MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383488281
2	NC_017050	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383488282
3	NC_017050	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383488282
4	NC_017050	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383488283
5	NC_017050	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383488283
6	NC_017050	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383488283
7	NC_017050	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383488283
8	NC_017050	AATAC	2	10	6936	6945	60 %	20 %	0 %	20 %	383488284
9	NC_017050	AAACC	2	10	8105	8114	60 %	0 %	0 %	40 %	383488286
10	NC_017050	TGACT	2	10	8808	8817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017050	GATAC	2	10	8992	9001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017050	ATTTA	2	10	9351	9360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017050	TTAAT	2	10	10608	10617	40 %	60 %	0 %	0 %	383488287
14	NC_017050	ACAAT	2	10	11057	11066	60 %	20 %	0 %	20 %	383488288
15	NC_017050	TAAAC	2	10	14641	14650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017050	TCAAT	2	10	15892	15901	40 %	40 %	0 %	20 %	383488292
17	NC_017050	AATCA	2	10	16115	16124	60 %	20 %	0 %	20 %	383488293
18	NC_017050	TTACT	2	10	17214	17223	20 %	60 %	0 %	20 %	383488293
19	NC_017050	AGATA	2	10	18449	18458	60 %	20 %	20 %	0 %	383488294
20	NC_017050	TCAAA	2	10	18479	18488	60 %	20 %	0 %	20 %	383488294
21	NC_017050	ATTTA	2	10	19317	19326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017050	AGTTT	2	10	19515	19524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017050	TATAA	2	10	19748	19757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017050	AATCT	2	10	20557	20566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017050	TAAAA	2	10	20918	20927	80 %	20 %	0 %	0 %	383488295
26	NC_017050	TTTGT	2	10	21430	21439	0 %	80 %	20 %	0 %	383488296
27	NC_017050	TAAAT	2	10	21621	21630	60 %	40 %	0 %	0 %	383488296
28	NC_017050	TTTGT	2	10	21938	21947	0 %	80 %	20 %	0 %	383488297
29	NC_017050	AATAA	2	10	22871	22880	80 %	20 %	0 %	0 %	383488299
30	NC_017050	CTATA	2	10	23530	23539	40 %	40 %	0 %	20 %	383488301
31	NC_017050	TAATA	2	10	23753	23762	60 %	40 %	0 %	0 %	383488301
32	NC_017050	CCATA	2	10	27814	27823	40 %	20 %	0 %	40 %	383488304
33	NC_017050	TTGAG	2	10	28477	28486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017050	ATTTT	2	10	29198	29207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017050	TATTT	2	10	29774	29783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017050	GTTTC	2	10	30292	30301	0 %	60 %	20 %	20 %	383488305
37	NC_017050	ATATT	2	10	31060	31069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017050	ATTAA	2	10	31692	31701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017050	CTTAA	2	10	32046	32055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017050	ATTTA	2	10	32183	32192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017050	AAATT	2	10	32766	32775	60 %	40 %	0 %	0 %	383488306
42	NC_017050	TTTTA	2	10	33596	33605	20 %	80 %	0 %	0 %	383488307
43	NC_017050	TTGAT	2	10	39547	39556	20 %	60 %	20 %	0 %	383488311
44	NC_017050	AATTG	2	10	39581	39590	40 %	40 %	20 %	0 %	383488311
45	NC_017050	ATATG	2	10	39740	39749	40 %	40 %	20 %	0 %	383488311
46	NC_017050	ATTAT	2	10	40647	40656	40 %	60 %	0 %	0 %	383488311
47	NC_017050	GTATT	2	10	41418	41427	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017050	ATAAC	2	10	43772	43781	60 %	20 %	0 %	20 %	383488313
49	NC_017050	TAACA	2	10	44001	44010	60 %	20 %	0 %	20 %	383488313
50	NC_017050	TTTAA	2	10	44137	44146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017050	AATTG	2	10	46049	46058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017050	AATAT	2	10	46180	46189	60 %	40 %	0 %	0 %	383488317
53	NC_017050	TACCT	2	10	47321	47330	20 %	40 %	0 %	40 %	383488317
54	NC_017050	TGGTA	2	10	48841	48850	20 %	40 %	40 %	0 %	383488318
55	NC_017050	AAATT	2	10	50892	50901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017050	AACTA	2	10	51741	51750	60 %	20 %	0 %	20 %	383488320
57	NC_017050	ACTTT	2	10	53179	53188	20 %	60 %	0 %	20 %	383488322
58	NC_017050	TTAAA	2	10	54096	54105	60 %	40 %	0 %	0 %	383488322
59	NC_017050	AATAT	2	10	54148	54157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017050	CAAGT	2	10	54478	54487	40 %	20 %	20 %	20 %	383488323
61	NC_017050	CTATG	2	10	55325	55334	20 %	40 %	20 %	20 %	383488323
62	NC_017050	GCTAA	2	10	56336	56345	40 %	20 %	20 %	20 %	383488324
63	NC_017050	TTTAC	2	10	58686	58695	20 %	60 %	0 %	20 %	383488327
64	NC_017050	AGCAT	2	10	58711	58720	40 %	20 %	20 %	20 %	383488327
65	NC_017050	GGGTT	2	10	60272	60281	0 %	40 %	60 %	0 %	383488328
66	NC_017050	TTTAT	2	10	60648	60657	20 %	80 %	0 %	0 %	383488328
67	NC_017050	GTTTT	2	10	61839	61848	0 %	80 %	20 %	0 %	383488329
68	NC_017050	ACAAT	2	10	62319	62328	60 %	20 %	0 %	20 %	383488330
69	NC_017050	TTTTC	2	10	62707	62716	0 %	80 %	0 %	20 %	383488330
70	NC_017050	CAATG	2	10	65599	65608	40 %	20 %	20 %	20 %	383488333
71	NC_017050	ATAAA	2	10	66014	66023	80 %	20 %	0 %	0 %	383488334
72	NC_017050	TAAAT	2	10	66420	66429	60 %	40 %	0 %	0 %	383488334
73	NC_017050	ATTAA	2	10	66768	66777	60 %	40 %	0 %	0 %	383488334
74	NC_017050	ATATT	2	10	69951	69960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017050	TAACA	2	10	70252	70261	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017050	AATGA	2	10	70294	70303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017050	ACAAA	2	10	71896	71905	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017050	TTAAT	2	10	74807	74816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017050	TGAAA	2	10	77661	77670	60 %	20 %	20 %	0 %	383488342
80	NC_017050	TTGAT	2	10	78988	78997	20 %	60 %	20 %	0 %	383488343
81	NC_017050	ATATA	2	10	79623	79632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017050	TTGTA	2	10	79744	79753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017050	AAAAT	2	10	80511	80520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017050	ATTTA	2	10	80834	80843	40 %	60 %	0 %	0 %	383488345
85	NC_017050	TTAGT	2	10	85830	85839	20 %	60 %	20 %	0 %	383488351
86	NC_017050	TTAAT	2	10	88041	88050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017050	TTATT	2	10	89062	89071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017050	TTAAC	2	10	89086	89095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017050	ATATT	2	10	89329	89338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017050	TCTTT	2	10	90169	90178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017050	TTTAA	2	10	90580	90589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017050	TCCTT	2	10	91054	91063	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017050	ATTGT	2	10	91132	91141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017050	TACTT	2	10	93551	93560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017050	TTATG	2	10	94483	94492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017050	TTATG	2	10	96414	96423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017050	AGTTA	2	10	96455	96464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017050	TCTAT	2	10	98527	98536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017050	ATAAA	2	10	101048	101057	80 %	20 %	0 %	0 %	383488358
100	NC_017050	TATAA	2	10	101082	101091	60 %	40 %	0 %	0 %	383488358
101	NC_017050	TAAAA	2	10	103299	103308	80 %	20 %	0 %	0 %	383488361
102	NC_017050	AAAAC	2	10	103995	104004	80 %	0 %	0 %	20 %	383488361
103	NC_017050	TTTAA	2	10	104071	104080	40 %	60 %	0 %	0 %	383488361
104	NC_017050	TGAAA	2	10	105521	105530	60 %	20 %	20 %	0 %	383488363
105	NC_017050	CTTGT	2	10	108289	108298	0 %	60 %	20 %	20 %	383488365
106	NC_017050	ATGAT	2	10	109206	109215	40 %	40 %	20 %	0 %	383488366
107	NC_017050	TTAAT	2	10	109882	109891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017050	ATTTT	2	10	109936	109945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017050	TTATT	2	10	110105	110114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017050	AGTAG	2	10	111877	111886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017050	CACTA	2	10	112138	112147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017050	AATAC	2	10	112282	112291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017050	AAATC	2	10	112416	112425	60 %	20 %	0 %	20 %	383488370
114	NC_017050	TTATA	2	10	113722	113731	40 %	60 %	0 %	0 %	383488371
115	NC_017050	GTAAT	2	10	113860	113869	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017050	TGCTT	2	10	114227	114236	0 %	60 %	20 %	20 %	383488372
117	NC_017050	TTTTA	2	10	115344	115353	20 %	80 %	0 %	0 %	383488372
118	NC_017050	GCTTT	2	10	116920	116929	0 %	60 %	20 %	20 %	383488373
119	NC_017050	TATGT	2	10	117573	117582	20 %	60 %	20 %	0 %	383488373
120	NC_017050	TCTAC	2	10	117918	117927	20 %	40 %	0 %	40 %	383488373
121	NC_017050	AGAAA	2	10	119444	119453	80 %	0 %	20 %	0 %	383488373
122	NC_017050	GTTTT	2	10	120129	120138	0 %	80 %	20 %	0 %	383488374
123	NC_017050	TGCAG	2	10	120462	120471	20 %	20 %	40 %	20 %	383488374
124	NC_017050	GGTAT	2	10	121159	121168	20 %	40 %	40 %	0 %	383488374
125	NC_017050	ATCTA	2	10	122337	122346	40 %	40 %	0 %	20 %	383488375
126	NC_017050	GTTTG	2	10	122768	122777	0 %	60 %	40 %	0 %	383488375
127	NC_017050	ACAAG	2	10	124723	124732	60 %	0 %	20 %	20 %	383488375
128	NC_017050	AGTTT	2	10	125034	125043	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
129	NC_017050	TTAGT	2	10	125557	125566	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
130	NC_017050	GTTAT	2	10	126958	126967	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
131	NC_017050	ATGGT	2	10	128099	128108	20 %	40 %	40 %	0 %	383488377
132	NC_017050	TATTT	2	10	129033	129042	20 %	80 %	0 %	0 %	383488377
133	NC_017050	CAAAG	2	10	129425	129434	60 %	0 %	20 %	20 %	383488377
134	NC_017050	GAACA	2	10	129835	129844	60 %	0 %	20 %	20 %	383488377
135	NC_017050	TGATA	2	10	130811	130820	40 %	40 %	20 %	0 %	383488377
136	NC_017050	TGTAT	2	10	135478	135487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017050	TTTAA	2	10	136543	136552	40 %	60 %	0 %	0 %	383488383
138	NC_017050	GGTTT	2	10	137661	137670	0 %	60 %	40 %	0 %	383488384
139	NC_017050	TATGT	2	10	141768	141777	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017050	ATTAA	2	10	142019	142028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017050	TATCA	2	10	143538	143547	40 %	40 %	0 %	20 %	383488389
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