MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 2446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383487433
2	NC_017049	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383487433
3	NC_017049	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383487435
4	NC_017049	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383487436
5	NC_017049	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
6	NC_017049	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383487436
7	NC_017049	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
8	NC_017049	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383487437
9	NC_017049	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383487437
10	NC_017049	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383487437
11	NC_017049	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383487437
12	NC_017049	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	383487438
13	NC_017049	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	383487438
14	NC_017049	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	383487438
15	NC_017049	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	383487438
16	NC_017049	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	383487440
17	NC_017049	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	383487441
18	NC_017049	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	383487441
19	NC_017049	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	383487441
20	NC_017049	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	383487441
21	NC_017049	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	383487441
22	NC_017049	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	383487442
23	NC_017049	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	383487442
24	NC_017049	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	383487442
25	NC_017049	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	383487442
26	NC_017049	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	383487444
27	NC_017049	GCTT	2	8	12460	12467	0 %	50 %	25 %	25 %	383487444
28	NC_017049	AATA	2	8	13373	13380	75 %	25 %	0 %	0 %	383487445
29	NC_017049	GCTC	2	8	13577	13584	0 %	25 %	25 %	50 %	383487445
30	NC_017049	TAAG	2	8	15229	15236	50 %	25 %	25 %	0 %	383487446
31	NC_017049	AATA	2	8	15659	15666	75 %	25 %	0 %	0 %	383487446
32	NC_017049	GTAA	2	8	15807	15814	50 %	25 %	25 %	0 %	383487446
33	NC_017049	AGCA	2	8	16089	16096	50 %	0 %	25 %	25 %	383487447
34	NC_017049	AATT	2	8	16702	16709	50 %	50 %	0 %	0 %	383487447
35	NC_017049	AAAG	2	8	17172	17179	75 %	0 %	25 %	0 %	383487447
36	NC_017049	ATTC	2	8	17265	17272	25 %	50 %	0 %	25 %	383487447
37	NC_017049	TTCA	2	8	18317	18324	25 %	50 %	0 %	25 %	383487448
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39	NC_017049	TGAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	25 %	0 %	383487451
40	NC_017049	ATAC	2	8	22473	22480	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
41	NC_017049	AACT	2	8	22661	22668	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
42	NC_017049	AAAT	2	8	22895	22902	75 %	25 %	0 %	0 %	383487453
43	NC_017049	CACT	2	8	22991	22998	25 %	25 %	0 %	50 %	383487453
44	NC_017049	AAGT	2	8	23044	23051	50 %	25 %	25 %	0 %	383487453
45	NC_017049	ATTA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	383487454
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50	NC_017049	TAGT	2	8	27272	27279	25 %	50 %	25 %	0 %	383487458
51	NC_017049	ATTT	2	8	27291	27298	25 %	75 %	0 %	0 %	383487458
52	NC_017049	TTGC	2	8	27566	27573	0 %	50 %	25 %	25 %	383487458
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58	NC_017049	AAAT	2	8	33318	33325	75 %	25 %	0 %	0 %	383487461
59	NC_017049	ATAA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	383487461
60	NC_017049	AGCA	2	8	34282	34289	50 %	0 %	25 %	25 %	383487462
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62	NC_017049	ATTT	2	8	35815	35822	25 %	75 %	0 %	0 %	383487463
63	NC_017049	TTGA	2	8	36657	36664	25 %	50 %	25 %	0 %	383487464
64	NC_017049	AGTA	2	8	36776	36783	50 %	25 %	25 %	0 %	383487464
65	NC_017049	TACT	2	8	37126	37133	25 %	50 %	0 %	25 %	383487464
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70	NC_017049	AATA	2	8	43445	43452	75 %	25 %	0 %	0 %	383487467
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73	NC_017049	ATTT	3	12	43813	43824	25 %	75 %	0 %	0 %	383487467
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103	NC_017049	ATCT	2	8	55686	55693	25 %	50 %	0 %	25 %	383487477
104	NC_017049	TTAT	2	8	55877	55884	25 %	75 %	0 %	0 %	383487477
105	NC_017049	TAAT	2	8	55972	55979	50 %	50 %	0 %	0 %	383487477
106	NC_017049	TAGT	2	8	56288	56295	25 %	50 %	25 %	0 %	383487478
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109	NC_017049	TATT	2	8	58686	58693	25 %	75 %	0 %	0 %	383487481
110	NC_017049	AAGA	2	8	59347	59354	75 %	0 %	25 %	0 %	383487482
111	NC_017049	GATG	2	8	60021	60028	25 %	25 %	50 %	0 %	383487482
112	NC_017049	TAAA	2	8	60762	60769	75 %	25 %	0 %	0 %	383487482
113	NC_017049	TAAA	2	8	60786	60793	75 %	25 %	0 %	0 %	383487482
114	NC_017049	TTGG	2	8	61062	61069	0 %	50 %	50 %	0 %	383487483
115	NC_017049	TCAA	2	8	61255	61262	50 %	25 %	0 %	25 %	383487483
116	NC_017049	CTCA	2	8	61289	61296	25 %	25 %	0 %	50 %	383487483
117	NC_017049	TGTT	2	8	61615	61622	0 %	75 %	25 %	0 %	383487483
118	NC_017049	TGTT	2	8	61632	61639	0 %	75 %	25 %	0 %	383487483
119	NC_017049	TATG	2	8	61824	61831	25 %	50 %	25 %	0 %	383487483
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122	NC_017049	TGAT	2	8	63981	63988	25 %	50 %	25 %	0 %	383487485
123	NC_017049	ATTT	2	8	64410	64417	25 %	75 %	0 %	0 %	383487485
124	NC_017049	ATTT	2	8	64580	64587	25 %	75 %	0 %	0 %	383487485
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138	NC_017049	TTAT	2	8	72649	72656	25 %	75 %	0 %	0 %	383487493
139	NC_017049	GAAA	2	8	72710	72717	75 %	0 %	25 %	0 %	383487493
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