %	383499180
57	NC_017054	GATG	2	8	25804	25811	25 %	25 %	50 %	0 %	383499182
58	NC_017054	CAGA	2	8	26026	26033	50 %	0 %	25 %	25 %	383499182
59	NC_017054	TACT	2	8	27082	27089	25 %	50 %	0 %	25 %	383499184
60	NC_017054	GGCG	2	8	28999	29006	0 %	0 %	75 %	25 %	383499185
61	NC_017054	CCCA	2	8	29415	29422	25 %	0 %	0 %	75 %	383499185
62	NC_017054	TCCG	2	8	29567	29574	0 %	25 %	25 %	50 %	383499185
63	NC_017054	CTGA	2	8	29776	29783	25 %	25 %	25 %	25 %	383499185
64	NC_017054	TCGG	2	8	30226	30233	0 %	25 %	50 %	25 %	383499186
65	NC_017054	ATTC	2	8	31075	31082	25 %	50 %	0 %	25 %	383499187
66	NC_017054	AGAA	2	8	31694	31701	75 %	0 %	25 %	0 %	383499188
67	NC_017054	AATA	2	8	31711	31718	75 %	25 %	0 %	0 %	383499188
68	NC_017054	TGGC	2	8	33136	33143	0 %	25 %	50 %	25 %	383499189
69	NC_017054	AGGC	2	8	33236	33243	25 %	0 %	50 %	25 %	383499189
70	NC_017054	ATTT	2	8	33537	33544	25 %	75 %	0 %	0 %	383499189
71	NC_017054	TACA	2	8	33571	33578	50 %	25 %	0 %	25 %	383499189
72	NC_017054	GGCG	2	8	33579	33586	0 %	0 %	75 %	25 %	383499189
73	NC_017054	GCTG	2	8	33645	33652	0 %	25 %	50 %	25 %	383499189
74	NC_017054	GACC	2	8	34065	34072	25 %	0 %	25 %	50 %	383499190
75	NC_017054	TTGT	2	8	34702	34709	0 %	75 %	25 %	0 %	383499190
76	NC_017054	TCAG	2	8	35094	35101	25 %	25 %	25 %	25 %	383499191
77	NC_017054	GCCA	2	8	35646	35653	25 %	0 %	25 %	50 %	383499192
78	NC_017054	TGCC	2	8	35851	35858	0 %	25 %	25 %	50 %	383499192
79	NC_017054	GGCG	2	8	36722	36729	0 %	0 %	75 %	25 %	383499193
80	NC_017054	TTCC	2	8	36796	36803	0 %	50 %	0 %	50 %	383499193
81	NC_017054	ATAC	2	8	37466	37473	50 %	25 %	0 %	25 %	383499194
82	NC_017054	GACA	2	8	38090	38097	50 %	0 %	25 %	25 %	383499194
83	NC_017054	TCTG	2	8	38839	38846	0 %	50 %	25 %	25 %	383499195
84	NC_017054	CTGC	2	8	38914	38921	0 %	25 %	25 %	50 %	383499195
85	NC_017054	GGTG	2	8	39667	39674	0 %	25 %	75 %	0 %	383499196
86	NC_017054	GAAA	2	8	40573	40580	75 %	0 %	25 %	0 %	383499196
87	NC_017054	AGCC	2	8	40774	40781	25 %	0 %	25 %	50 %	383499197
88	NC_017054	CAGA	2	8	40881	40888	50 %	0 %	25 %	25 %	383499197
89	NC_017054	GTCA	2	8	41168	41175	25 %	25 %	25 %	25 %	383499197
90	NC_017054	CAGG	2	8	41824	41831	25 %	0 %	50 %	25 %	383499198
91	NC_017054	GCTG	2	8	41877	41884	0 %	25 %	50 %	25 %	383499198
92	NC_017054	CCGG	2	8	42123	42130	0 %	0 %	50 %	50 %	383499198
93	NC_017054	TGGC	2	8	42283	42290	0 %	25 %	50 %	25 %	383499198
94	NC_017054	TCAG	2	8	42388	42395	25 %	25 %	25 %	25 %	383499199
95	NC_017054	GCCT	2	8	42639	42646	0 %	25 %	25 %	50 %	383499199
96	NC_017054	CCAG	2	8	42887	42894	25 %	0 %	25 %	50 %	383499199
97	NC_017054	TGTA	2	8	44051	44058	25 %	50 %	25 %	0 %	383499200
98	NC_017054	AGCC	2	8	44579	44586	25 %	0 %	25 %	50 %	383499200
99	NC_017054	TCGA	2	8	44604	44611	25 %	25 %	25 %	25 %	383499200
100	NC_017054	TGAC	2	8	44985	44992	25 %	25 %	25 %	25 %	383499201
101	NC_017054	TCAA	2	8	45402	45409	50 %	25 %	0 %	25 %	383499201
102	NC_017054	GTCT	2	8	45601	45608	0 %	50 %	25 %	25 %	383499201
103	NC_017054	GCCT	2	8	46217	46224	0 %	25 %	25 %	50 %	383499202
104	NC_017054	CTGC	2	8	46450	46457	0 %	25 %	25 %	50 %	383499202
105	NC_017054	CGTT	2	8	46732	46739	0 %	50 %	25 %	25 %	383499203
106	NC_017054	GGTC	2	8	46825	46832	0 %	25 %	50 %	25 %	383499203
107	NC_017054	GAAC	2	8	46865	46872	50 %	0 %	25 %	25 %	383499203
108	NC_017054	TTTC	2	8	47480	47487	0 %	75 %	0 %	25 %	383499204
109	NC_017054	CTGG	2	8	48497	48504	0 %	25 %	50 %	25 %	383499205
110	NC_017054	GACC	2	8	49458	49465	25 %	0 %	25 %	50 %	383499207
111	NC_017054	CGGG	2	8	50634	50641	0 %	0 %	75 %	25 %	383499209
112	NC_017054	GGCT	2	8	50937	50944	0 %	25 %	50 %	25 %	383499210
113	NC_017054	GCTG	2	8	52181	52188	0 %	25 %	50 %	25 %	383499211
114	NC_017054	TCGC	2	8	52374	52381	0 %	25 %	25 %	50 %	383499211
115	NC_017054	AAAG	2	8	53340	53347	75 %	0 %	25 %	0 %	383499213
116	NC_017054	GGTC	2	8	54312	54319	0 %	25 %	50 %	25 %	383499214
117	NC_017054	CAGG	2	8	54408	54415	25 %	0 %	50 %	25 %	383499214
118	NC_017054	CAGC	2	8	54630	54637	25 %	0 %	25 %	50 %	383499214
119	NC_017054	GACA	2	8	54855	54862	50 %	0 %	25 %	25 %	383499215
120	NC_017054	CCTG	2	8	54885	54892	0 %	25 %	25 %	50 %	383499215
121	NC_017054	CCCT	2	8	55411	55418	0 %	25 %	0 %	75 %	383499216
122	NC_017054	GGCT	2	8	55705	55712	0 %	25 %	50 %	25 %	383499216
123	NC_017054	GCTG	2	8	55730	55737	0 %	25 %	50 %	25 %	383499216
124	NC_017054	GTGG	2	8	56033	56040	0 %	25 %	75 %	0 %	383499216
125	NC_017054	CGCT	2	8	56869	56876	0 %	25 %	25 %	50 %	383499216
126	NC_017054	AGCC	2	8	57666	57673	25 %	0 %	25 %	50 %	383499218
127	NC_017054	GCCC	2	8	57736	57743	0 %	0 %	25 %	75 %	383499218
128	NC_017054	ACTG	2	8	59434	59441	25 %	25 %	25 %	25 %	383499219
129	NC_017054	AATA	2	8	59481	59488	75 %	25 %	0 %	0 %	383499219
130	NC_017054	CAGG	2	8	60249	60256	25 %	0 %	50 %	25 %	383499220
131	NC_017054	TTCC	2	8	60390	60397	0 %	50 %	0 %	50 %	383499220
132	NC_017054	ACAG	2	8	60499	60506	50 %	0 %	25 %	25 %	383499220
133	NC_017054	CAGA	2	8	61122	61129	50 %	0 %	25 %	25 %	383499221
134	NC_017054	ACCA	2	8	62984	62991	50 %	0 %	0 %	50 %	383499223
135	NC_017054	AATT	2	8	63021	63028	50 %	50 %	0 %	0 %	383499223
136	NC_017054	CTGG	2	8	63790	63797	0 %	25 %	50 %	25 %	383499224
137	NC_017054	TCCG	2	8	64134	64141	0 %	25 %	25 %	50 %	383499225
138	NC_017054	CTGC	2	8	64287	64294	0 %	25 %	25 %	50 %	383499225
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.