MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 18034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
2	NC_017049	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487433
3	NC_017049	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
4	NC_017049	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
5	NC_017049	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487433
6	NC_017049	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487433
7	NC_017049	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487433
8	NC_017049	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
9	NC_017049	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487433
10	NC_017049	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487433
11	NC_017049	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017049	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017049	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017049	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017049	GTG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487434
16	NC_017049	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487434
17	NC_017049	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487434
18	NC_017049	TGT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487434
19	NC_017049	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487434
20	NC_017049	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487434
21	NC_017049	TGC	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487435
22	NC_017049	ATA	3	9	1667	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
23	NC_017049	GTA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
24	NC_017049	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
25	NC_017049	GCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487435
26	NC_017049	GAA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487435
27	NC_017049	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
28	NC_017049	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487435
29	NC_017049	AGA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487435
30	NC_017049	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487435
31	NC_017049	GAT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
32	NC_017049	ACA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487435
33	NC_017049	TAA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
34	NC_017049	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
35	NC_017049	TTA	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487436
36	NC_017049	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
37	NC_017049	ATA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
38	NC_017049	ATG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487436
39	NC_017049	TAA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
40	NC_017049	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487436
41	NC_017049	CTC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383487437
42	NC_017049	ATT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
43	NC_017049	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
44	NC_017049	AAG	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
45	NC_017049	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
46	NC_017049	GAA	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
47	NC_017049	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
48	NC_017049	TGC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487437
49	NC_017049	TTA	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
50	NC_017049	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487437
51	NC_017049	CAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487437
52	NC_017049	GAT	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
53	NC_017049	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
54	NC_017049	AGC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
55	NC_017049	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
56	NC_017049	GCA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
57	NC_017049	AGA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
58	NC_017049	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487437
59	NC_017049	TAT	2	6	4013	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
60	NC_017049	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
61	NC_017049	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487437
62	NC_017049	AAT	3	9	4232	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
63	NC_017049	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
64	NC_017049	TGA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
65	NC_017049	ATA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
66	NC_017049	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487437
67	NC_017049	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487437
68	NC_017049	AGA	3	9	4585	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
69	NC_017049	GAA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
70	NC_017049	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
71	NC_017049	GAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
72	NC_017049	TAA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
73	NC_017049	GGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487437
74	NC_017049	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
75	NC_017049	TAC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487437
76	NC_017049	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
77	NC_017049	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
78	NC_017049	AAG	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
79	NC_017049	TTA	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
80	NC_017049	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
81	NC_017049	TAA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
82	NC_017049	TGC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487437
83	NC_017049	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
84	NC_017049	CTA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487437
85	NC_017049	AGT	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
86	NC_017049	ATT	3	9	5489	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
87	NC_017049	TAA	2	6	5613	5618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
88	NC_017049	TAA	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
89	NC_017049	ATG	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
90	NC_017049	AAT	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
91	NC_017049	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017049	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017049	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017049	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017049	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017049	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017049	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017049	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017049	CTA	3	9	6252	6260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487438
100	NC_017049	AAT	2	6	6278	6283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487438
101	NC_017049	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487438
102	NC_017049	CAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487438
103	NC_017049	TCT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487438
104	NC_017049	TAC	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487438
105	NC_017049	ATC	2	6	6516	6521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487438
106	NC_017049	CCA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383487438
107	NC_017049	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487438
108	NC_017049	TTA	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487438
109	NC_017049	TAT	2	6	6757	6762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487438
110	NC_017049	ATT	2	6	6771	6776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487438
111	NC_017049	TAC	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487438
112	NC_017049	GTA	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487438
113	NC_017049	CTT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487439
114	NC_017049	TAG	2	6	7228	7233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487439
115	NC_017049	AGC	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487439
116	NC_017049	TAT	2	6	7367	7372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487439
117	NC_017049	CTA	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487439
118	NC_017049	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017049	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017049	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017049	ACT	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487440
122	NC_017049	ATA	2	6	7705	7710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487440
123	NC_017049	CCT	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383487440
124	NC_017049	TCC	2	6	7851	7856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383487440
125	NC_017049	ATA	2	6	7912	7917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487440
126	NC_017049	TCT	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487440
127	NC_017049	ATA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487440
128	NC_017049	TAG	2	6	8015	8020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487440
129	NC_017049	ATT	2	6	8040	8045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487440
130	NC_017049	ATG	2	6	8079	8084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487440
131	NC_017049	CTA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487440
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133	NC_017049	TCG	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487440
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