MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 3487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383488279
2	NC_017050	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383488279
3	NC_017050	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017050	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017050	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383488281
6	NC_017050	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383488282
7	NC_017050	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383488282
8	NC_017050	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383488282
9	NC_017050	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383488282
10	NC_017050	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383488283
11	NC_017050	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383488283
12	NC_017050	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383488283
13	NC_017050	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383488283
14	NC_017050	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017050	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017050	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017050	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	383488284
18	NC_017050	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	383488284
19	NC_017050	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	383488284
20	NC_017050	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	383488284
21	NC_017050	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	383488286
22	NC_017050	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017050	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017050	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017050	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017050	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	383488287
27	NC_017050	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	383488287
28	NC_017050	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	383488287
29	NC_017050	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	383488287
30	NC_017050	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	383488287
31	NC_017050	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	383488288
32	NC_017050	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	383488288
33	NC_017050	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	383488288
34	NC_017050	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	383488288
35	NC_017050	TAAT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	383488290
36	NC_017050	GCTT	2	8	12447	12454	0 %	50 %	25 %	25 %	383488290
37	NC_017050	AATA	2	8	13360	13367	75 %	25 %	0 %	0 %	383488291
38	NC_017050	GCTC	2	8	13564	13571	0 %	25 %	25 %	50 %	383488291
39	NC_017050	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017050	ATTA	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017050	AAAG	2	8	14851	14858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017050	TTAT	2	8	15022	15029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017050	TAAG	2	8	15216	15223	50 %	25 %	25 %	0 %	383488292
44	NC_017050	AATA	2	8	15646	15653	75 %	25 %	0 %	0 %	383488292
45	NC_017050	GTAA	2	8	15794	15801	50 %	25 %	25 %	0 %	383488292
46	NC_017050	AGCA	2	8	16076	16083	50 %	0 %	25 %	25 %	383488293
47	NC_017050	AATT	2	8	16689	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	383488293
48	NC_017050	AAAG	2	8	17159	17166	75 %	0 %	25 %	0 %	383488293
49	NC_017050	ATTC	2	8	17252	17259	25 %	50 %	0 %	25 %	383488293
50	NC_017050	TTCA	2	8	18304	18311	25 %	50 %	0 %	25 %	383488294
51	NC_017050	TAAA	2	8	18943	18950	75 %	25 %	0 %	0 %	383488294
52	NC_017050	TATT	2	8	19387	19394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017050	GTAA	2	8	19561	19568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017050	TTAT	2	8	19639	19646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017050	TCAA	2	8	19671	19678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017050	GTAA	2	8	19840	19847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017050	ATAG	2	8	20075	20082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017050	ATTA	2	8	20179	20186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017050	ATCA	2	8	20740	20747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017050	AACA	2	8	21101	21108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017050	GTAT	2	8	21140	21147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017050	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	383488297
63	NC_017050	TAAT	2	8	22413	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017050	ATAC	2	8	22459	22466	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
65	NC_017050	AACT	2	8	22647	22654	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
66	NC_017050	AAAT	2	8	22881	22888	75 %	25 %	0 %	0 %	383488299
67	NC_017050	CACT	2	8	22977	22984	25 %	25 %	0 %	50 %	383488299
68	NC_017050	AAGT	2	8	23030	23037	50 %	25 %	25 %	0 %	383488299
69	NC_017050	ATTA	2	8	23412	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	383488300
70	NC_017050	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	383488301
71	NC_017050	TATT	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	383488301
72	NC_017050	TCTT	2	8	25028	25035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017050	AAAT	2	8	25619	25626	75 %	25 %	0 %	0 %	383488303
74	NC_017050	TAAA	2	8	26848	26855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017050	TTAA	2	8	27095	27102	50 %	50 %	0 %	0 %	383488304
76	NC_017050	TAGT	2	8	27258	27265	25 %	50 %	25 %	0 %	383488304
77	NC_017050	ATTT	2	8	27277	27284	25 %	75 %	0 %	0 %	383488304
78	NC_017050	TTGC	2	8	27552	27559	0 %	50 %	25 %	25 %	383488304
79	NC_017050	ATTT	2	8	27702	27709	25 %	75 %	0 %	0 %	383488304
80	NC_017050	TTCC	2	8	27792	27799	0 %	50 %	0 %	50 %	383488304
81	NC_017050	GCTT	2	8	27930	27937	0 %	50 %	25 %	25 %	383488304
82	NC_017050	ATTT	3	12	28762	28773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017050	TACA	2	8	28904	28911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017050	ATAA	2	8	29079	29086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017050	AATA	2	8	29709	29716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017050	TTTG	2	8	31030	31037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017050	ATTA	2	8	31240	31247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017050	ATAG	2	8	31379	31386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017050	TTTG	2	8	31469	31476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017050	ATTT	2	8	31795	31802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017050	TTCT	2	8	31837	31844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017050	AAAT	2	8	32598	32605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017050	TATT	2	8	32699	32706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017050	ATTT	2	8	32840	32847	25 %	75 %	0 %	0 %	383488306
95	NC_017050	ATTT	2	8	33280	33287	25 %	75 %	0 %	0 %	383488307
96	NC_017050	AAAT	2	8	33304	33311	75 %	25 %	0 %	0 %	383488307
97	NC_017050	ATAA	2	8	33780	33787	75 %	25 %	0 %	0 %	383488307
98	NC_017050	AGCA	2	8	34268	34275	50 %	0 %	25 %	25 %	383488308
99	NC_017050	TTTC	2	8	34936	34943	0 %	75 %	0 %	25 %	383488309
100	NC_017050	ATTT	2	8	35801	35808	25 %	75 %	0 %	0 %	383488309
101	NC_017050	TCGT	2	8	36080	36087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017050	AATC	2	8	36391	36398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017050	TGAT	2	8	36463	36470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017050	TTGA	2	8	36643	36650	25 %	50 %	25 %	0 %	383488310
105	NC_017050	AGTA	2	8	36762	36769	50 %	25 %	25 %	0 %	383488310
106	NC_017050	TACT	2	8	37112	37119	25 %	50 %	0 %	25 %	383488310
107	NC_017050	TCAA	2	8	37973	37980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017050	ATGT	2	8	38033	38040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017050	TTAA	2	8	38299	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017050	TTAT	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017050	TAAA	2	8	38575	38582	75 %	25 %	0 %	0 %	383488311
112	NC_017050	GAGT	2	8	39869	39876	25 %	25 %	50 %	0 %	383488311
113	NC_017050	AATA	2	8	41053	41060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017050	AAAT	2	8	41119	41126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017050	ATTA	2	8	41994	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	383488312
116	NC_017050	ACTT	2	8	42942	42949	25 %	50 %	0 %	25 %	383488313
117	NC_017050	AATA	2	8	43431	43438	75 %	25 %	0 %	0 %	383488313
118	NC_017050	TAAA	2	8	43487	43494	75 %	25 %	0 %	0 %	383488313
119	NC_017050	AAAC	2	8	43784	43791	75 %	0 %	0 %	25 %	383488313
120	NC_017050	ATTT	3	12	43799	43810	25 %	75 %	0 %	0 %	383488313
121	NC_017050	TTTA	2	8	43986	43993	25 %	75 %	0 %	0 %	383488313
122	NC_017050	TAAG	2	8	44378	44385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017050	GTTT	2	8	44770	44777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017050	AGAA	2	8	45022	45029	75 %	0 %	25 %	0 %	383488314
125	NC_017050	AAAG	2	8	45402	45409	75 %	0 %	25 %	0 %	383488315
126	NC_017050	TAAA	2	8	45469	45476	75 %	25 %	0 %	0 %	383488315
127	NC_017050	AAGA	2	8	46447	46454	75 %	0 %	25 %	0 %	383488317
128	NC_017050	TAAT	2	8	46954	46961	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
129	NC_017050	ATTA	2	8	47030	47037	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
130	NC_017050	TTAT	2	8	47225	47232	25 %	75 %	0 %	0 %	383488317
131	NC_017050	GAAT	2	8	47802	47809	50 %	25 %	25 %	0 %	383488318
132	NC_017050	CTTA	2	8	48076	48083	25 %	50 %	0 %	25 %	383488318
133	NC_017050	ATGG	2	8	48356	48363	25 %	25 %	50 %	0 %	383488318
134	NC_017050	TATG	2	8	49084	49091	25 %	50 %	25 %	0 %	383488318
135	NC_017050	TAAT	2	8	49477	49484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017050	GCTA	2	8	51855	51862	25 %	25 %	25 %	25 %	383488320
137	NC_017050	AATT	2	8	51951	51958	50 %	50 %	0 %	0 %	383488320
138	NC_017050	CGAC	2	8	51974	51981	25 %	0 %	25 %	50 %	383488320
139	NC_017050	AAAT	2	8	52048	52055	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
140	NC_017050	ATAA	2	8	52411	52418	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
141	NC_017050	ATAA	2	8	52740	52747	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
142	NC_017050	TAAT	2	8	52792	52799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017050	TGTT	2	8	53019	53026	0 %	75 %	25 %	0 %	383488322
144	NC_017050	TTAA	2	8	53057	53064	50 %	50 %	0 %	0 %	383488322
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