MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 1047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017050	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017050	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017050	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017050	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017050	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017050	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017050	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017050	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017050	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017050	ATTA	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017050	AAAG	2	8	14851	14858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017050	TTAT	2	8	15022	15029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017050	TATT	2	8	19387	19394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017050	GTAA	2	8	19561	19568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017050	TTAT	2	8	19639	19646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017050	TCAA	2	8	19671	19678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017050	GTAA	2	8	19840	19847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017050	ATAG	2	8	20075	20082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017050	ATTA	2	8	20179	20186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017050	ATCA	2	8	20740	20747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017050	AACA	2	8	21101	21108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017050	GTAT	2	8	21140	21147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017050	TAAT	2	8	22413	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017050	TCTT	2	8	25028	25035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017050	TAAA	2	8	26848	26855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017050	ATTT	3	12	28762	28773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017050	TACA	2	8	28904	28911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017050	ATAA	2	8	29079	29086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017050	AATA	2	8	29709	29716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017050	TTTG	2	8	31030	31037	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017050	ATTA	2	8	31240	31247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017050	ATAG	2	8	31379	31386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017050	TTTG	2	8	31469	31476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017050	ATTT	2	8	31795	31802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017050	TTCT	2	8	31837	31844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017050	AAAT	2	8	32598	32605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017050	TATT	2	8	32699	32706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017050	TCGT	2	8	36080	36087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017050	AATC	2	8	36391	36398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017050	TGAT	2	8	36463	36470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017050	TCAA	2	8	37973	37980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017050	ATGT	2	8	38033	38040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017050	TTAA	2	8	38299	38306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017050	TTAT	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017050	AATA	2	8	41053	41060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017050	AAAT	2	8	41119	41126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017050	TAAG	2	8	44378	44385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017050	GTTT	2	8	44770	44777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017050	TAAT	2	8	49477	49484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017050	TAAT	2	8	52792	52799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017050	TAAT	2	8	54273	54280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017050	GTTG	2	8	57748	57755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017050	TTCT	2	8	58037	58044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017050	ATTA	2	8	58449	58456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017050	TAGT	2	8	59120	59127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017050	TTCT	2	8	59210	59217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017050	TTTG	2	8	59230	59237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017050	AAAT	2	8	59274	59281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017050	TAAT	2	8	70097	70104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017050	AAAT	2	8	70629	70636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017050	TCTA	2	8	70906	70913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017050	TCAA	2	8	75587	75594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017050	TAAA	2	8	77992	77999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017050	AAAT	2	8	78000	78007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017050	TTAA	2	8	79600	79607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017050	ATTA	2	8	79782	79789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017050	ATTT	2	8	84810	84817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017050	GAAC	2	8	88024	88031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017050	TTTC	2	8	88051	88058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017050	ATAA	2	8	89032	89039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017050	TGTT	2	8	89240	89247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017050	TGAT	2	8	89393	89400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017050	TTGT	2	8	89852	89859	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017050	ATCT	2	8	90116	90123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017050	CTTG	2	8	90622	90629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017050	TATT	2	8	90679	90686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017050	ATAA	2	8	90968	90975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017050	TCAT	2	8	90988	90995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017050	TTTA	2	8	91485	91492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017050	TTTA	2	8	91632	91639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017050	AAGA	2	8	91767	91774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017050	TTTA	2	8	92148	92155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017050	TTTG	2	8	92340	92347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017050	ATTA	2	8	92359	92366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017050	ATTT	2	8	92535	92542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017050	TTAT	2	8	92889	92896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017050	CTTT	2	8	92899	92906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017050	AAAT	2	8	92965	92972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017050	CTTA	2	8	93066	93073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017050	ATTA	2	8	93400	93407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017050	GTTT	2	8	93519	93526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017050	TTAA	2	8	93678	93685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017050	CTTG	2	8	94342	94349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017050	TACT	2	8	94512	94519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017050	CAAA	2	8	94709	94716	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017050	CTTT	2	8	96187	96194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017050	GTAA	2	8	96359	96366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017050	ATGT	2	8	96382	96389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017050	TAAA	2	8	97570	97577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017050	CTAA	2	8	99034	99041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017050	TTAT	2	8	99266	99273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017050	ATTA	2	8	99326	99333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017050	AAGT	2	8	105940	105947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017050	ATAA	2	8	106039	106046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017050	ATCA	2	8	106181	106188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017050	ATCA	2	8	106213	106220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017050	TAAC	2	8	109675	109682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017050	AGTA	2	8	109771	109778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017050	ATTT	2	8	111260	111267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017050	CATA	2	8	112257	112264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017050	TAAA	2	8	113233	113240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017050	TATT	2	8	116444	116451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017050	GTAA	2	8	116542	116549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017050	GTCA	2	8	124899	124906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017050	GTAA	2	8	124937	124944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017050	CTTA	2	8	131321	131328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017050	TACT	2	8	131358	131365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017050	TTAC	2	8	131619	131626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017050	TAAC	2	8	131665	131672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017050	ACAA	2	8	133963	133970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017050	ATAA	2	8	134011	134018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017050	TAGA	2	8	135589	135596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017050	TTTA	2	8	141564	141571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017050	AATA	2	8	142215	142222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017050	ATTA	2	8	142317	142324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017050	ACTT	2	8	142405	142412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017050	ACTT	2	8	148430	148437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017050	TTTA	2	8	152251	152258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017050	TAAG	2	8	153143	153150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017050	ATTT	2	8	153560	153567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017050	TAAT	2	8	156211	156218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017050	AATA	2	8	156234	156241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017050	TAAA	2	8	157364	157371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017050	TAAT	2	8	159359	159366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017050	CTTT	2	8	159941	159948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017050	TATT	2	8	160348	160355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017050	TATC	2	8	160386	160393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017050	TTAT	2	8	160578	160585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017050	AATG	2	8	164842	164849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017050	ATTA	2	8	169145	169152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017050	TAAA	2	8	169391	169398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017050	ATAA	2	8	169449	169456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017050	AGAA	2	8	169536	169543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017050	ATAA	2	8	169998	170005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017050	GAAA	2	8	173013	173020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017050	ACAA	2	8	174919	174926	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017050	AATA	2	8	175045	175052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017050	TTTG	2	8	175153	175160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017050	TTTA	2	8	175239	175246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017050	TCTT	2	8	175651	175658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017050	AACC	2	8	175847	175854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017050	CTTT	2	8	176028	176035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_017050	TACA	2	8	176458	176465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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