MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 2440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383488279
2	NC_017050	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383488279
3	NC_017050	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383488281
4	NC_017050	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383488282
5	NC_017050	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383488282
6	NC_017050	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383488282
7	NC_017050	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383488282
8	NC_017050	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383488283
9	NC_017050	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383488283
10	NC_017050	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383488283
11	NC_017050	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383488283
12	NC_017050	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	383488284
13	NC_017050	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	383488284
14	NC_017050	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	383488284
15	NC_017050	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	383488284
16	NC_017050	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	383488286
17	NC_017050	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	383488287
18	NC_017050	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	383488287
19	NC_017050	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	383488287
20	NC_017050	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	383488287
21	NC_017050	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	383488287
22	NC_017050	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	383488288
23	NC_017050	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	383488288
24	NC_017050	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	383488288
25	NC_017050	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	383488288
26	NC_017050	TAAT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	383488290
27	NC_017050	GCTT	2	8	12447	12454	0 %	50 %	25 %	25 %	383488290
28	NC_017050	AATA	2	8	13360	13367	75 %	25 %	0 %	0 %	383488291
29	NC_017050	GCTC	2	8	13564	13571	0 %	25 %	25 %	50 %	383488291
30	NC_017050	TAAG	2	8	15216	15223	50 %	25 %	25 %	0 %	383488292
31	NC_017050	AATA	2	8	15646	15653	75 %	25 %	0 %	0 %	383488292
32	NC_017050	GTAA	2	8	15794	15801	50 %	25 %	25 %	0 %	383488292
33	NC_017050	AGCA	2	8	16076	16083	50 %	0 %	25 %	25 %	383488293
34	NC_017050	AATT	2	8	16689	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	383488293
35	NC_017050	AAAG	2	8	17159	17166	75 %	0 %	25 %	0 %	383488293
36	NC_017050	ATTC	2	8	17252	17259	25 %	50 %	0 %	25 %	383488293
37	NC_017050	TTCA	2	8	18304	18311	25 %	50 %	0 %	25 %	383488294
38	NC_017050	TAAA	2	8	18943	18950	75 %	25 %	0 %	0 %	383488294
39	NC_017050	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	383488297
40	NC_017050	ATAC	2	8	22459	22466	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
41	NC_017050	AACT	2	8	22647	22654	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
42	NC_017050	AAAT	2	8	22881	22888	75 %	25 %	0 %	0 %	383488299
43	NC_017050	CACT	2	8	22977	22984	25 %	25 %	0 %	50 %	383488299
44	NC_017050	AAGT	2	8	23030	23037	50 %	25 %	25 %	0 %	383488299
45	NC_017050	ATTA	2	8	23412	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	383488300
46	NC_017050	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	383488301
47	NC_017050	TATT	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	383488301
48	NC_017050	AAAT	2	8	25619	25626	75 %	25 %	0 %	0 %	383488303
49	NC_017050	TTAA	2	8	27095	27102	50 %	50 %	0 %	0 %	383488304
50	NC_017050	TAGT	2	8	27258	27265	25 %	50 %	25 %	0 %	383488304
51	NC_017050	ATTT	2	8	27277	27284	25 %	75 %	0 %	0 %	383488304
52	NC_017050	TTGC	2	8	27552	27559	0 %	50 %	25 %	25 %	383488304
53	NC_017050	ATTT	2	8	27702	27709	25 %	75 %	0 %	0 %	383488304
54	NC_017050	TTCC	2	8	27792	27799	0 %	50 %	0 %	50 %	383488304
55	NC_017050	GCTT	2	8	27930	27937	0 %	50 %	25 %	25 %	383488304
56	NC_017050	ATTT	2	8	32840	32847	25 %	75 %	0 %	0 %	383488306
57	NC_017050	ATTT	2	8	33280	33287	25 %	75 %	0 %	0 %	383488307
58	NC_017050	AAAT	2	8	33304	33311	75 %	25 %	0 %	0 %	383488307
59	NC_017050	ATAA	2	8	33780	33787	75 %	25 %	0 %	0 %	383488307
60	NC_017050	AGCA	2	8	34268	34275	50 %	0 %	25 %	25 %	383488308
61	NC_017050	TTTC	2	8	34936	34943	0 %	75 %	0 %	25 %	383488309
62	NC_017050	ATTT	2	8	35801	35808	25 %	75 %	0 %	0 %	383488309
63	NC_017050	TTGA	2	8	36643	36650	25 %	50 %	25 %	0 %	383488310
64	NC_017050	AGTA	2	8	36762	36769	50 %	25 %	25 %	0 %	383488310
65	NC_017050	TACT	2	8	37112	37119	25 %	50 %	0 %	25 %	383488310
66	NC_017050	TAAA	2	8	38575	38582	75 %	25 %	0 %	0 %	383488311
67	NC_017050	GAGT	2	8	39869	39876	25 %	25 %	50 %	0 %	383488311
68	NC_017050	ATTA	2	8	41994	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	383488312
69	NC_017050	ACTT	2	8	42942	42949	25 %	50 %	0 %	25 %	383488313
70	NC_017050	AATA	2	8	43431	43438	75 %	25 %	0 %	0 %	383488313
71	NC_017050	TAAA	2	8	43487	43494	75 %	25 %	0 %	0 %	383488313
72	NC_017050	AAAC	2	8	43784	43791	75 %	0 %	0 %	25 %	383488313
73	NC_017050	ATTT	3	12	43799	43810	25 %	75 %	0 %	0 %	383488313
74	NC_017050	TTTA	2	8	43986	43993	25 %	75 %	0 %	0 %	383488313
75	NC_017050	AGAA	2	8	45022	45029	75 %	0 %	25 %	0 %	383488314
76	NC_017050	AAAG	2	8	45402	45409	75 %	0 %	25 %	0 %	383488315
77	NC_017050	TAAA	2	8	45469	45476	75 %	25 %	0 %	0 %	383488315
78	NC_017050	AAGA	2	8	46447	46454	75 %	0 %	25 %	0 %	383488317
79	NC_017050	TAAT	2	8	46954	46961	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
80	NC_017050	ATTA	2	8	47030	47037	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
81	NC_017050	TTAT	2	8	47225	47232	25 %	75 %	0 %	0 %	383488317
82	NC_017050	GAAT	2	8	47802	47809	50 %	25 %	25 %	0 %	383488318
83	NC_017050	CTTA	2	8	48076	48083	25 %	50 %	0 %	25 %	383488318
84	NC_017050	ATGG	2	8	48356	48363	25 %	25 %	50 %	0 %	383488318
85	NC_017050	TATG	2	8	49084	49091	25 %	50 %	25 %	0 %	383488318
86	NC_017050	GCTA	2	8	51855	51862	25 %	25 %	25 %	25 %	383488320
87	NC_017050	AATT	2	8	51951	51958	50 %	50 %	0 %	0 %	383488320
88	NC_017050	CGAC	2	8	51974	51981	25 %	0 %	25 %	50 %	383488320
89	NC_017050	AAAT	2	8	52048	52055	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
90	NC_017050	ATAA	2	8	52411	52418	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
91	NC_017050	ATAA	2	8	52740	52747	75 %	25 %	0 %	0 %	383488321
92	NC_017050	TGTT	2	8	53019	53026	0 %	75 %	25 %	0 %	383488322
93	NC_017050	TTAA	2	8	53057	53064	50 %	50 %	0 %	0 %	383488322
94	NC_017050	TTAT	2	8	53155	53162	25 %	75 %	0 %	0 %	383488322
95	NC_017050	AACT	2	8	53544	53551	50 %	25 %	0 %	25 %	383488322
96	NC_017050	TAAT	2	8	54295	54302	50 %	50 %	0 %	0 %	383488323
97	NC_017050	TTGG	2	8	54340	54347	0 %	50 %	50 %	0 %	383488323
98	NC_017050	TAAA	2	8	54418	54425	75 %	25 %	0 %	0 %	383488323
99	NC_017050	TAGT	2	8	54661	54668	25 %	50 %	25 %	0 %	383488323
100	NC_017050	ATTT	2	8	54751	54758	25 %	75 %	0 %	0 %	383488323
101	NC_017050	TAAG	2	8	55018	55025	50 %	25 %	25 %	0 %	383488323
102	NC_017050	TGTA	2	8	55621	55628	25 %	50 %	25 %	0 %	383488323
103	NC_017050	ATCT	2	8	55672	55679	25 %	50 %	0 %	25 %	383488323
104	NC_017050	TTAT	2	8	55863	55870	25 %	75 %	0 %	0 %	383488323
105	NC_017050	TAAT	2	8	55958	55965	50 %	50 %	0 %	0 %	383488323
106	NC_017050	TAGT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	25 %	0 %	383488324
107	NC_017050	ATAG	2	8	57249	57256	50 %	25 %	25 %	0 %	383488326
108	NC_017050	TCTT	2	8	57465	57472	0 %	75 %	0 %	25 %	383488326
109	NC_017050	TATT	2	8	58672	58679	25 %	75 %	0 %	0 %	383488327
110	NC_017050	AAGA	2	8	59333	59340	75 %	0 %	25 %	0 %	383488328
111	NC_017050	GATG	2	8	60007	60014	25 %	25 %	50 %	0 %	383488328
112	NC_017050	TAAA	2	8	60748	60755	75 %	25 %	0 %	0 %	383488328
113	NC_017050	TAAA	2	8	60772	60779	75 %	25 %	0 %	0 %	383488328
114	NC_017050	TTGG	2	8	61048	61055	0 %	50 %	50 %	0 %	383488329
115	NC_017050	TCAA	2	8	61241	61248	50 %	25 %	0 %	25 %	383488329
116	NC_017050	CTCA	2	8	61275	61282	25 %	25 %	0 %	50 %	383488329
117	NC_017050	TGTT	2	8	61601	61608	0 %	75 %	25 %	0 %	383488329
118	NC_017050	TGTT	2	8	61618	61625	0 %	75 %	25 %	0 %	383488329
119	NC_017050	TATG	2	8	61810	61817	25 %	50 %	25 %	0 %	383488329
120	NC_017050	TGCC	2	8	63241	63248	0 %	25 %	25 %	50 %	383488331
121	NC_017050	AAAT	2	8	63784	63791	75 %	25 %	0 %	0 %	383488331
122	NC_017050	TGAT	2	8	63967	63974	25 %	50 %	25 %	0 %	383488331
123	NC_017050	ATTT	2	8	64396	64403	25 %	75 %	0 %	0 %	383488331
124	NC_017050	ATTT	2	8	64566	64573	25 %	75 %	0 %	0 %	383488331
125	NC_017050	AAGT	2	8	64826	64833	50 %	25 %	25 %	0 %	383488332
126	NC_017050	TAAT	2	8	64907	64914	50 %	50 %	0 %	0 %	383488332
127	NC_017050	TGGT	2	8	66974	66981	0 %	50 %	50 %	0 %	383488335
128	NC_017050	AAAC	2	8	67019	67026	75 %	0 %	0 %	25 %	383488335
129	NC_017050	ATGG	2	8	67361	67368	25 %	25 %	50 %	0 %	383488335
130	NC_017050	TGCT	2	8	67397	67404	0 %	50 %	25 %	25 %	383488335
131	NC_017050	ATCA	2	8	68129	68136	50 %	25 %	0 %	25 %	383488335
132	NC_017050	TAGA	2	8	68465	68472	50 %	25 %	25 %	0 %	383488335
133	NC_017050	AAAT	2	8	68776	68783	75 %	25 %	0 %	0 %	383488336
134	NC_017050	TTTA	2	8	68785	68792	25 %	75 %	0 %	0 %	383488336
135	NC_017050	ATTT	2	8	69114	69121	25 %	75 %	0 %	0 %	383488337
136	NC_017050	TGCT	2	8	71915	71922	0 %	50 %	25 %	25 %	383488339
137	NC_017050	AATG	2	8	72241	72248	50 %	25 %	25 %	0 %	383488339
138	NC_017050	TTAT	2	8	72635	72642	25 %	75 %	0 %	0 %	383488339
139	NC_017050	GAAA	2	8	72696	72703	75 %	0 %	25 %	0 %	383488339
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