MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 2811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017050	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383488279
2	NC_017050	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383488279
3	NC_017050	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	383488281
4	NC_017050	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	383488281
5	NC_017050	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	383488282
6	NC_017050	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	383488282
7	NC_017050	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	383488282
8	NC_017050	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	383488282
9	NC_017050	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	383488283
10	NC_017050	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	383488283
11	NC_017050	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	383488283
12	NC_017050	AT	4	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	383488283
13	NC_017050	GA	3	6	4226	4231	50 %	0 %	50 %	0 %	383488283
14	NC_017050	TA	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	383488283
15	NC_017050	AT	3	6	5770	5775	50 %	50 %	0 %	0 %	383488283
16	NC_017050	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017050	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017050	TC	3	6	6786	6791	0 %	50 %	0 %	50 %	383488284
19	NC_017050	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017050	TA	3	6	8302	8307	50 %	50 %	0 %	0 %	383488286
21	NC_017050	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017050	TG	3	6	9911	9916	0 %	50 %	50 %	0 %	383488287
23	NC_017050	GA	3	6	10054	10059	50 %	0 %	50 %	0 %	383488287
24	NC_017050	AT	3	6	10971	10976	50 %	50 %	0 %	0 %	383488288
25	NC_017050	AT	4	8	12035	12042	50 %	50 %	0 %	0 %	383488289
26	NC_017050	TA	3	6	12058	12063	50 %	50 %	0 %	0 %	383488289
27	NC_017050	TA	3	6	12483	12488	50 %	50 %	0 %	0 %	383488290
28	NC_017050	TA	3	6	12832	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	383488290
29	NC_017050	CT	3	6	12923	12928	0 %	50 %	0 %	50 %	383488290
30	NC_017050	TA	3	6	13514	13519	50 %	50 %	0 %	0 %	383488291
31	NC_017050	TG	3	6	13648	13653	0 %	50 %	50 %	0 %	383488291
32	NC_017050	TA	3	6	14390	14395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017050	AT	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017050	TA	3	6	14586	14591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017050	AT	3	6	15002	15007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017050	AG	3	6	15848	15853	50 %	0 %	50 %	0 %	383488292
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39	NC_017050	TA	3	6	17487	17492	50 %	50 %	0 %	0 %	383488293
40	NC_017050	TA	3	6	18616	18621	50 %	50 %	0 %	0 %	383488294
41	NC_017050	AT	3	6	18673	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	383488294
42	NC_017050	AT	3	6	19680	19685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017050	TA	3	6	19867	19872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017050	AT	3	6	19880	19885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017050	TA	3	6	20435	20440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017050	AT	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017050	TA	3	6	20856	20861	50 %	50 %	0 %	0 %	383488295
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49	NC_017050	TA	3	6	23879	23884	50 %	50 %	0 %	0 %	383488301
50	NC_017050	AT	3	6	24347	24352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017050	AG	3	6	25270	25275	50 %	0 %	50 %	0 %	383488303
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53	NC_017050	AT	3	6	25432	25437	50 %	50 %	0 %	0 %	383488303
54	NC_017050	AT	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	383488303
55	NC_017050	TA	3	6	26493	26498	50 %	50 %	0 %	0 %	383488303
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57	NC_017050	TA	3	6	26897	26902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_017050	AT	3	6	29024	29029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017050	AT	3	6	29065	29070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017050	AT	3	6	29266	29271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017050	TA	3	6	29458	29463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017050	AT	3	6	29587	29592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017050	TA	3	6	29601	29606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017050	TA	3	6	29682	29687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017050	TA	3	6	30086	30091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017050	AT	3	6	30909	30914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017050	TA	3	6	31171	31176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017050	TA	3	6	31229	31234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017050	AT	3	6	31446	31451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017050	TA	3	6	31543	31548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_017050	TA	3	6	35179	35184	50 %	50 %	0 %	0 %	383488309
91	NC_017050	AT	3	6	36062	36067	50 %	50 %	0 %	0 %	383488309
92	NC_017050	TC	3	6	36305	36310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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111	NC_017050	TA	3	6	44790	44795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_017050	AT	4	8	46059	46066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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117	NC_017050	TA	3	6	46645	46650	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
118	NC_017050	AT	3	6	47106	47111	50 %	50 %	0 %	0 %	383488317
119	NC_017050	AG	3	6	47112	47117	50 %	0 %	50 %	0 %	383488317
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121	NC_017050	AG	3	6	49649	49654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_017050	TA	3	6	52516	52521	50 %	50 %	0 %	0 %	383488321
130	NC_017050	TA	3	6	53268	53273	50 %	50 %	0 %	0 %	383488322
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132	NC_017050	TA	3	6	53901	53906	50 %	50 %	0 %	0 %	383488322
133	NC_017050	AT	4	8	54005	54012	50 %	50 %	0 %	0 %	383488322
134	NC_017050	AT	4	8	54204	54211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017050	TA	4	8	55607	55614	50 %	50 %	0 %	0 %	383488323
140	NC_017050	AT	3	6	55899	55904	50 %	50 %	0 %	0 %	383488323
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146	NC_017050	TA	3	6	58110	58115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017050	TA	3	6	58169	58174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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