MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017049	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017049	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017049	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017049	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017049	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017049	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017049	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017049	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017049	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017049	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017049	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017049	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017049	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017049	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017049	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017049	TTA	2	6	8863	8868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017049	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017049	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017049	ACC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017049	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017049	CAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017049	ATT	2	6	9155	9160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017049	CAT	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017049	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017049	TAA	2	6	9199	9204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017049	TTA	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017049	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017049	AAT	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017049	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017049	AGA	2	6	11824	11829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017049	ATA	2	6	14381	14386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017049	TTA	2	6	14391	14396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017049	GTT	2	6	14446	14451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017049	TTA	2	6	14460	14465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017049	GTA	2	6	14477	14482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017049	TTG	2	6	14513	14518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017049	ATT	2	6	14527	14532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017049	ATT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017049	ATC	2	6	14718	14723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017049	AAG	2	6	14829	14834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017049	ATT	2	6	14939	14944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017049	TTG	2	6	14952	14957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017049	ATT	2	6	14998	15003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017049	TAA	2	6	17877	17882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017049	GAA	3	9	17917	17925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017049	ATA	2	6	19096	19101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017049	ACC	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017049	ATA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017049	TAA	2	6	19256	19261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017049	AAG	2	6	19278	19283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017049	TTA	2	6	19320	19325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017049	CTT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017049	ATT	2	6	19421	19426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017049	TAG	2	6	19457	19462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017049	AAT	2	6	19586	19591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017049	CAT	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017049	TAG	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017049	GTA	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017049	TAA	2	6	20043	20048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017049	AAT	2	6	20120	20125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017049	GAA	2	6	20220	20225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017049	TAA	2	6	20238	20243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017049	TAG	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017049	AGT	2	6	20351	20356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017049	TAT	2	6	20412	20417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017049	AAT	2	6	20439	20444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017049	ATT	2	6	20598	20603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017049	AAG	2	6	20657	20662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017049	GTT	2	6	20687	20692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017049	AAT	2	6	20724	20729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017049	ATA	2	6	20784	20789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017049	TGA	2	6	21106	21111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017049	TAG	2	6	24405	24410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017049	CAC	2	6	24441	24446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017049	GGA	2	6	24447	24452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017049	TAC	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017049	TTA	2	6	25172	25177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017049	TTA	2	6	26920	26925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017049	TTC	2	6	26940	26945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017049	ATT	2	6	26953	26958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017049	ATT	2	6	27035	27040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017049	CAG	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017049	AAT	2	6	28195	28200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017049	ATT	2	6	28207	28212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017049	TAG	2	6	28247	28252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017049	ATT	2	6	28303	28308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017049	ATA	2	6	28446	28451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017049	TGC	2	6	28551	28556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017049	TTC	2	6	28574	28579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017049	TGA	2	6	28639	28644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017049	TAA	2	6	28706	28711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017049	CAT	2	6	28769	28774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017049	TAA	2	6	28788	28793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017049	TCA	2	6	28950	28955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017049	TAT	2	6	28974	28979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017049	ATT	2	6	29123	29128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017049	AAT	2	6	29132	29137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017049	TGA	2	6	29236	29241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017049	GTA	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017049	ATT	2	6	29290	29295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017049	TAA	2	6	29316	29321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017049	ATT	2	6	29334	29339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017049	TCT	2	6	29369	29374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017049	TTA	2	6	29383	29388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017049	ATT	2	6	29436	29441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017049	ACA	2	6	29458	29463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017049	ATC	2	6	29478	29483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017049	TTA	2	6	29607	29612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017049	TAA	2	6	29656	29661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017049	TAA	2	6	29677	29682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017049	ATT	2	6	29733	29738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017049	TCT	2	6	29756	29761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017049	TAA	2	6	29887	29892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017049	TAT	2	6	29980	29985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017049	TAT	2	6	30069	30074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017049	TAA	2	6	30139	30144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017049	CAC	2	6	30844	30849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017049	TTA	2	6	31008	31013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017049	TCT	2	6	31098	31103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017049	CTG	2	6	31126	31131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017049	CTT	2	6	31137	31142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017049	TAA	3	9	31308	31316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017049	ATT	2	6	31434	31439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017049	AAT	2	6	31492	31497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017049	TCT	2	6	31504	31509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017049	AAT	2	6	31620	31625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017049	ATT	2	6	31662	31667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017049	GTT	2	6	31826	31831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017049	ATT	2	6	31946	31951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017049	ATT	2	6	32009	32014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017049	ATA	2	6	32015	32020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017049	ATA	2	6	32043	32048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017049	TAT	2	6	32108	32113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017049	TAT	2	6	32118	32123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017049	TAA	2	6	32130	32135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017049	ATT	3	9	32149	32157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017049	ACT	2	6	32180	32185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017049	TAT	2	6	32265	32270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017049	ATA	2	6	32319	32324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017049	GAT	2	6	32332	32337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017049	TAT	2	6	32470	32475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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