MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 1380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383493134
2	NC_017053	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383493135
3	NC_017053	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383493136
4	NC_017053	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383493137
5	NC_017053	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383493138
6	NC_017053	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	383493143
7	NC_017053	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	383493143
8	NC_017053	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	383493146
9	NC_017053	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	383493146
10	NC_017053	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017053	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017053	GTTAA	2	10	19039	19048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017053	GGGAG	2	10	19558	19567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017053	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017053	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017053	TTCTT	2	10	23966	23975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017053	CTTTT	3	15	24072	24086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017053	TATAA	2	10	26503	26512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017053	AGTGA	2	10	27250	27259	40 %	20 %	40 %	0 %	383493149
20	NC_017053	ATTTT	2	10	27949	27958	20 %	80 %	0 %	0 %	383493150
21	NC_017053	TTGAT	2	10	28138	28147	20 %	60 %	20 %	0 %	383493150
22	NC_017053	TGGTG	2	10	30222	30231	0 %	40 %	60 %	0 %	383493153
23	NC_017053	AGCAG	2	10	37470	37479	40 %	0 %	40 %	20 %	383493157
24	NC_017053	GGTCA	2	10	37834	37843	20 %	20 %	40 %	20 %	383493157
25	NC_017053	TTGGG	2	10	38230	38239	0 %	40 %	60 %	0 %	383493158
26	NC_017053	GCAGG	2	10	42310	42319	20 %	0 %	60 %	20 %	383493160
27	NC_017053	CTGCC	2	10	43274	43283	0 %	20 %	20 %	60 %	383493162
28	NC_017053	CTCAG	2	10	43667	43676	20 %	20 %	20 %	40 %	383493162
29	NC_017053	GCTTT	2	10	51024	51033	0 %	60 %	20 %	20 %	383493169
30	NC_017053	TTTTC	2	10	51222	51231	0 %	80 %	0 %	20 %	383493169
31	NC_017053	AAACC	2	10	51287	51296	60 %	0 %	0 %	40 %	383493169
32	NC_017053	ATGGT	2	10	53061	53070	20 %	40 %	40 %	0 %	383493170
33	NC_017053	ATTCA	2	10	53745	53754	40 %	40 %	0 %	20 %	383493170
34	NC_017053	ATTTT	2	10	55010	55019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017053	AAATA	2	10	56277	56286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017053	TATAT	2	10	56362	56371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017053	TTTTA	2	10	57516	57525	20 %	80 %	0 %	0 %	383493172
38	NC_017053	AAAGC	2	10	57709	57718	60 %	0 %	20 %	20 %	383493172
39	NC_017053	TTTGG	2	10	61703	61712	0 %	60 %	40 %	0 %	383493179
40	NC_017053	TTCAC	2	10	62059	62068	20 %	40 %	0 %	40 %	383493180
41	NC_017053	GAAAT	2	10	63140	63149	60 %	20 %	20 %	0 %	383493182
42	NC_017053	AAGGA	2	10	64220	64229	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017053	TCCAA	2	10	68840	68849	40 %	20 %	0 %	40 %	383493194
44	NC_017053	GTTTC	2	10	71489	71498	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017053	TCGTG	2	10	74750	74759	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017053	GTTAA	2	10	75646	75655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017053	GGGAG	2	10	76165	76174	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017053	AGGGA	2	10	78376	78385	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017053	GCTTA	2	10	78742	78751	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017053	ATTAT	2	10	79032	79041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017053	TATAT	2	10	79115	79124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017053	CTTGG	2	10	83051	83060	0 %	40 %	40 %	20 %	383493206
53	NC_017053	TCTTA	2	10	83469	83478	20 %	60 %	0 %	20 %	383493206
54	NC_017053	CACTC	2	10	85014	85023	20 %	20 %	0 %	60 %	383493208
55	NC_017053	GATTG	2	10	87275	87284	20 %	40 %	40 %	0 %	383493209
56	NC_017053	TTGAT	2	10	97421	97430	20 %	60 %	20 %	0 %	383493214
57	NC_017053	AAATC	2	10	97589	97598	60 %	20 %	0 %	20 %	383493214
58	NC_017053	TGAAG	2	10	102905	102914	40 %	20 %	40 %	0 %	383493223
59	NC_017053	TAGTT	2	10	104617	104626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017053	TTTAG	2	10	104764	104773	20 %	60 %	20 %	0 %	383493226
61	NC_017053	GTGTT	2	10	109168	109177	0 %	60 %	40 %	0 %	383493232
62	NC_017053	TTAAG	2	10	109368	109377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017053	TAGGT	2	10	109991	110000	20 %	40 %	40 %	0 %	383493233
64	NC_017053	TAAAT	2	10	110124	110133	60 %	40 %	0 %	0 %	383493233
65	NC_017053	AAATC	2	10	111000	111009	60 %	20 %	0 %	20 %	383493234
66	NC_017053	GAGAG	2	10	111162	111171	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017053	GAAAA	2	10	117419	117428	80 %	0 %	20 %	0 %	383493239
68	NC_017053	GGGAA	2	10	121570	121579	40 %	0 %	60 %	0 %	383493243
69	NC_017053	GACCT	2	10	123025	123034	20 %	20 %	20 %	40 %	383493243
70	NC_017053	TCAGG	2	10	124330	124339	20 %	20 %	40 %	20 %	383493243
71	NC_017053	TTTTA	2	10	126212	126221	20 %	80 %	0 %	0 %	383493246
72	NC_017053	GCTTT	3	15	126788	126802	0 %	60 %	20 %	20 %	383493246
73	NC_017053	GTCAT	2	10	127107	127116	20 %	40 %	20 %	20 %	383493246
74	NC_017053	TAGTG	2	10	128050	128059	20 %	40 %	40 %	0 %	383493247
75	NC_017053	GTTAA	2	10	128453	128462	40 %	40 %	20 %	0 %	383493247
76	NC_017053	AATAA	2	10	128482	128491	80 %	20 %	0 %	0 %	383493247
77	NC_017053	TTGAT	2	10	129569	129578	20 %	60 %	20 %	0 %	383493248
78	NC_017053	TACCT	2	10	130972	130981	20 %	40 %	0 %	40 %	383493250
79	NC_017053	AATCA	2	10	131752	131761	60 %	20 %	0 %	20 %	383493251
80	NC_017053	TCATG	2	10	132359	132368	20 %	40 %	20 %	20 %	383493252
81	NC_017053	AACAA	2	10	133505	133514	80 %	0 %	0 %	20 %	383493253
82	NC_017053	TTGGC	2	10	133590	133599	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017053	CAAAA	2	10	134723	134732	80 %	0 %	0 %	20 %	383493255
84	NC_017053	GTCTT	2	10	134934	134943	0 %	60 %	20 %	20 %	383493255
85	NC_017053	TTTTA	2	10	135796	135805	20 %	80 %	0 %	0 %	383493255
86	NC_017053	AAAGC	2	10	136985	136994	60 %	0 %	20 %	20 %	383493257
87	NC_017053	AGTTC	2	10	137235	137244	20 %	40 %	20 %	20 %	383493257
88	NC_017053	GCTGA	2	10	137255	137264	20 %	20 %	40 %	20 %	383493257
89	NC_017053	ATCGC	2	10	140630	140639	20 %	20 %	20 %	40 %	383493260
90	NC_017053	TTGGG	2	10	142033	142042	0 %	40 %	60 %	0 %	383493261
91	NC_017053	GAAAA	2	10	147343	147352	80 %	0 %	20 %	0 %	383493266
92	NC_017053	GGATT	2	10	147460	147469	20 %	40 %	40 %	0 %	383493266
93	NC_017053	TTTTG	2	10	147980	147989	0 %	80 %	20 %	0 %	383493266
94	NC_017053	TCATG	2	10	149486	149495	20 %	40 %	20 %	20 %	383493268
95	NC_017053	GTATC	2	10	150747	150756	20 %	40 %	20 %	20 %	383493269
96	NC_017053	GTCGC	2	10	151186	151195	0 %	20 %	40 %	40 %	383493270
97	NC_017053	AAGCT	2	10	153039	153048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017053	CATAA	2	10	153094	153103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017053	CTTTT	2	10	154288	154297	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017053	CTTGT	2	10	156609	156618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017053	GCCTA	2	10	157325	157334	20 %	20 %	20 %	40 %	383493275
102	NC_017053	GCAAC	2	10	157542	157551	40 %	0 %	20 %	40 %	383493275
103	NC_017053	AAGGT	2	10	159224	159233	40 %	20 %	40 %	0 %	383493275
104	NC_017053	CGTCA	2	10	159421	159430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017053	AACAA	2	10	161160	161169	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017053	ATTTG	2	10	165508	165517	20 %	60 %	20 %	0 %	383493283
107	NC_017053	CAAGA	2	10	167430	167439	60 %	0 %	20 %	20 %	383493284
108	NC_017053	TTTGG	2	10	168599	168608	0 %	60 %	40 %	0 %	383493285
109	NC_017053	TGGAT	2	10	169548	169557	20 %	40 %	40 %	0 %	383493286
110	NC_017053	ACCTA	2	10	170620	170629	40 %	20 %	0 %	40 %	383493286
111	NC_017053	ATTTT	2	10	175484	175493	20 %	80 %	0 %	0 %	383493290
112	NC_017053	AAAAG	2	10	175648	175657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017053	TCTAT	2	10	176472	176481	20 %	60 %	0 %	20 %	383493291
114	NC_017053	GTTTG	2	10	177012	177021	0 %	60 %	40 %	0 %	383493291
115	NC_017053	TGAAA	2	10	177187	177196	60 %	20 %	20 %	0 %	383493292
116	NC_017053	TTGAT	2	10	177435	177444	20 %	60 %	20 %	0 %	383493292
117	NC_017053	CCAAA	2	10	179784	179793	60 %	0 %	0 %	40 %	383493294
118	NC_017053	TCCCA	2	10	179986	179995	20 %	20 %	0 %	60 %	383493294
119	NC_017053	GCCAA	2	10	180833	180842	40 %	0 %	20 %	40 %	383493295
120	NC_017053	GGAAA	2	10	183783	183792	60 %	0 %	40 %	0 %	383493298
121	NC_017053	TAATC	2	10	186608	186617	40 %	40 %	0 %	20 %	383493302
122	NC_017053	TCTAA	2	10	189891	189900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017053	TTTAC	2	10	190740	190749	20 %	60 %	0 %	20 %	383493306
124	NC_017053	CAAAC	2	10	193260	193269	60 %	0 %	0 %	40 %	383493308
125	NC_017053	AGATA	2	10	193374	193383	60 %	20 %	20 %	0 %	383493308
126	NC_017053	ATATA	2	10	194163	194172	60 %	40 %	0 %	0 %	383493308
127	NC_017053	TTAAA	2	10	194674	194683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017053	TTTTG	2	10	198050	198059	0 %	80 %	20 %	0 %	383493312
129	NC_017053	ATCGC	2	10	199368	199377	20 %	20 %	20 %	40 %	383493314
130	NC_017053	TTTTA	2	10	200536	200545	20 %	80 %	0 %	0 %	383493315
131	NC_017053	CTAAT	2	10	200774	200783	40 %	40 %	0 %	20 %	383493315
132	NC_017053	GAATG	2	10	201297	201306	40 %	20 %	40 %	0 %	383493315
133	NC_017053	GACAG	2	10	203725	203734	40 %	0 %	40 %	20 %	383493317
134	NC_017053	TGTCT	2	10	203791	203800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017053	TAAGA	2	10	205309	205318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017053	CCTTC	2	10	205724	205733	0 %	40 %	0 %	60 %	383493319
137	NC_017053	TAAGA	2	10	205769	205778	60 %	20 %	20 %	0 %	383493319
138	NC_017053	TGGAT	2	10	207858	207867	20 %	40 %	40 %	0 %	383493321
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