MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 1195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383489126
2	NC_017051	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383489127
3	NC_017051	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383489127
4	NC_017051	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383489128
5	NC_017051	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383489128
6	NC_017051	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383489128
7	NC_017051	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383489128
8	NC_017051	AATAC	2	10	6936	6945	60 %	20 %	0 %	20 %	383489129
9	NC_017051	AAACC	2	10	8105	8114	60 %	0 %	0 %	40 %	383489131
10	NC_017051	TGACT	2	10	8808	8817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017051	GATAC	2	10	8992	9001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017051	ATTTA	2	10	9351	9360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017051	TTAAT	2	10	10608	10617	40 %	60 %	0 %	0 %	383489132
14	NC_017051	ACAAT	2	10	11057	11066	60 %	20 %	0 %	20 %	383489133
15	NC_017051	TAAAC	2	10	14655	14664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017051	TCAAT	2	10	15906	15915	40 %	40 %	0 %	20 %	383489137
17	NC_017051	AATCA	2	10	16129	16138	60 %	20 %	0 %	20 %	383489138
18	NC_017051	TTACT	2	10	17228	17237	20 %	60 %	0 %	20 %	383489138
19	NC_017051	AGATA	2	10	18463	18472	60 %	20 %	20 %	0 %	383489139
20	NC_017051	TCAAA	2	10	18493	18502	60 %	20 %	0 %	20 %	383489139
21	NC_017051	ATTTA	2	10	19331	19340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017051	AGTTT	2	10	19529	19538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017051	TATAA	2	10	19762	19771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017051	AATCT	2	10	20572	20581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017051	TAAAA	2	10	20933	20942	80 %	20 %	0 %	0 %	383489140
26	NC_017051	TTTGT	2	10	21445	21454	0 %	80 %	20 %	0 %	383489141
27	NC_017051	TAAAT	2	10	21636	21645	60 %	40 %	0 %	0 %	383489141
28	NC_017051	TTTGT	2	10	21953	21962	0 %	80 %	20 %	0 %	383489142
29	NC_017051	AATAA	2	10	22886	22895	80 %	20 %	0 %	0 %	383489144
30	NC_017051	CTATA	2	10	23545	23554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017051	TAATA	2	10	23768	23777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017051	CCATA	2	10	27830	27839	40 %	20 %	0 %	40 %	383489148
33	NC_017051	TTGAG	2	10	28493	28502	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017051	ATTTT	2	10	29214	29223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017051	TATTT	2	10	29790	29799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017051	GTTTC	2	10	30308	30317	0 %	60 %	20 %	20 %	383489149
37	NC_017051	ATATT	2	10	31076	31085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017051	ATTAA	2	10	31708	31717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017051	CTTAA	2	10	32062	32071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017051	ATTTA	2	10	32199	32208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017051	AAATT	2	10	32782	32791	60 %	40 %	0 %	0 %	383489150
42	NC_017051	TTTTA	2	10	33612	33621	20 %	80 %	0 %	0 %	383489151
43	NC_017051	TTGAT	2	10	39563	39572	20 %	60 %	20 %	0 %	383489155
44	NC_017051	AATTG	2	10	39597	39606	40 %	40 %	20 %	0 %	383489155
45	NC_017051	ATATG	2	10	39756	39765	40 %	40 %	20 %	0 %	383489155
46	NC_017051	ATTAT	2	10	40663	40672	40 %	60 %	0 %	0 %	383489155
47	NC_017051	GTATT	2	10	41434	41443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017051	ATAAC	2	10	43788	43797	60 %	20 %	0 %	20 %	383489157
49	NC_017051	TAACA	2	10	44017	44026	60 %	20 %	0 %	20 %	383489157
50	NC_017051	TTTAA	2	10	44153	44162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017051	AATTG	2	10	46065	46074	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017051	AATAT	2	10	46196	46205	60 %	40 %	0 %	0 %	383489161
53	NC_017051	TACCT	2	10	47337	47346	20 %	40 %	0 %	40 %	383489161
54	NC_017051	TGGTA	2	10	48857	48866	20 %	40 %	40 %	0 %	383489162
55	NC_017051	AAATT	2	10	50908	50917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017051	AACTA	2	10	51757	51766	60 %	20 %	0 %	20 %	383489164
57	NC_017051	ACTTT	2	10	53195	53204	20 %	60 %	0 %	20 %	383489166
58	NC_017051	TTAAA	2	10	54112	54121	60 %	40 %	0 %	0 %	383489166
59	NC_017051	AATAT	2	10	54164	54173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017051	CAAGT	2	10	54494	54503	40 %	20 %	20 %	20 %	383489167
61	NC_017051	CTATG	2	10	55341	55350	20 %	40 %	20 %	20 %	383489167
62	NC_017051	GCTAA	2	10	56352	56361	40 %	20 %	20 %	20 %	383489168
63	NC_017051	TTTAC	2	10	58702	58711	20 %	60 %	0 %	20 %	383489171
64	NC_017051	AGCAT	2	10	58727	58736	40 %	20 %	20 %	20 %	383489171
65	NC_017051	GGGTT	2	10	60288	60297	0 %	40 %	60 %	0 %	383489172
66	NC_017051	TTTAT	2	10	60664	60673	20 %	80 %	0 %	0 %	383489172
67	NC_017051	GTTTT	2	10	61855	61864	0 %	80 %	20 %	0 %	383489173
68	NC_017051	ACAAT	2	10	62335	62344	60 %	20 %	0 %	20 %	383489174
69	NC_017051	TTTTC	2	10	62723	62732	0 %	80 %	0 %	20 %	383489174
70	NC_017051	CAATG	2	10	65615	65624	40 %	20 %	20 %	20 %	383489177
71	NC_017051	ATAAA	2	10	66030	66039	80 %	20 %	0 %	0 %	383489178
72	NC_017051	TAAAT	2	10	66436	66445	60 %	40 %	0 %	0 %	383489178
73	NC_017051	ATTAA	2	10	66784	66793	60 %	40 %	0 %	0 %	383489178
74	NC_017051	ATATT	2	10	69967	69976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017051	TAACA	2	10	70268	70277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017051	AATGA	2	10	70310	70319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017051	ACAAA	2	10	71912	71921	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017051	TTAAT	2	10	74823	74832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017051	TGAAA	2	10	77677	77686	60 %	20 %	20 %	0 %	383489186
80	NC_017051	TTGAT	2	10	79004	79013	20 %	60 %	20 %	0 %	383489187
81	NC_017051	ATATA	2	10	79639	79648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017051	TTGTA	2	10	79760	79769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017051	AAAAT	2	10	80527	80536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017051	ATTTA	2	10	80850	80859	40 %	60 %	0 %	0 %	383489189
85	NC_017051	TTAGT	2	10	85847	85856	20 %	60 %	20 %	0 %	383489194
86	NC_017051	TTAAT	2	10	88058	88067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017051	TTATT	2	10	89079	89088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017051	TTAAC	2	10	89103	89112	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017051	ATATT	2	10	89346	89355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017051	TCTTT	2	10	90186	90195	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017051	TTTAA	2	10	90597	90606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017051	TCCTT	2	10	91071	91080	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017051	ATTGT	2	10	91149	91158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017051	TACTT	2	10	91756	91765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017051	TTATG	2	10	92687	92696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017051	TTATG	2	10	94618	94627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017051	AGTTA	2	10	94659	94668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017051	TCTAT	2	10	96731	96740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017051	ATAAA	2	10	99252	99261	80 %	20 %	0 %	0 %	383489201
100	NC_017051	TATAA	2	10	99286	99295	60 %	40 %	0 %	0 %	383489201
101	NC_017051	TAAAA	2	10	101503	101512	80 %	20 %	0 %	0 %	383489204
102	NC_017051	AAAAC	2	10	102199	102208	80 %	0 %	0 %	20 %	383489204
103	NC_017051	TTTAA	2	10	102275	102284	40 %	60 %	0 %	0 %	383489204
104	NC_017051	TGAAA	2	10	103725	103734	60 %	20 %	20 %	0 %	383489206
105	NC_017051	CTTGT	2	10	106493	106502	0 %	60 %	20 %	20 %	383489208
106	NC_017051	ATGAT	2	10	107410	107419	40 %	40 %	20 %	0 %	383489209
107	NC_017051	TTAAT	2	10	108086	108095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017051	ATTTT	2	10	108140	108149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017051	TTATT	2	10	108309	108318	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017051	AGTAG	2	10	110081	110090	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017051	CACTA	2	10	110342	110351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017051	AATAC	2	10	110486	110495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017051	AAATC	2	10	110620	110629	60 %	20 %	0 %	20 %	383489213
114	NC_017051	TTATA	2	10	111926	111935	40 %	60 %	0 %	0 %	383489214
115	NC_017051	GTAAT	2	10	112064	112073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017051	TGCTT	2	10	112431	112440	0 %	60 %	20 %	20 %	383489215
117	NC_017051	TTTTA	2	10	113548	113557	20 %	80 %	0 %	0 %	383489215
118	NC_017051	GCTTT	2	10	115124	115133	0 %	60 %	20 %	20 %	383489216
119	NC_017051	TATGT	2	10	115777	115786	20 %	60 %	20 %	0 %	383489216
120	NC_017051	TCTAC	2	10	116122	116131	20 %	40 %	0 %	40 %	383489216
121	NC_017051	AGAAA	2	10	117648	117657	80 %	0 %	20 %	0 %	383489216
122	NC_017051	GTTTT	2	10	118333	118342	0 %	80 %	20 %	0 %	383489217
123	NC_017051	TGCAG	2	10	118666	118675	20 %	20 %	40 %	20 %	383489217
124	NC_017051	GGTAT	2	10	119363	119372	20 %	40 %	40 %	0 %	383489217
125	NC_017051	ATCTA	2	10	120541	120550	40 %	40 %	0 %	20 %	383489218
126	NC_017051	GTTTG	2	10	120972	120981	0 %	60 %	40 %	0 %	383489218
127	NC_017051	ACAAG	2	10	122927	122936	60 %	0 %	20 %	20 %	383489218
128	NC_017051	AGTTT	2	10	123238	123247	20 %	60 %	20 %	0 %	383489219
129	NC_017051	TTAGT	2	10	123761	123770	20 %	60 %	20 %	0 %	383489219
130	NC_017051	GTTAT	2	10	125162	125171	20 %	60 %	20 %	0 %	383489219
131	NC_017051	ATGGT	2	10	126303	126312	20 %	40 %	40 %	0 %	383489220
132	NC_017051	TATTT	2	10	127237	127246	20 %	80 %	0 %	0 %	383489220
133	NC_017051	CAAAG	2	10	127629	127638	60 %	0 %	20 %	20 %	383489220
134	NC_017051	GAACA	2	10	128039	128048	60 %	0 %	20 %	20 %	383489220
135	NC_017051	TGATA	2	10	129015	129024	40 %	40 %	20 %	0 %	383489220
136	NC_017051	TGTAT	2	10	133682	133691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017051	TTTAA	2	10	134747	134756	40 %	60 %	0 %	0 %	383489226
138	NC_017051	GGTTT	2	10	135865	135874	0 %	60 %	40 %	0 %	383489227
139	NC_017051	TATGT	2	10	139972	139981	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017051	ATTAA	2	10	140223	140232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017051	TATCA	2	10	141742	141751	40 %	40 %	0 %	20 %	383489232
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274	NC_017051	ATCAT	2	10	271366	271375	40 %	40 %	0 %	20 %	383489328
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