MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	AGTGTA	2	12	21882	21893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017053	ACTAAT	2	12	21910	21921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017053	TATTTT	2	12	58520	58531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017053	AGTGTA	2	12	78489	78500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017053	ACTAAT	2	12	78517	78528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017053	TTCGGG	2	12	79459	79470	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017053	ATAAAA	2	12	106605	106616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017053	GTAAAA	2	12	114180	114191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017053	AGATAA	2	12	121140	121151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017053	AGATAA	2	12	133964	133975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017053	CTTTAT	2	12	159658	159669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017053	CTCTTT	2	12	161522	161533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017053	TGACAC	2	12	188387	188398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017053	CAGTTC	2	12	193028	193039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017053	TTTAAA	2	12	194876	194887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017053	AGTGTA	2	12	267761	267772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017053	ACTAAT	2	12	267789	267800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017053	TTAAAA	2	12	288169	288180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017053	TTTAAT	2	12	305248	305259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017053	TTTTAG	2	12	316603	316614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017053	GGTTGA	2	12	320677	320688	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017053	GAAGTC	2	12	356239	356250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017053	ATTTAA	2	12	371685	371696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017053	AGAAAT	2	12	405703	405714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017053	ATTTTA	2	12	436992	437003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017053	GAGTAA	2	12	442781	442792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017053	TAAAAA	2	12	458643	458654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017053	AGGACT	2	12	463765	463776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017053	TAAAAA	2	12	483187	483198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017053	AAAAGA	2	12	483370	483381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017053	CCTTGT	2	12	560929	560940	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017053	TAAATA	2	12	674919	674930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017053	AGGTAA	2	12	685720	685731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017053	TTCGGG	2	12	721784	721795	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017053	GAAAAA	2	12	775583	775594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017053	GAAAAG	2	12	806741	806752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017053	TTAAAA	2	12	838175	838186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017053	TAACAA	2	12	890561	890572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017053	TTTAAA	2	12	952428	952439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017053	GACTTC	2	12	971289	971300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017053	GAAATC	2	12	971711	971722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017053	TTGTTT	2	12	990073	990084	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017053	ATATGA	2	12	1016589	1016600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017053	AGTCTT	2	12	1032633	1032644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017053	TCTTTT	2	12	1059776	1059787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017053	CCTTGG	2	12	1091781	1091792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017053	TGACTT	2	12	1159203	1159214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017053	ATGATA	2	12	1165710	1165721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017053	CTTAAG	2	12	1183409	1183420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017053	TCCTTC	2	12	1244714	1244725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017053	TATTAG	2	12	1250190	1250201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017053	TACACT	2	12	1250219	1250230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017053	GAAAAA	2	12	1255687	1255698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017053	CAATTC	2	12	1274775	1274786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017053	TATTTT	2	12	1275846	1275857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017053	AATACC	2	12	1284863	1284874	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017053	CAGAGC	2	12	1313452	1313463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017053	CAGAGC	2	12	1313728	1313739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017053	CTTTTC	2	12	1335251	1335262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017053	CTAGTC	2	12	1437533	1437544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017053	TTGCTT	2	12	1441288	1441299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017053	AATATT	2	12	1456142	1456153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017053	TATCAC	2	12	1466636	1466647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017053	TTAAAT	2	12	1467869	1467880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017053	TTGCTT	2	12	1475633	1475644	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017053	TAACAA	2	12	1489577	1489588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017053	TTTTTC	2	12	1491964	1491975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017053	AGAAAA	2	12	1494660	1494671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017053	TATTAG	2	12	1500979	1500990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017053	TACACT	2	12	1501008	1501019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017053	AATGAT	2	12	1514740	1514751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017053	AAATCA	2	12	1516026	1516037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017053	GTTAAA	2	12	1516132	1516143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017053	ATGTTT	2	12	1528529	1528540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017053	CCTTTA	2	12	1642858	1642869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017053	ATTTTA	2	12	1696046	1696057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017053	TTTTCA	2	12	1716728	1716739	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017053	TAAAAA	2	12	1728708	1728719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017053	AATTTA	3	18	1740141	1740158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017053	GAAAAA	2	12	1776572	1776583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.