MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383488281
2	NC_017050	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383488282
3	NC_017050	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383488282
4	NC_017050	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383488283
5	NC_017050	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383488283
6	NC_017050	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383488283
7	NC_017050	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383488283
8	NC_017050	AATAC	2	10	6936	6945	60 %	20 %	0 %	20 %	383488284
9	NC_017050	AAACC	2	10	8105	8114	60 %	0 %	0 %	40 %	383488286
10	NC_017050	TTAAT	2	10	10608	10617	40 %	60 %	0 %	0 %	383488287
11	NC_017050	ACAAT	2	10	11057	11066	60 %	20 %	0 %	20 %	383488288
12	NC_017050	TCAAT	2	10	15892	15901	40 %	40 %	0 %	20 %	383488292
13	NC_017050	AATCA	2	10	16115	16124	60 %	20 %	0 %	20 %	383488293
14	NC_017050	TTACT	2	10	17214	17223	20 %	60 %	0 %	20 %	383488293
15	NC_017050	AGATA	2	10	18449	18458	60 %	20 %	20 %	0 %	383488294
16	NC_017050	TCAAA	2	10	18479	18488	60 %	20 %	0 %	20 %	383488294
17	NC_017050	TAAAA	2	10	20918	20927	80 %	20 %	0 %	0 %	383488295
18	NC_017050	TTTGT	2	10	21430	21439	0 %	80 %	20 %	0 %	383488296
19	NC_017050	TAAAT	2	10	21621	21630	60 %	40 %	0 %	0 %	383488296
20	NC_017050	TTTGT	2	10	21938	21947	0 %	80 %	20 %	0 %	383488297
21	NC_017050	AATAA	2	10	22871	22880	80 %	20 %	0 %	0 %	383488299
22	NC_017050	CTATA	2	10	23530	23539	40 %	40 %	0 %	20 %	383488301
23	NC_017050	TAATA	2	10	23753	23762	60 %	40 %	0 %	0 %	383488301
24	NC_017050	CCATA	2	10	27814	27823	40 %	20 %	0 %	40 %	383488304
25	NC_017050	GTTTC	2	10	30292	30301	0 %	60 %	20 %	20 %	383488305
26	NC_017050	AAATT	2	10	32766	32775	60 %	40 %	0 %	0 %	383488306
27	NC_017050	TTTTA	2	10	33596	33605	20 %	80 %	0 %	0 %	383488307
28	NC_017050	TTGAT	2	10	39547	39556	20 %	60 %	20 %	0 %	383488311
29	NC_017050	AATTG	2	10	39581	39590	40 %	40 %	20 %	0 %	383488311
30	NC_017050	ATATG	2	10	39740	39749	40 %	40 %	20 %	0 %	383488311
31	NC_017050	ATTAT	2	10	40647	40656	40 %	60 %	0 %	0 %	383488311
32	NC_017050	ATAAC	2	10	43772	43781	60 %	20 %	0 %	20 %	383488313
33	NC_017050	TAACA	2	10	44001	44010	60 %	20 %	0 %	20 %	383488313
34	NC_017050	AATAT	2	10	46180	46189	60 %	40 %	0 %	0 %	383488317
35	NC_017050	TACCT	2	10	47321	47330	20 %	40 %	0 %	40 %	383488317
36	NC_017050	TGGTA	2	10	48841	48850	20 %	40 %	40 %	0 %	383488318
37	NC_017050	AACTA	2	10	51741	51750	60 %	20 %	0 %	20 %	383488320
38	NC_017050	ACTTT	2	10	53179	53188	20 %	60 %	0 %	20 %	383488322
39	NC_017050	TTAAA	2	10	54096	54105	60 %	40 %	0 %	0 %	383488322
40	NC_017050	CAAGT	2	10	54478	54487	40 %	20 %	20 %	20 %	383488323
41	NC_017050	CTATG	2	10	55325	55334	20 %	40 %	20 %	20 %	383488323
42	NC_017050	GCTAA	2	10	56336	56345	40 %	20 %	20 %	20 %	383488324
43	NC_017050	TTTAC	2	10	58686	58695	20 %	60 %	0 %	20 %	383488327
44	NC_017050	AGCAT	2	10	58711	58720	40 %	20 %	20 %	20 %	383488327
45	NC_017050	GGGTT	2	10	60272	60281	0 %	40 %	60 %	0 %	383488328
46	NC_017050	TTTAT	2	10	60648	60657	20 %	80 %	0 %	0 %	383488328
47	NC_017050	GTTTT	2	10	61839	61848	0 %	80 %	20 %	0 %	383488329
48	NC_017050	ACAAT	2	10	62319	62328	60 %	20 %	0 %	20 %	383488330
49	NC_017050	TTTTC	2	10	62707	62716	0 %	80 %	0 %	20 %	383488330
50	NC_017050	CAATG	2	10	65599	65608	40 %	20 %	20 %	20 %	383488333
51	NC_017050	ATAAA	2	10	66014	66023	80 %	20 %	0 %	0 %	383488334
52	NC_017050	TAAAT	2	10	66420	66429	60 %	40 %	0 %	0 %	383488334
53	NC_017050	ATTAA	2	10	66768	66777	60 %	40 %	0 %	0 %	383488334
54	NC_017050	TGAAA	2	10	77661	77670	60 %	20 %	20 %	0 %	383488342
55	NC_017050	TTGAT	2	10	78988	78997	20 %	60 %	20 %	0 %	383488343
56	NC_017050	ATTTA	2	10	80834	80843	40 %	60 %	0 %	0 %	383488345
57	NC_017050	TTAGT	2	10	85830	85839	20 %	60 %	20 %	0 %	383488351
58	NC_017050	ATAAA	2	10	101048	101057	80 %	20 %	0 %	0 %	383488358
59	NC_017050	TATAA	2	10	101082	101091	60 %	40 %	0 %	0 %	383488358
60	NC_017050	TAAAA	2	10	103299	103308	80 %	20 %	0 %	0 %	383488361
61	NC_017050	AAAAC	2	10	103995	104004	80 %	0 %	0 %	20 %	383488361
62	NC_017050	TTTAA	2	10	104071	104080	40 %	60 %	0 %	0 %	383488361
63	NC_017050	TGAAA	2	10	105521	105530	60 %	20 %	20 %	0 %	383488363
64	NC_017050	CTTGT	2	10	108289	108298	0 %	60 %	20 %	20 %	383488365
65	NC_017050	ATGAT	2	10	109206	109215	40 %	40 %	20 %	0 %	383488366
66	NC_017050	AAATC	2	10	112416	112425	60 %	20 %	0 %	20 %	383488370
67	NC_017050	TTATA	2	10	113722	113731	40 %	60 %	0 %	0 %	383488371
68	NC_017050	TGCTT	2	10	114227	114236	0 %	60 %	20 %	20 %	383488372
69	NC_017050	TTTTA	2	10	115344	115353	20 %	80 %	0 %	0 %	383488372
70	NC_017050	GCTTT	2	10	116920	116929	0 %	60 %	20 %	20 %	383488373
71	NC_017050	TATGT	2	10	117573	117582	20 %	60 %	20 %	0 %	383488373
72	NC_017050	TCTAC	2	10	117918	117927	20 %	40 %	0 %	40 %	383488373
73	NC_017050	AGAAA	2	10	119444	119453	80 %	0 %	20 %	0 %	383488373
74	NC_017050	GTTTT	2	10	120129	120138	0 %	80 %	20 %	0 %	383488374
75	NC_017050	TGCAG	2	10	120462	120471	20 %	20 %	40 %	20 %	383488374
76	NC_017050	GGTAT	2	10	121159	121168	20 %	40 %	40 %	0 %	383488374
77	NC_017050	ATCTA	2	10	122337	122346	40 %	40 %	0 %	20 %	383488375
78	NC_017050	GTTTG	2	10	122768	122777	0 %	60 %	40 %	0 %	383488375
79	NC_017050	ACAAG	2	10	124723	124732	60 %	0 %	20 %	20 %	383488375
80	NC_017050	AGTTT	2	10	125034	125043	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
81	NC_017050	TTAGT	2	10	125557	125566	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
82	NC_017050	GTTAT	2	10	126958	126967	20 %	60 %	20 %	0 %	383488376
83	NC_017050	ATGGT	2	10	128099	128108	20 %	40 %	40 %	0 %	383488377
84	NC_017050	TATTT	2	10	129033	129042	20 %	80 %	0 %	0 %	383488377
85	NC_017050	CAAAG	2	10	129425	129434	60 %	0 %	20 %	20 %	383488377
86	NC_017050	GAACA	2	10	129835	129844	60 %	0 %	20 %	20 %	383488377
87	NC_017050	TGATA	2	10	130811	130820	40 %	40 %	20 %	0 %	383488377
88	NC_017050	TTTAA	2	10	136543	136552	40 %	60 %	0 %	0 %	383488383
89	NC_017050	GGTTT	2	10	137661	137670	0 %	60 %	40 %	0 %	383488384
90	NC_017050	TATCA	2	10	143538	143547	40 %	40 %	0 %	20 %	383488389
91	NC_017050	TAGCT	2	10	143625	143634	20 %	40 %	20 %	20 %	383488389
92	NC_017050	TTATT	2	10	144487	144496	20 %	80 %	0 %	0 %	383488390
93	NC_017050	ATTTT	2	10	145283	145292	20 %	80 %	0 %	0 %	383488391
94	NC_017050	ACAAA	2	10	148886	148895	80 %	0 %	0 %	20 %	383488394
95	NC_017050	TAAAA	2	10	149403	149412	80 %	20 %	0 %	0 %	383488395
96	NC_017050	TGGTG	2	10	149537	149546	0 %	40 %	60 %	0 %	383488395
97	NC_017050	TATAA	2	10	150454	150463	60 %	40 %	0 %	0 %	383488397
98	NC_017050	AAGAA	2	10	152046	152055	80 %	0 %	20 %	0 %	383488397
99	NC_017050	TGGAT	2	10	154235	154244	20 %	40 %	40 %	0 %	383488401
100	NC_017050	ACAGA	2	10	156768	156777	60 %	0 %	20 %	20 %	383488403
101	NC_017050	GCAAA	2	10	158903	158912	60 %	0 %	20 %	20 %	383488406
102	NC_017050	TGAAG	2	10	167371	167380	40 %	20 %	40 %	0 %	383488409
103	NC_017050	TATAC	2	10	167978	167987	40 %	40 %	0 %	20 %	383488409
104	NC_017050	GTAGA	2	10	168387	168396	40 %	20 %	40 %	0 %	383488409
105	NC_017050	ACTAA	2	10	177292	177301	60 %	20 %	0 %	20 %	383488414
106	NC_017050	ATATT	2	10	178432	178441	40 %	60 %	0 %	0 %	383488415
107	NC_017050	ATACC	2	10	182995	183004	40 %	20 %	0 %	40 %	383488419
108	NC_017050	ATATA	2	10	186258	186267	60 %	40 %	0 %	0 %	383488423
109	NC_017050	AATTT	2	10	186268	186277	40 %	60 %	0 %	0 %	383488423
110	NC_017050	TTAAT	2	10	186300	186309	40 %	60 %	0 %	0 %	383488424
111	NC_017050	AAAAC	2	10	186688	186697	80 %	0 %	0 %	20 %	383488424
112	NC_017050	AAAGT	2	10	187010	187019	60 %	20 %	20 %	0 %	383488424
113	NC_017050	AATAA	2	10	187576	187585	80 %	20 %	0 %	0 %	383488424
114	NC_017050	AAATT	2	10	189698	189707	60 %	40 %	0 %	0 %	383488426
115	NC_017050	AGAAA	2	10	190439	190448	80 %	0 %	20 %	0 %	383488426
116	NC_017050	AGCTA	2	10	190561	190570	40 %	20 %	20 %	20 %	383488426
117	NC_017050	TTTAT	2	10	190712	190721	20 %	80 %	0 %	0 %	383488426
118	NC_017050	AAGTG	2	10	191551	191560	40 %	20 %	40 %	0 %	383488426
119	NC_017050	CAATA	2	10	192998	193007	60 %	20 %	0 %	20 %	383488427
120	NC_017050	GAGTT	2	10	194043	194052	20 %	40 %	40 %	0 %	383488429
121	NC_017050	AGGTT	2	10	195459	195468	20 %	40 %	40 %	0 %	383488430
122	NC_017050	TATTG	2	10	197020	197029	20 %	60 %	20 %	0 %	383488432
123	NC_017050	CCAAA	2	10	197164	197173	60 %	0 %	0 %	40 %	383488432
124	NC_017050	GGTTC	2	10	202316	202325	0 %	40 %	40 %	20 %	383488437
125	NC_017050	TATCA	2	10	205901	205910	40 %	40 %	0 %	20 %	383488440
126	NC_017050	CATCT	2	10	207221	207230	20 %	40 %	0 %	40 %	383488440
127	NC_017050	AATAA	2	10	208232	208241	80 %	20 %	0 %	0 %	383488441
128	NC_017050	TTTGA	2	10	208469	208478	20 %	60 %	20 %	0 %	383488441
129	NC_017050	TAATT	2	10	208618	208627	40 %	60 %	0 %	0 %	383488441
130	NC_017050	GCTAG	2	10	208721	208730	20 %	20 %	40 %	20 %	383488441
131	NC_017050	TTGCT	2	10	210901	210910	0 %	60 %	20 %	20 %	383488442
132	NC_017050	TACCA	2	10	212457	212466	40 %	20 %	0 %	40 %	383488444
133	NC_017050	CACAT	2	10	213530	213539	40 %	20 %	0 %	40 %	383488445
134	NC_017050	TGCCA	2	10	216056	216065	20 %	20 %	20 %	40 %	383488446
135	NC_017050	TATTT	2	10	219194	219203	20 %	80 %	0 %	0 %	383488448
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