MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 3476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383489124
2	NC_017051	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383489124
3	NC_017051	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017051	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017051	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383489126
6	NC_017051	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383489127
7	NC_017051	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383489127
8	NC_017051	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383489127
9	NC_017051	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383489127
10	NC_017051	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383489128
11	NC_017051	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383489128
12	NC_017051	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383489128
13	NC_017051	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383489128
14	NC_017051	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017051	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017051	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017051	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	383489129
18	NC_017051	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	383489129
19	NC_017051	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	383489129
20	NC_017051	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	383489129
21	NC_017051	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	383489131
22	NC_017051	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017051	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017051	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017051	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017051	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	383489132
27	NC_017051	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	383489132
28	NC_017051	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	383489132
29	NC_017051	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	383489132
30	NC_017051	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	383489132
31	NC_017051	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	383489133
32	NC_017051	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	383489133
33	NC_017051	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	383489133
34	NC_017051	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	383489133
35	NC_017051	TAAT	2	8	12446	12453	50 %	50 %	0 %	0 %	383489135
36	NC_017051	GCTT	2	8	12461	12468	0 %	50 %	25 %	25 %	383489135
37	NC_017051	AATA	2	8	13374	13381	75 %	25 %	0 %	0 %	383489136
38	NC_017051	GCTC	2	8	13578	13585	0 %	25 %	25 %	50 %	383489136
39	NC_017051	TAAG	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017051	ATTA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017051	AAAG	2	8	14865	14872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017051	TTAT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017051	TAAG	2	8	15230	15237	50 %	25 %	25 %	0 %	383489137
44	NC_017051	AATA	2	8	15660	15667	75 %	25 %	0 %	0 %	383489137
45	NC_017051	GTAA	2	8	15808	15815	50 %	25 %	25 %	0 %	383489137
46	NC_017051	AGCA	2	8	16090	16097	50 %	0 %	25 %	25 %	383489138
47	NC_017051	AATT	2	8	16703	16710	50 %	50 %	0 %	0 %	383489138
48	NC_017051	AAAG	2	8	17173	17180	75 %	0 %	25 %	0 %	383489138
49	NC_017051	ATTC	2	8	17266	17273	25 %	50 %	0 %	25 %	383489138
50	NC_017051	TTCA	2	8	18318	18325	25 %	50 %	0 %	25 %	383489139
51	NC_017051	TAAA	2	8	18957	18964	75 %	25 %	0 %	0 %	383489139
52	NC_017051	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017051	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017051	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017051	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017051	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017051	ATAG	2	8	20089	20096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017051	ATTA	2	8	20193	20200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017051	ATCA	2	8	20755	20762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017051	AACA	2	8	21116	21123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017051	GTAT	2	8	21155	21162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017051	TGAT	2	8	21848	21855	25 %	50 %	25 %	0 %	383489142
63	NC_017051	TAAT	2	8	22428	22435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017051	ATAC	2	8	22474	22481	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
65	NC_017051	AACT	2	8	22662	22669	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
66	NC_017051	AAAT	2	8	22896	22903	75 %	25 %	0 %	0 %	383489144
67	NC_017051	CACT	2	8	22992	22999	25 %	25 %	0 %	50 %	383489144
68	NC_017051	AAGT	2	8	23045	23052	50 %	25 %	25 %	0 %	383489144
69	NC_017051	ATTA	2	8	23427	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	383489145
70	NC_017051	ATTT	2	8	23486	23493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017051	TATT	2	8	23733	23740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017051	TCTT	2	8	25044	25051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017051	AAAT	2	8	25635	25642	75 %	25 %	0 %	0 %	383489147
74	NC_017051	TAAA	2	8	26864	26871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017051	TTAA	2	8	27111	27118	50 %	50 %	0 %	0 %	383489148
76	NC_017051	TAGT	2	8	27274	27281	25 %	50 %	25 %	0 %	383489148
77	NC_017051	ATTT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
78	NC_017051	TTGC	2	8	27568	27575	0 %	50 %	25 %	25 %	383489148
79	NC_017051	ATTT	2	8	27718	27725	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
80	NC_017051	TTCC	2	8	27808	27815	0 %	50 %	0 %	50 %	383489148
81	NC_017051	GCTT	2	8	27946	27953	0 %	50 %	25 %	25 %	383489148
82	NC_017051	ATTT	3	12	28778	28789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017051	TACA	2	8	28920	28927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017051	ATAA	2	8	29095	29102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017051	AATA	2	8	29725	29732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017051	TTTG	2	8	31046	31053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017051	ATTA	2	8	31256	31263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017051	ATAG	2	8	31395	31402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017051	TTTG	2	8	31485	31492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017051	ATTT	2	8	31811	31818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017051	TTCT	2	8	31853	31860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017051	AAAT	2	8	32614	32621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017051	TATT	2	8	32715	32722	25 %	75 %	0 %	0 %	383489150
94	NC_017051	ATTT	2	8	32856	32863	25 %	75 %	0 %	0 %	383489150
95	NC_017051	ATTT	2	8	33296	33303	25 %	75 %	0 %	0 %	383489151
96	NC_017051	AAAT	2	8	33320	33327	75 %	25 %	0 %	0 %	383489151
97	NC_017051	ATAA	2	8	33796	33803	75 %	25 %	0 %	0 %	383489151
98	NC_017051	AGCA	2	8	34284	34291	50 %	0 %	25 %	25 %	383489152
99	NC_017051	TTTC	2	8	34952	34959	0 %	75 %	0 %	25 %	383489153
100	NC_017051	ATTT	2	8	35817	35824	25 %	75 %	0 %	0 %	383489153
101	NC_017051	TCGT	2	8	36096	36103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017051	AATC	2	8	36407	36414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017051	TGAT	2	8	36479	36486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017051	TTGA	2	8	36659	36666	25 %	50 %	25 %	0 %	383489154
105	NC_017051	AGTA	2	8	36778	36785	50 %	25 %	25 %	0 %	383489154
106	NC_017051	TACT	2	8	37128	37135	25 %	50 %	0 %	25 %	383489154
107	NC_017051	TCAA	2	8	37989	37996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017051	ATGT	2	8	38049	38056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017051	TTAA	2	8	38315	38322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017051	TTAT	2	8	38381	38388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017051	TAAA	2	8	38591	38598	75 %	25 %	0 %	0 %	383489155
112	NC_017051	GAGT	2	8	39885	39892	25 %	25 %	50 %	0 %	383489155
113	NC_017051	AATA	2	8	41069	41076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017051	AAAT	2	8	41135	41142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017051	ATTA	2	8	42010	42017	50 %	50 %	0 %	0 %	383489156
116	NC_017051	ACTT	2	8	42958	42965	25 %	50 %	0 %	25 %	383489157
117	NC_017051	AATA	2	8	43447	43454	75 %	25 %	0 %	0 %	383489157
118	NC_017051	TAAA	2	8	43503	43510	75 %	25 %	0 %	0 %	383489157
119	NC_017051	AAAC	2	8	43800	43807	75 %	0 %	0 %	25 %	383489157
120	NC_017051	ATTT	3	12	43815	43826	25 %	75 %	0 %	0 %	383489157
121	NC_017051	TTTA	2	8	44002	44009	25 %	75 %	0 %	0 %	383489157
122	NC_017051	TAAG	2	8	44394	44401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017051	GTTT	2	8	44786	44793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017051	AGAA	2	8	45038	45045	75 %	0 %	25 %	0 %	383489158
125	NC_017051	AAAG	2	8	45418	45425	75 %	0 %	25 %	0 %	383489159
126	NC_017051	TAAA	2	8	45485	45492	75 %	25 %	0 %	0 %	383489159
127	NC_017051	AAGA	2	8	46463	46470	75 %	0 %	25 %	0 %	383489161
128	NC_017051	TAAT	2	8	46970	46977	50 %	50 %	0 %	0 %	383489161
129	NC_017051	ATTA	2	8	47046	47053	50 %	50 %	0 %	0 %	383489161
130	NC_017051	TTAT	2	8	47241	47248	25 %	75 %	0 %	0 %	383489161
131	NC_017051	GAAT	2	8	47818	47825	50 %	25 %	25 %	0 %	383489162
132	NC_017051	CTTA	2	8	48092	48099	25 %	50 %	0 %	25 %	383489162
133	NC_017051	ATGG	2	8	48372	48379	25 %	25 %	50 %	0 %	383489162
134	NC_017051	TATG	2	8	49100	49107	25 %	50 %	25 %	0 %	383489162
135	NC_017051	TAAT	2	8	49493	49500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017051	GCTA	2	8	51871	51878	25 %	25 %	25 %	25 %	383489164
137	NC_017051	AATT	2	8	51967	51974	50 %	50 %	0 %	0 %	383489164
138	NC_017051	CGAC	2	8	51990	51997	25 %	0 %	25 %	50 %	383489164
139	NC_017051	AAAT	2	8	52064	52071	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
140	NC_017051	ATAA	2	8	52427	52434	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
141	NC_017051	ATAA	2	8	52756	52763	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
142	NC_017051	TAAT	2	8	52808	52815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017051	TGTT	2	8	53035	53042	0 %	75 %	25 %	0 %	383489166
144	NC_017051	TTAA	2	8	53073	53080	50 %	50 %	0 %	0 %	383489166
145	NC_017051	TTAT	2	8	53171	53178	25 %	75 %	0 %	0 %	383489166
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