MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 39009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017052	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489965
2	NC_017052	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489965
3	NC_017052	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489965
4	NC_017052	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489965
5	NC_017052	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489965
6	NC_017052	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489965
7	NC_017052	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489965
8	NC_017052	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489966
9	NC_017052	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489966
10	NC_017052	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
11	NC_017052	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489966
12	NC_017052	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489966
13	NC_017052	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
14	NC_017052	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489966
15	NC_017052	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489966
16	NC_017052	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489967
17	NC_017052	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489967
18	NC_017052	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489967
19	NC_017052	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489967
20	NC_017052	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489967
21	NC_017052	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489967
22	NC_017052	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489968
23	NC_017052	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489968
24	NC_017052	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489968
25	NC_017052	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489968
26	NC_017052	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489968
27	NC_017052	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489968
28	NC_017052	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489968
29	NC_017052	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489968
30	NC_017052	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489968
31	NC_017052	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489968
32	NC_017052	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489968
33	NC_017052	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489969
34	NC_017052	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489969
35	NC_017052	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
36	NC_017052	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489969
37	NC_017052	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
38	NC_017052	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
39	NC_017052	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489969
40	NC_017052	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
41	NC_017052	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489969
42	NC_017052	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489969
43	NC_017052	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489969
44	NC_017052	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489969
45	NC_017052	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489970
46	NC_017052	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489970
47	NC_017052	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489970
48	NC_017052	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489970
49	NC_017052	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489970
50	NC_017052	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489970
51	NC_017052	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489970
52	NC_017052	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489970
53	NC_017052	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489970
54	NC_017052	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489970
55	NC_017052	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489970
56	NC_017052	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489970
57	NC_017052	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489970
58	NC_017052	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489970
59	NC_017052	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
60	NC_017052	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489971
61	NC_017052	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489971
62	NC_017052	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489971
63	NC_017052	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
64	NC_017052	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
65	NC_017052	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489971
66	NC_017052	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489971
67	NC_017052	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
68	NC_017052	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489971
69	NC_017052	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489971
70	NC_017052	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489971
71	NC_017052	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
72	NC_017052	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489971
73	NC_017052	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489971
74	NC_017052	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489971
75	NC_017052	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489971
76	NC_017052	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
77	NC_017052	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489971
78	NC_017052	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
79	NC_017052	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489971
80	NC_017052	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489971
81	NC_017052	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489971
82	NC_017052	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489972
83	NC_017052	CGG	2	6	8511	8516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489972
84	NC_017052	CCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489972
85	NC_017052	GAA	2	6	8567	8572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489972
86	NC_017052	TTG	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489972
87	NC_017052	TGG	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489972
88	NC_017052	GTT	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489972
89	NC_017052	TGG	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489972
90	NC_017052	TGA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489972
91	NC_017052	ACC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489972
92	NC_017052	CAT	4	12	9076	9087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489972
93	NC_017052	AAC	2	6	9090	9095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489972
94	NC_017052	TAC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489972
95	NC_017052	AAT	2	6	9281	9286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489972
96	NC_017052	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383489972
97	NC_017052	ACA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489972
98	NC_017052	GGC	2	6	9523	9528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489972
99	NC_017052	GCA	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383489972
100	NC_017052	ATG	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489972
101	NC_017052	TAG	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489972
102	NC_017052	TTG	2	6	9853	9858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383489972
103	NC_017052	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489972
104	NC_017052	TTA	2	6	9940	9945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489972
105	NC_017052	ACT	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489972
106	NC_017052	GGT	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489972
107	NC_017052	TGA	2	6	10339	10344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489972
108	NC_017052	GCG	2	6	10360	10365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489972
109	NC_017052	GGA	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383489972
110	NC_017052	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489973
111	NC_017052	GGC	2	6	10688	10693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489973
112	NC_017052	CTG	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383489973
113	NC_017052	CCG	2	6	10761	10766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383489973
114	NC_017052	CTC	2	6	10904	10909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383489973
115	NC_017052	GGC	2	6	11141	11146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489973
116	NC_017052	CGG	2	6	11158	11163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489973
117	NC_017052	AAC	2	6	11190	11195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383489973
118	NC_017052	CTT	2	6	11371	11376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489973
119	NC_017052	GTG	2	6	11436	11441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489973
120	NC_017052	AAT	2	6	11504	11509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489973
121	NC_017052	GTG	2	6	11580	11585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489973
122	NC_017052	TTC	2	6	11678	11683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489973
123	NC_017052	CAC	3	9	11768	11776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383489973
124	NC_017052	ACT	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489973
125	NC_017052	TCT	2	6	11934	11939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489973
126	NC_017052	TGG	2	6	11985	11990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383489973
127	NC_017052	CGG	3	9	12022	12030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383489973
128	NC_017052	TTC	2	6	12095	12100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489973
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130	NC_017052	TTC	2	6	12203	12208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489973
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244	NC_017052	TAC	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489981
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