MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017053	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017053	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017053	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017053	GAAC	2	8	8785	8792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017053	ACTA	2	8	15060	15067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017053	TACT	2	8	16578	16585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017053	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017053	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017053	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017053	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017053	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017053	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017053	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017053	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017053	GTAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017053	ACTA	2	8	19167	19174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017053	GAAG	2	8	19207	19214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017053	GCGA	2	8	19281	19288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017053	ATTC	2	8	20147	20154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017053	CTAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017053	TAGG	2	8	21158	21165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017053	TTGG	2	8	21341	21348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017053	AATC	2	8	21350	21357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017053	GCGT	2	8	23197	23204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017053	TAAA	2	8	23748	23755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017053	GTTA	2	8	24093	24100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017053	ATTC	2	8	24893	24900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017053	AATT	2	8	25012	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017053	ATTA	2	8	27666	27673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017053	GGAA	2	8	30747	30754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017053	AGAA	2	8	34642	34649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017053	TAGT	2	8	37282	37289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017053	AAAG	2	8	38036	38043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017053	AGAA	2	8	42461	42468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017053	GATT	2	8	49313	49320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017053	GATA	2	8	49832	49839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017053	AAAG	2	8	52104	52111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017053	ATTT	2	8	55157	55164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017053	TATT	2	8	61126	61133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017053	TAAA	2	8	64788	64795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017053	TTAA	2	8	65028	65035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017053	TATT	2	8	69540	69547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017053	AAAT	2	8	73628	73635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017053	ACCT	2	8	73802	73809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017053	GTGA	2	8	74083	74090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017053	TAAC	2	8	74166	74173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017053	AGCG	2	8	74254	74261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017053	TGGT	2	8	74919	74926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017053	AGCC	2	8	75136	75143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017053	AGCG	2	8	75482	75489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017053	GTAA	2	8	75732	75739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017053	ACTA	2	8	75774	75781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017053	GAAG	2	8	75814	75821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017053	GCGA	2	8	75888	75895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017053	ATTC	2	8	76754	76761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017053	CTAA	2	8	77110	77117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017053	TAGG	2	8	77765	77772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017053	TTGG	2	8	77948	77955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017053	AATC	2	8	77957	77964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017053	GCGT	2	8	79186	79193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017053	TGAT	2	8	80527	80534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017053	GTTC	2	8	80539	80546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017053	AAAT	2	8	80566	80573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017053	CAAT	2	8	80701	80708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017053	TTGC	2	8	81110	81117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017053	AAAC	2	8	81474	81481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017053	CAAT	2	8	91544	91551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017053	GTTA	2	8	101864	101871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017053	TAAG	2	8	104326	104333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017053	TCTA	2	8	110980	110987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017053	AATC	2	8	113241	113248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017053	AAAT	2	8	114343	114350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017053	CTTG	2	8	119678	119685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017053	TGAT	2	8	119736	119743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017053	AAAG	2	8	121177	121184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017053	AAAT	2	8	121225	121232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017053	ATCG	2	8	124905	124912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017053	CCAG	2	8	125351	125358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017053	CTTT	2	8	125786	125793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017053	GTCA	2	8	131187	131194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017053	TATC	2	8	131954	131961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017053	TTAG	2	8	138927	138934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017053	GCTT	2	8	142912	142919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017053	GAAA	2	8	145183	145190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017053	CCTG	2	8	145403	145410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017053	TAGT	2	8	146897	146904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017053	ACAA	2	8	148982	148989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017053	AAAG	2	8	154117	154124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017053	TAGC	2	8	154230	154237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017053	AAAT	2	8	155070	155077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017053	AAAT	2	8	155139	155146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017053	AGCA	2	8	156656	156663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017053	GGAT	2	8	164705	164712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017053	AGTC	2	8	166524	166531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017053	ATAG	2	8	174098	174105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017053	CGTG	2	8	174579	174586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017053	TAAA	2	8	175099	175106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017053	ATCA	2	8	175223	175230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017053	TTGT	2	8	175240	175247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017053	TCTT	2	8	175266	175273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017053	ATAA	2	8	175593	175600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017053	TTGA	2	8	178282	178289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017053	CCAA	2	8	178333	178340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017053	AGAC	2	8	178368	178375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017053	TTAG	2	8	180503	180510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017053	AACT	2	8	181599	181606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017053	AATC	2	8	181831	181838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017053	ATGG	2	8	183298	183305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017053	AAGA	2	8	186732	186739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017053	TTTA	2	8	190245	190252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017053	AGTA	2	8	191057	191064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017053	TAGA	2	8	191396	191403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017053	GATT	2	8	194796	194803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017053	AGGG	2	8	194924	194931	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017053	AGTG	2	8	196022	196029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017053	TTTC	2	8	202354	202361	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017053	AGCA	2	8	202377	202384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017053	GGGA	2	8	203803	203810	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017053	ACCG	2	8	205263	205270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017053	ACAA	2	8	205978	205985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017053	TAAA	2	8	212190	212197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017053	CAAT	2	8	212225	212232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017053	TCAA	2	8	212240	212247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017053	TTTG	2	8	212329	212336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017053	TAGT	2	8	214737	214744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017053	GTTT	2	8	214782	214789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017053	AAAT	2	8	214917	214924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017053	TAAA	2	8	219348	219355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017053	ATAG	2	8	219402	219409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017053	TTTG	2	8	219464	219471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017053	CTAC	2	8	223018	223025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017053	AAAG	2	8	224712	224719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017053	CAAA	2	8	235259	235266	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017053	TCAA	2	8	235467	235474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017053	ATTT	2	8	238004	238011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017053	TAGG	2	8	238089	238096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017053	AAAG	2	8	249319	249326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017053	TAAA	2	8	253871	253878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017053	GTCA	2	8	253905	253912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017053	AAAT	2	8	262901	262908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017053	ACCT	2	8	263075	263082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017053	GTGA	2	8	263356	263363	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017053	TAAC	2	8	263439	263446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017053	AGCG	2	8	263527	263534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017053	TGGT	2	8	264192	264199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017053	AGCC	2	8	264409	264416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017053	AGCG	2	8	264755	264762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017053	GTAA	2	8	265004	265011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017053	ACTA	2	8	265046	265053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017053	GAAG	2	8	265086	265093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017053	ATTC	2	8	266026	266033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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