MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017051	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017051	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017051	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017051	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017051	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017051	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017051	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017051	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017051	TAAG	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017051	ATTA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017051	AAAG	2	8	14865	14872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017051	TTAT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017051	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017051	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017051	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017051	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017051	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017051	ATAG	2	8	20089	20096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017051	ATTA	2	8	20193	20200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017051	ATCA	2	8	20755	20762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017051	AACA	2	8	21116	21123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017051	GTAT	2	8	21155	21162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017051	TAAT	2	8	22428	22435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017051	ATTT	2	8	23486	23493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017051	TATT	2	8	23733	23740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017051	TCTT	2	8	25044	25051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017051	TAAA	2	8	26864	26871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017051	ATTT	3	12	28778	28789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017051	TACA	2	8	28920	28927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017051	ATAA	2	8	29095	29102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017051	AATA	2	8	29725	29732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017051	TTTG	2	8	31046	31053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017051	ATTA	2	8	31256	31263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017051	ATAG	2	8	31395	31402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017051	TTTG	2	8	31485	31492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017051	ATTT	2	8	31811	31818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017051	TTCT	2	8	31853	31860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017051	AAAT	2	8	32614	32621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017051	TCGT	2	8	36096	36103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017051	AATC	2	8	36407	36414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017051	TGAT	2	8	36479	36486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017051	TCAA	2	8	37989	37996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017051	ATGT	2	8	38049	38056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017051	TTAA	2	8	38315	38322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017051	TTAT	2	8	38381	38388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017051	AATA	2	8	41069	41076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017051	AAAT	2	8	41135	41142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017051	TAAG	2	8	44394	44401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017051	GTTT	2	8	44786	44793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017051	TAAT	2	8	49493	49500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017051	TAAT	2	8	52808	52815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017051	TAAT	2	8	54289	54296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017051	GTTG	2	8	57764	57771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017051	TTCT	2	8	58053	58060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017051	ATTA	2	8	58465	58472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017051	TAGT	2	8	59136	59143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017051	TTCT	2	8	59226	59233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017051	TTTG	2	8	59246	59253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017051	AAAT	2	8	59290	59297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017051	TAAT	2	8	70113	70120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017051	AAAT	2	8	70645	70652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017051	TCTA	2	8	70922	70929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017051	TCAA	2	8	75603	75610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017051	TAAA	2	8	78008	78015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017051	AAAT	2	8	78016	78023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017051	TTAA	2	8	79616	79623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017051	ATTA	2	8	79798	79805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017051	ACAA	2	8	81690	81697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017051	TATT	2	8	81814	81821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017051	ATTT	2	8	84827	84834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017051	GAAC	2	8	88041	88048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017051	TTTC	2	8	88068	88075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017051	ATAA	2	8	89049	89056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017051	TGTT	2	8	89257	89264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017051	TGAT	2	8	89410	89417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017051	TTGT	2	8	89869	89876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017051	ATCT	2	8	90133	90140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017051	CTTG	2	8	90639	90646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017051	TATT	2	8	90696	90703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017051	ATAA	2	8	90985	90992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017051	TCAT	2	8	91005	91012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017051	TTTA	2	8	91502	91509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017051	TTTA	2	8	91649	91656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017051	GTTT	2	8	91724	91731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017051	TTAA	2	8	91883	91890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017051	CTTG	2	8	92546	92553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017051	TACT	2	8	92716	92723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017051	CAAA	2	8	92913	92920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017051	CTTT	2	8	94391	94398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017051	GTAA	2	8	94563	94570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017051	ATGT	2	8	94586	94593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017051	TAAA	2	8	95774	95781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017051	CTAA	2	8	97238	97245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017051	TTAT	2	8	97470	97477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017051	ATTA	2	8	97530	97537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017051	AAGT	2	8	104144	104151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017051	ATAA	2	8	104243	104250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017051	ATCA	2	8	104385	104392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017051	ATCA	2	8	104417	104424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017051	TAAC	2	8	107879	107886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017051	AGTA	2	8	107975	107982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017051	ATTT	2	8	109464	109471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017051	CATA	2	8	110461	110468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017051	TAAA	2	8	111437	111444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017051	TATT	2	8	114648	114655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017051	GTAA	2	8	114746	114753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017051	GTCA	2	8	123103	123110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017051	GTAA	2	8	123141	123148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017051	CTTA	2	8	129525	129532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017051	TACT	2	8	129562	129569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017051	TTAC	2	8	129823	129830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017051	TAAC	2	8	129869	129876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017051	ACAA	2	8	132167	132174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017051	ATAA	2	8	132215	132222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017051	TAGA	2	8	133793	133800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017051	TTTA	2	8	139768	139775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017051	AATA	2	8	140419	140426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017051	ATTA	2	8	140521	140528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017051	ACTT	2	8	140609	140616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017051	ACTT	2	8	146635	146642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017051	TTTA	2	8	150456	150463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017051	TAAG	2	8	151348	151355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017051	ATTT	2	8	151765	151772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017051	TAAT	2	8	154416	154423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017051	AATA	2	8	154439	154446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017051	TAAA	2	8	155569	155576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017051	TAAT	2	8	157564	157571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017051	CTTT	2	8	158146	158153	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017051	TATT	2	8	158553	158560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017051	TATC	2	8	158591	158598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017051	TTAT	2	8	158783	158790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017051	AATG	2	8	163047	163054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017051	ATTA	2	8	167350	167357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017051	TAAA	2	8	167596	167603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017051	ATAA	2	8	167654	167661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017051	AGAA	2	8	167741	167748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017051	ATAA	2	8	168203	168210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017051	GAAA	2	8	171218	171225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017051	ACAA	2	8	173124	173131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017051	AATA	2	8	173250	173257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017051	TTTG	2	8	173358	173365	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017051	TTTA	2	8	173444	173451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017051	TCTT	2	8	173856	173863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017051	AACC	2	8	174052	174059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017051	CTTT	2	8	174233	174240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017051	TTGA	2	8	174404	174411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017051	TACA	2	8	174663	174670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017051	TATT	2	8	178698	178705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017051	ATTA	2	8	180306	180313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017051	GATT	2	8	182355	182362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017051	AGTA	2	8	182463	182470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017051	TATT	2	8	182485	182492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017051	ATTT	2	8	182547	182554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017051	GCAT	2	8	182570	182577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_017051	TATT	2	8	186132	186139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017051	AAAC	2	8	186145	186152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_017051	GTAT	2	8	186772	186779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017051	ATTT	2	8	228179	228186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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