MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	383489124
2	NC_017051	AAAGTA	2	12	1128	1139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383489125
3	NC_017051	TTTCTC	2	12	1421	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489126
4	NC_017051	ATGCTA	2	12	1654	1665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383489126
5	NC_017051	CTAATA	2	12	4443	4454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489128
6	NC_017051	CGATAT	2	12	5338	5349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383489128
7	NC_017051	AAAATA	2	12	5541	5552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383489128
8	NC_017051	ATATCT	2	12	8591	8602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383489131
9	NC_017051	TTTTAT	2	12	10701	10712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489133
10	NC_017051	AGAAAA	2	12	10932	10943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383489133
11	NC_017051	ATTAAA	2	12	11963	11974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489134
12	NC_017051	CTAATT	2	12	13555	13566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383489136
13	NC_017051	CTATAT	2	12	14170	14181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383489136
14	NC_017051	GAAGAT	2	12	16362	16373	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383489138
15	NC_017051	AATATA	2	12	17085	17096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489138
16	NC_017051	ATTTAA	2	12	18328	18339	50 %	50 %	0 %	0 %	383489139
17	NC_017051	AATTAT	2	12	18551	18562	50 %	50 %	0 %	0 %	383489139
18	NC_017051	ATCTAA	2	12	19410	19421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017051	TTTTGA	2	12	21363	21374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489141
20	NC_017051	TTTGTA	2	12	21502	21513	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489141
21	NC_017051	TATCAA	2	12	22155	22166	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489142
22	NC_017051	TTAGAA	2	12	23355	23366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383489145
23	NC_017051	AAAAAT	2	12	24262	24273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017051	CATATA	2	12	25758	25769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489147
25	NC_017051	TACTAG	2	12	29585	29596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017051	CTACGT	2	12	29774	29785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017051	AGAAAC	2	12	29826	29837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017051	AATAAG	2	12	32592	32603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017051	ATTTTT	2	12	35043	35054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489153
30	NC_017051	TTTAAT	2	12	37526	37537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017051	GTGAGC	2	12	40046	40057	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383489155
32	NC_017051	ATTCTT	2	12	40185	40196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383489155
33	NC_017051	ATTTAT	2	12	42123	42134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489156
34	NC_017051	CTTTGT	2	12	44600	44611	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017051	ATAAAA	2	12	52914	52925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017051	TGCAGC	2	12	53495	53506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383489166
37	NC_017051	ATAGTG	2	12	54728	54739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489167
38	NC_017051	AAAAAG	2	12	55556	55567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383489167
39	NC_017051	CACTTG	2	12	56806	56817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383489169
40	NC_017051	GAAAAA	2	12	56970	56981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383489169
41	NC_017051	TAAAAT	2	12	60897	60908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489173
42	NC_017051	GAGTAG	2	12	62045	62056	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383489173
43	NC_017051	ACTACA	2	12	65224	65235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383489177
44	NC_017051	AGTAAA	2	12	69379	69390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383489181
45	NC_017051	AATATT	2	12	73441	73452	50 %	50 %	0 %	0 %	383489184
46	NC_017051	TTGATT	2	12	74369	74380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489184
47	NC_017051	TCTTGC	2	12	74739	74750	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383489184
48	NC_017051	GAAGCA	2	12	75345	75356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383489185
49	NC_017051	TCAAGC	2	12	75491	75502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383489185
50	NC_017051	CTATTA	2	12	77196	77207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383489186
51	NC_017051	TAAAGG	2	12	77383	77394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383489186
52	NC_017051	TTTTTA	2	12	80289	80300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489188
53	NC_017051	ACCTAT	2	12	85165	85176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489193
54	NC_017051	TATTTA	2	12	88168	88179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489196
55	NC_017051	AAATTA	2	12	96626	96637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489199
56	NC_017051	TAGCGG	2	12	98320	98331	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383489201
57	NC_017051	TCTTTT	2	12	98678	98689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383489201
58	NC_017051	GGTATT	2	12	99419	99430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383489202
59	NC_017051	TTTAGT	2	12	100265	100276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489203
60	NC_017051	TGATTT	2	12	103073	103084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489205
61	NC_017051	TAAAAT	2	12	106829	106840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489209
62	NC_017051	AACTCT	2	12	107635	107646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489210
63	NC_017051	GGTGTT	2	12	109527	109538	0 %	50 %	50 %	0 %	383489211
64	NC_017051	TTGCTA	2	12	115190	115201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489216
65	NC_017051	AGATAG	2	12	115356	115367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383489216
66	NC_017051	CATCTA	2	12	118314	118325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489217
67	NC_017051	TAATGC	2	12	120322	120333	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383489218
68	NC_017051	GTATCT	2	12	120683	120694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489218
69	NC_017051	TAAAAG	2	12	128258	128269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383489220
70	NC_017051	GTATAG	2	12	128579	128590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489220
71	NC_017051	GATTTT	2	12	134213	134224	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489226
72	NC_017051	GCTATG	2	12	134603	134614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383489226
73	NC_017051	TTATAT	2	12	135632	135643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489227
74	NC_017051	CTTTTG	2	12	136760	136771	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383489228
75	NC_017051	AATATT	2	12	140840	140851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017051	AAAGAA	2	12	143754	143765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383489234
77	NC_017051	GGTGAT	2	12	144869	144880	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383489235
78	NC_017051	TTAGAG	2	12	148947	148958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489240
79	NC_017051	ATAATT	2	12	151238	151249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017051	TAGAGA	2	12	151776	151787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017051	AACTAC	2	12	152360	152371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383489244
82	NC_017051	ATAAAA	2	12	153868	153879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383489244
83	NC_017051	TTTTTA	2	12	154872	154883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489245
84	NC_017051	AGTTTC	2	12	155476	155487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489246
85	NC_017051	GCAGAA	2	12	157938	157949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383489250
86	NC_017051	TTAAAA	2	12	159890	159901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489251
87	NC_017051	CTATTG	2	12	161738	161749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489251
88	NC_017051	AGTTTA	2	12	164891	164902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383489252
89	NC_017051	TATGTA	2	12	171200	171211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017051	ATCTCC	2	12	174513	174524	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017051	TAAAAT	2	12	182668	182679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017051	ATCTTG	2	12	184386	184397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489266
93	NC_017051	AACATT	2	12	184488	184499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489266
94	NC_017051	TGATGG	2	12	188340	188351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383489269
95	NC_017051	TATATT	2	12	189129	189140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489269
96	NC_017051	ATATTT	2	12	189739	189750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383489269
97	NC_017051	TTTAAT	2	12	189996	190007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017051	TCACAA	2	12	191416	191427	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017051	TCCTTT	2	12	193652	193663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383489273
100	NC_017051	TTAATA	2	12	194959	194970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017051	TTTCTT	2	12	195508	195519	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383489276
102	NC_017051	TGAAGA	2	12	195586	195597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017051	AAATTA	2	12	196648	196659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383489278
104	NC_017051	TCTTAA	2	12	201756	201767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017051	CACTAC	2	12	203835	203846	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383489283
106	NC_017051	AAATTC	2	12	207021	207032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383489284
107	NC_017051	AATTCA	2	12	207860	207871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017051	ACTATA	2	12	208042	208053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017051	AAAGCA	2	12	209312	209323	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383489285
110	NC_017051	ATTATA	2	12	210035	210046	50 %	50 %	0 %	0 %	383489286
111	NC_017051	GTATCT	2	12	211928	211939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383489288
112	NC_017051	TTCTAC	2	12	214405	214416	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383489289
113	NC_017051	TTCTTT	2	12	218620	218631	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383489291
114	NC_017051	CTTCTC	2	12	220052	220063	0 %	50 %	0 %	50 %	383489292
115	NC_017051	TAATTG	2	12	222926	222937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383489294
116	NC_017051	AATCTT	2	12	224663	224674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017051	AAAGCA	2	12	225631	225642	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383489297
118	NC_017051	TTATTT	2	12	228943	228954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383489300
119	NC_017051	TTTCTT	2	12	231533	231544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017051	GCAATT	2	12	232867	232878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017051	TTAAAT	2	12	234671	234682	50 %	50 %	0 %	0 %	383489304
122	NC_017051	TAAAAA	2	12	235831	235842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017051	GTAAAG	2	12	237030	237041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017051	AAATAA	2	12	245874	245885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017051	ATTGCA	2	12	247406	247417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383489315
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241	NC_017051	TAAATT	2	12	432380	432391	50 %	50 %	0 %	0 %	383489455
242	NC_017051	CAAATG	2	12	432400	432411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383489455
243	NC_017051	ATATCT	2	12	435459	435470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_017051	CAAAGC	2	12	436515	436526	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383489460
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246	NC_017051	TTAATT	2	12	444078	444089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017051	ATTTTA	2	12	444686	444697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017051	TAAGTA	2	12	446914	446925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383489469
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250	NC_017051	TTTTTA	2	12	449602	449613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017051	GTTGCT	2	12	453733	453744	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383489474
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261	NC_017051	AGCAGA	2	12	487408	487419	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383489499
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269	NC_017051	ATTTTT	2	12	506027	506038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017051	GTTTAA	2	12	506530	506541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383489512
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347	NC_017051	AGGATA	2	12	649691	649702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383489614
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349	NC_017051	GACGCT	2	12	652240	652251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383489616
350	NC_017051	TAGCAT	2	12	653359	653370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383489617
351	NC_017051	TAGTGA	2	12	653834	653845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383489617
352	NC_017051	TAATAT	2	12	655942	655953	50 %	50 %	0 %	0 %	383489621
353	NC_017051	AATACC	2	12	656150	656161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383489621
354	NC_017051	GTTTTA	2	12	656934	656945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383489622
355	NC_017051	TGCTAC	2	12	662601	662612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383489625
356	NC_017051	TAACTT	2	12	662622	662633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383489625
357	NC_017051	TATCCA	2	12	665174	665185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383489626
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