MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Dachau chromosome

Total Repeats: 2396

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017051	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383489124
2	NC_017051	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383489124
3	NC_017051	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383489126
4	NC_017051	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383489127
5	NC_017051	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383489127
6	NC_017051	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383489127
7	NC_017051	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383489127
8	NC_017051	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383489128
9	NC_017051	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383489128
10	NC_017051	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383489128
11	NC_017051	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383489128
12	NC_017051	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	383489129
13	NC_017051	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	383489129
14	NC_017051	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	383489129
15	NC_017051	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	383489129
16	NC_017051	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	383489131
17	NC_017051	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	383489132
18	NC_017051	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	383489132
19	NC_017051	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	383489132
20	NC_017051	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	383489132
21	NC_017051	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	383489132
22	NC_017051	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	383489133
23	NC_017051	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	383489133
24	NC_017051	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	383489133
25	NC_017051	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	383489133
26	NC_017051	TAAT	2	8	12446	12453	50 %	50 %	0 %	0 %	383489135
27	NC_017051	GCTT	2	8	12461	12468	0 %	50 %	25 %	25 %	383489135
28	NC_017051	AATA	2	8	13374	13381	75 %	25 %	0 %	0 %	383489136
29	NC_017051	GCTC	2	8	13578	13585	0 %	25 %	25 %	50 %	383489136
30	NC_017051	TAAG	2	8	15230	15237	50 %	25 %	25 %	0 %	383489137
31	NC_017051	AATA	2	8	15660	15667	75 %	25 %	0 %	0 %	383489137
32	NC_017051	GTAA	2	8	15808	15815	50 %	25 %	25 %	0 %	383489137
33	NC_017051	AGCA	2	8	16090	16097	50 %	0 %	25 %	25 %	383489138
34	NC_017051	AATT	2	8	16703	16710	50 %	50 %	0 %	0 %	383489138
35	NC_017051	AAAG	2	8	17173	17180	75 %	0 %	25 %	0 %	383489138
36	NC_017051	ATTC	2	8	17266	17273	25 %	50 %	0 %	25 %	383489138
37	NC_017051	TTCA	2	8	18318	18325	25 %	50 %	0 %	25 %	383489139
38	NC_017051	TAAA	2	8	18957	18964	75 %	25 %	0 %	0 %	383489139
39	NC_017051	TGAT	2	8	21848	21855	25 %	50 %	25 %	0 %	383489142
40	NC_017051	ATAC	2	8	22474	22481	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
41	NC_017051	AACT	2	8	22662	22669	50 %	25 %	0 %	25 %	383489144
42	NC_017051	AAAT	2	8	22896	22903	75 %	25 %	0 %	0 %	383489144
43	NC_017051	CACT	2	8	22992	22999	25 %	25 %	0 %	50 %	383489144
44	NC_017051	AAGT	2	8	23045	23052	50 %	25 %	25 %	0 %	383489144
45	NC_017051	ATTA	2	8	23427	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	383489145
46	NC_017051	AAAT	2	8	25635	25642	75 %	25 %	0 %	0 %	383489147
47	NC_017051	TTAA	2	8	27111	27118	50 %	50 %	0 %	0 %	383489148
48	NC_017051	TAGT	2	8	27274	27281	25 %	50 %	25 %	0 %	383489148
49	NC_017051	ATTT	2	8	27293	27300	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
50	NC_017051	TTGC	2	8	27568	27575	0 %	50 %	25 %	25 %	383489148
51	NC_017051	ATTT	2	8	27718	27725	25 %	75 %	0 %	0 %	383489148
52	NC_017051	TTCC	2	8	27808	27815	0 %	50 %	0 %	50 %	383489148
53	NC_017051	GCTT	2	8	27946	27953	0 %	50 %	25 %	25 %	383489148
54	NC_017051	TATT	2	8	32715	32722	25 %	75 %	0 %	0 %	383489150
55	NC_017051	ATTT	2	8	32856	32863	25 %	75 %	0 %	0 %	383489150
56	NC_017051	ATTT	2	8	33296	33303	25 %	75 %	0 %	0 %	383489151
57	NC_017051	AAAT	2	8	33320	33327	75 %	25 %	0 %	0 %	383489151
58	NC_017051	ATAA	2	8	33796	33803	75 %	25 %	0 %	0 %	383489151
59	NC_017051	AGCA	2	8	34284	34291	50 %	0 %	25 %	25 %	383489152
60	NC_017051	TTTC	2	8	34952	34959	0 %	75 %	0 %	25 %	383489153
61	NC_017051	ATTT	2	8	35817	35824	25 %	75 %	0 %	0 %	383489153
62	NC_017051	TTGA	2	8	36659	36666	25 %	50 %	25 %	0 %	383489154
63	NC_017051	AGTA	2	8	36778	36785	50 %	25 %	25 %	0 %	383489154
64	NC_017051	TACT	2	8	37128	37135	25 %	50 %	0 %	25 %	383489154
65	NC_017051	TAAA	2	8	38591	38598	75 %	25 %	0 %	0 %	383489155
66	NC_017051	GAGT	2	8	39885	39892	25 %	25 %	50 %	0 %	383489155
67	NC_017051	ATTA	2	8	42010	42017	50 %	50 %	0 %	0 %	383489156
68	NC_017051	ACTT	2	8	42958	42965	25 %	50 %	0 %	25 %	383489157
69	NC_017051	AATA	2	8	43447	43454	75 %	25 %	0 %	0 %	383489157
70	NC_017051	TAAA	2	8	43503	43510	75 %	25 %	0 %	0 %	383489157
71	NC_017051	AAAC	2	8	43800	43807	75 %	0 %	0 %	25 %	383489157
72	NC_017051	ATTT	3	12	43815	43826	25 %	75 %	0 %	0 %	383489157
73	NC_017051	TTTA	2	8	44002	44009	25 %	75 %	0 %	0 %	383489157
74	NC_017051	AGAA	2	8	45038	45045	75 %	0 %	25 %	0 %	383489158
75	NC_017051	AAAG	2	8	45418	45425	75 %	0 %	25 %	0 %	383489159
76	NC_017051	TAAA	2	8	45485	45492	75 %	25 %	0 %	0 %	383489159
77	NC_017051	AAGA	2	8	46463	46470	75 %	0 %	25 %	0 %	383489161
78	NC_017051	TAAT	2	8	46970	46977	50 %	50 %	0 %	0 %	383489161
79	NC_017051	ATTA	2	8	47046	47053	50 %	50 %	0 %	0 %	383489161
80	NC_017051	TTAT	2	8	47241	47248	25 %	75 %	0 %	0 %	383489161
81	NC_017051	GAAT	2	8	47818	47825	50 %	25 %	25 %	0 %	383489162
82	NC_017051	CTTA	2	8	48092	48099	25 %	50 %	0 %	25 %	383489162
83	NC_017051	ATGG	2	8	48372	48379	25 %	25 %	50 %	0 %	383489162
84	NC_017051	TATG	2	8	49100	49107	25 %	50 %	25 %	0 %	383489162
85	NC_017051	GCTA	2	8	51871	51878	25 %	25 %	25 %	25 %	383489164
86	NC_017051	AATT	2	8	51967	51974	50 %	50 %	0 %	0 %	383489164
87	NC_017051	CGAC	2	8	51990	51997	25 %	0 %	25 %	50 %	383489164
88	NC_017051	AAAT	2	8	52064	52071	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
89	NC_017051	ATAA	2	8	52427	52434	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
90	NC_017051	ATAA	2	8	52756	52763	75 %	25 %	0 %	0 %	383489165
91	NC_017051	TGTT	2	8	53035	53042	0 %	75 %	25 %	0 %	383489166
92	NC_017051	TTAA	2	8	53073	53080	50 %	50 %	0 %	0 %	383489166
93	NC_017051	TTAT	2	8	53171	53178	25 %	75 %	0 %	0 %	383489166
94	NC_017051	AACT	2	8	53560	53567	50 %	25 %	0 %	25 %	383489166
95	NC_017051	TAAT	2	8	54311	54318	50 %	50 %	0 %	0 %	383489167
96	NC_017051	TTGG	2	8	54356	54363	0 %	50 %	50 %	0 %	383489167
97	NC_017051	TAAA	2	8	54434	54441	75 %	25 %	0 %	0 %	383489167
98	NC_017051	TAGT	2	8	54677	54684	25 %	50 %	25 %	0 %	383489167
99	NC_017051	ATTT	2	8	54767	54774	25 %	75 %	0 %	0 %	383489167
100	NC_017051	TAAG	2	8	55034	55041	50 %	25 %	25 %	0 %	383489167
101	NC_017051	TGTA	2	8	55637	55644	25 %	50 %	25 %	0 %	383489167
102	NC_017051	ATCT	2	8	55688	55695	25 %	50 %	0 %	25 %	383489167
103	NC_017051	TTAT	2	8	55879	55886	25 %	75 %	0 %	0 %	383489167
104	NC_017051	TAAT	2	8	55974	55981	50 %	50 %	0 %	0 %	383489167
105	NC_017051	TAGT	2	8	56290	56297	25 %	50 %	25 %	0 %	383489168
106	NC_017051	ATAG	2	8	57265	57272	50 %	25 %	25 %	0 %	383489170
107	NC_017051	TCTT	2	8	57481	57488	0 %	75 %	0 %	25 %	383489170
108	NC_017051	TATT	2	8	58688	58695	25 %	75 %	0 %	0 %	383489171
109	NC_017051	AAGA	2	8	59349	59356	75 %	0 %	25 %	0 %	383489172
110	NC_017051	GATG	2	8	60023	60030	25 %	25 %	50 %	0 %	383489172
111	NC_017051	TAAA	2	8	60764	60771	75 %	25 %	0 %	0 %	383489172
112	NC_017051	TAAA	2	8	60788	60795	75 %	25 %	0 %	0 %	383489172
113	NC_017051	TTGG	2	8	61064	61071	0 %	50 %	50 %	0 %	383489173
114	NC_017051	TCAA	2	8	61257	61264	50 %	25 %	0 %	25 %	383489173
115	NC_017051	CTCA	2	8	61291	61298	25 %	25 %	0 %	50 %	383489173
116	NC_017051	TGTT	2	8	61617	61624	0 %	75 %	25 %	0 %	383489173
117	NC_017051	TGTT	2	8	61634	61641	0 %	75 %	25 %	0 %	383489173
118	NC_017051	TATG	2	8	61826	61833	25 %	50 %	25 %	0 %	383489173
119	NC_017051	TGCC	2	8	63257	63264	0 %	25 %	25 %	50 %	383489175
120	NC_017051	AAAT	2	8	63800	63807	75 %	25 %	0 %	0 %	383489175
121	NC_017051	TGAT	2	8	63983	63990	25 %	50 %	25 %	0 %	383489175
122	NC_017051	ATTT	2	8	64412	64419	25 %	75 %	0 %	0 %	383489175
123	NC_017051	ATTT	2	8	64582	64589	25 %	75 %	0 %	0 %	383489175
124	NC_017051	AAGT	2	8	64842	64849	50 %	25 %	25 %	0 %	383489176
125	NC_017051	TAAT	2	8	64923	64930	50 %	50 %	0 %	0 %	383489176
126	NC_017051	TGGT	2	8	66990	66997	0 %	50 %	50 %	0 %	383489179
127	NC_017051	AAAC	2	8	67035	67042	75 %	0 %	0 %	25 %	383489179
128	NC_017051	ATGG	2	8	67377	67384	25 %	25 %	50 %	0 %	383489179
129	NC_017051	TGCT	2	8	67413	67420	0 %	50 %	25 %	25 %	383489179
130	NC_017051	ATCA	2	8	68145	68152	50 %	25 %	0 %	25 %	383489179
131	NC_017051	TAGA	2	8	68481	68488	50 %	25 %	25 %	0 %	383489179
132	NC_017051	AAAT	2	8	68792	68799	75 %	25 %	0 %	0 %	383489180
133	NC_017051	TTTA	2	8	68801	68808	25 %	75 %	0 %	0 %	383489180
134	NC_017051	ATTT	2	8	69130	69137	25 %	75 %	0 %	0 %	383489181
135	NC_017051	TGCT	2	8	71931	71938	0 %	50 %	25 %	25 %	383489183
136	NC_017051	AATG	2	8	72257	72264	50 %	25 %	25 %	0 %	383489183
137	NC_017051	TTAT	2	8	72651	72658	25 %	75 %	0 %	0 %	383489183
138	NC_017051	GAAA	2	8	72712	72719	75 %	0 %	25 %	0 %	383489183
139	NC_017051	TAAA	2	8	72723	72730	75 %	25 %	0 %	0 %	383489183
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