MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383487435
2	NC_017049	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383487436
3	NC_017049	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383487436
4	NC_017049	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383487437
5	NC_017049	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383487437
6	NC_017049	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383487437
7	NC_017049	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383487437
8	NC_017049	AATAC	2	10	6935	6944	60 %	20 %	0 %	20 %	383487438
9	NC_017049	AAACC	2	10	8104	8113	60 %	0 %	0 %	40 %	383487440
10	NC_017049	TGACT	2	10	8807	8816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017049	GATAC	2	10	8991	9000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017049	ATTTA	2	10	9350	9359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017049	TTAAT	2	10	10607	10616	40 %	60 %	0 %	0 %	383487441
14	NC_017049	ACAAT	2	10	11056	11065	60 %	20 %	0 %	20 %	383487442
15	NC_017049	TAAAC	2	10	14654	14663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017049	TCAAT	2	10	15905	15914	40 %	40 %	0 %	20 %	383487446
17	NC_017049	AATCA	2	10	16128	16137	60 %	20 %	0 %	20 %	383487447
18	NC_017049	TTACT	2	10	17227	17236	20 %	60 %	0 %	20 %	383487447
19	NC_017049	AGATA	2	10	18462	18471	60 %	20 %	20 %	0 %	383487448
20	NC_017049	TCAAA	2	10	18492	18501	60 %	20 %	0 %	20 %	383487448
21	NC_017049	ATTTA	2	10	19330	19339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017049	AGTTT	2	10	19528	19537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017049	TATAA	2	10	19761	19770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017049	AATCT	2	10	20571	20580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017049	TAAAA	2	10	20932	20941	80 %	20 %	0 %	0 %	383487449
26	NC_017049	TTTGT	2	10	21444	21453	0 %	80 %	20 %	0 %	383487450
27	NC_017049	TAAAT	2	10	21635	21644	60 %	40 %	0 %	0 %	383487450
28	NC_017049	TTTGT	2	10	21952	21961	0 %	80 %	20 %	0 %	383487451
29	NC_017049	AATAA	2	10	22885	22894	80 %	20 %	0 %	0 %	383487453
30	NC_017049	CTATA	2	10	23544	23553	40 %	40 %	0 %	20 %	383487455
31	NC_017049	TAATA	2	10	23767	23776	60 %	40 %	0 %	0 %	383487455
32	NC_017049	CCATA	2	10	27828	27837	40 %	20 %	0 %	40 %	383487458
33	NC_017049	TTGAG	2	10	28491	28500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017049	ATTTT	2	10	29212	29221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017049	TATTT	2	10	29788	29797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017049	GTTTC	2	10	30306	30315	0 %	60 %	20 %	20 %	383487459
37	NC_017049	ATATT	2	10	31074	31083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017049	ATTAA	2	10	31706	31715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017049	CTTAA	2	10	32060	32069	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017049	ATTTA	2	10	32197	32206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017049	AAATT	2	10	32780	32789	60 %	40 %	0 %	0 %	383487460
42	NC_017049	TTTTA	2	10	33610	33619	20 %	80 %	0 %	0 %	383487461
43	NC_017049	TTGAT	2	10	39561	39570	20 %	60 %	20 %	0 %	383487465
44	NC_017049	AATTG	2	10	39595	39604	40 %	40 %	20 %	0 %	383487465
45	NC_017049	ATATG	2	10	39754	39763	40 %	40 %	20 %	0 %	383487465
46	NC_017049	ATTAT	2	10	40661	40670	40 %	60 %	0 %	0 %	383487465
47	NC_017049	GTATT	2	10	41432	41441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017049	ATAAC	2	10	43786	43795	60 %	20 %	0 %	20 %	383487467
49	NC_017049	TAACA	2	10	44015	44024	60 %	20 %	0 %	20 %	383487467
50	NC_017049	TTTAA	2	10	44151	44160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017049	AATTG	2	10	46063	46072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017049	AATAT	2	10	46194	46203	60 %	40 %	0 %	0 %	383487471
53	NC_017049	TACCT	2	10	47335	47344	20 %	40 %	0 %	40 %	383487471
54	NC_017049	TGGTA	2	10	48855	48864	20 %	40 %	40 %	0 %	383487472
55	NC_017049	AAATT	2	10	50906	50915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017049	AACTA	2	10	51755	51764	60 %	20 %	0 %	20 %	383487474
57	NC_017049	ACTTT	2	10	53193	53202	20 %	60 %	0 %	20 %	383487476
58	NC_017049	TTAAA	2	10	54110	54119	60 %	40 %	0 %	0 %	383487476
59	NC_017049	AATAT	2	10	54162	54171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017049	CAAGT	2	10	54492	54501	40 %	20 %	20 %	20 %	383487477
61	NC_017049	CTATG	2	10	55339	55348	20 %	40 %	20 %	20 %	383487477
62	NC_017049	GCTAA	2	10	56350	56359	40 %	20 %	20 %	20 %	383487478
63	NC_017049	TTTAC	2	10	58700	58709	20 %	60 %	0 %	20 %	383487481
64	NC_017049	AGCAT	2	10	58725	58734	40 %	20 %	20 %	20 %	383487481
65	NC_017049	GGGTT	2	10	60286	60295	0 %	40 %	60 %	0 %	383487482
66	NC_017049	TTTAT	2	10	60662	60671	20 %	80 %	0 %	0 %	383487482
67	NC_017049	GTTTT	2	10	61853	61862	0 %	80 %	20 %	0 %	383487483
68	NC_017049	ACAAT	2	10	62333	62342	60 %	20 %	0 %	20 %	383487484
69	NC_017049	TTTTC	2	10	62721	62730	0 %	80 %	0 %	20 %	383487484
70	NC_017049	CAATG	2	10	65613	65622	40 %	20 %	20 %	20 %	383487487
71	NC_017049	ATAAA	2	10	66028	66037	80 %	20 %	0 %	0 %	383487488
72	NC_017049	TAAAT	2	10	66434	66443	60 %	40 %	0 %	0 %	383487488
73	NC_017049	ATTAA	2	10	66782	66791	60 %	40 %	0 %	0 %	383487488
74	NC_017049	ATATT	2	10	69965	69974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017049	TAACA	2	10	70266	70275	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017049	AATGA	2	10	70308	70317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017049	ACAAA	2	10	71910	71919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017049	TTAAT	2	10	74821	74830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017049	TGAAA	2	10	77675	77684	60 %	20 %	20 %	0 %	383487496
80	NC_017049	TTGAT	2	10	79002	79011	20 %	60 %	20 %	0 %	383487497
81	NC_017049	ATATA	2	10	79637	79646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017049	TTGTA	2	10	79758	79767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017049	AAAAT	2	10	80525	80534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017049	ATTTA	2	10	80848	80857	40 %	60 %	0 %	0 %	383487499
85	NC_017049	TTAGT	2	10	85844	85853	20 %	60 %	20 %	0 %	383487505
86	NC_017049	TTAAT	2	10	88055	88064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017049	TTATT	2	10	89076	89085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017049	TTAAC	2	10	89100	89109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017049	ATATT	2	10	89343	89352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017049	TCTTT	2	10	90183	90192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017049	TTTAA	2	10	90594	90603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017049	TCCTT	2	10	91068	91077	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017049	ATTGT	2	10	91146	91155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017049	TACTT	2	10	91753	91762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017049	TTATG	2	10	92684	92693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017049	TTATG	2	10	94615	94624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017049	AGTTA	2	10	94656	94665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017049	TCTAT	2	10	96728	96737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017049	ATAAA	2	10	99249	99258	80 %	20 %	0 %	0 %	383487512
100	NC_017049	TATAA	2	10	99283	99292	60 %	40 %	0 %	0 %	383487512
101	NC_017049	TAAAA	2	10	101500	101509	80 %	20 %	0 %	0 %	383487515
102	NC_017049	AAAAC	2	10	102196	102205	80 %	0 %	0 %	20 %	383487515
103	NC_017049	TTTAA	2	10	102272	102281	40 %	60 %	0 %	0 %	383487515
104	NC_017049	TGAAA	2	10	103722	103731	60 %	20 %	20 %	0 %	383487517
105	NC_017049	CTTGT	2	10	106490	106499	0 %	60 %	20 %	20 %	383487519
106	NC_017049	ATGAT	2	10	107407	107416	40 %	40 %	20 %	0 %	383487520
107	NC_017049	TTAAT	2	10	108083	108092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017049	ATTTT	2	10	108137	108146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017049	TTATT	2	10	108306	108315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017049	AGTAG	2	10	110078	110087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017049	CACTA	2	10	110339	110348	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017049	AATAC	2	10	110483	110492	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017049	AAATC	2	10	110617	110626	60 %	20 %	0 %	20 %	383487524
114	NC_017049	TTATA	2	10	111923	111932	40 %	60 %	0 %	0 %	383487525
115	NC_017049	GTAAT	2	10	112061	112070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017049	TGCTT	2	10	112428	112437	0 %	60 %	20 %	20 %	383487526
117	NC_017049	TTTTA	2	10	113545	113554	20 %	80 %	0 %	0 %	383487526
118	NC_017049	GCTTT	2	10	115121	115130	0 %	60 %	20 %	20 %	383487527
119	NC_017049	TATGT	2	10	115774	115783	20 %	60 %	20 %	0 %	383487527
120	NC_017049	TCTAC	2	10	116119	116128	20 %	40 %	0 %	40 %	383487527
121	NC_017049	AGAAA	2	10	117645	117654	80 %	0 %	20 %	0 %	383487527
122	NC_017049	GTTTT	2	10	118330	118339	0 %	80 %	20 %	0 %	383487528
123	NC_017049	TGCAG	2	10	118663	118672	20 %	20 %	40 %	20 %	383487528
124	NC_017049	GGTAT	2	10	119360	119369	20 %	40 %	40 %	0 %	383487528
125	NC_017049	ATCTA	2	10	120538	120547	40 %	40 %	0 %	20 %	383487529
126	NC_017049	GTTTG	2	10	120969	120978	0 %	60 %	40 %	0 %	383487529
127	NC_017049	ACAAG	2	10	122924	122933	60 %	0 %	20 %	20 %	383487529
128	NC_017049	AGTTT	2	10	123235	123244	20 %	60 %	20 %	0 %	383487530
129	NC_017049	TTAGT	2	10	123758	123767	20 %	60 %	20 %	0 %	383487530
130	NC_017049	GTTAT	2	10	125159	125168	20 %	60 %	20 %	0 %	383487530
131	NC_017049	ATGGT	2	10	126300	126309	20 %	40 %	40 %	0 %	383487531
132	NC_017049	TATTT	2	10	127234	127243	20 %	80 %	0 %	0 %	383487531
133	NC_017049	CAAAG	2	10	127626	127635	60 %	0 %	20 %	20 %	383487531
134	NC_017049	GAACA	2	10	128036	128045	60 %	0 %	20 %	20 %	383487531
135	NC_017049	TGATA	2	10	129012	129021	40 %	40 %	20 %	0 %	383487531
136	NC_017049	TGTAT	2	10	133679	133688	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017049	TTTAA	2	10	134744	134753	40 %	60 %	0 %	0 %	383487537
138	NC_017049	GGTTT	2	10	135862	135871	0 %	60 %	40 %	0 %	383487538
139	NC_017049	TATGT	2	10	139969	139978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017049	ATTAA	2	10	140220	140229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017049	TATCA	2	10	141739	141748	40 %	40 %	0 %	20 %	383487543
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