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Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	AATAAG	2	12	2824	2835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	TATCAT	2	12	6934	6945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486605
3	NC_017048	GAAAAA	2	12	8720	8731	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017048	AAGTAT	2	12	17794	17805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383486612
5	NC_017048	TGGTTT	2	12	17861	17872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486612
6	NC_017048	AATTAA	2	12	21695	21706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486613
7	NC_017048	TTCAAT	2	12	24198	24209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017048	TTTTAA	2	12	25859	25870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017048	GATATT	2	12	26179	26190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383486616
10	NC_017048	AAAATA	2	12	27663	27674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017048	GCATTG	2	12	28273	28284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383486618
12	NC_017048	AAAAAT	2	12	30257	30268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017048	GTTTAT	2	12	30929	30940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017048	AATCTA	2	12	32167	32178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383486620
15	NC_017048	TCTTTT	2	12	38736	38747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383486627
16	NC_017048	GGTATA	2	12	41083	41094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486630
17	NC_017048	TTAAAT	2	12	43009	43020	50 %	50 %	0 %	0 %	383486635
18	NC_017048	TGTTTT	2	12	45390	45401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383486641
19	NC_017048	TACCTT	2	12	45955	45966	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383486643
20	NC_017048	TGCTTT	2	12	46151	46162	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383486643
21	NC_017048	ATTAAT	2	12	46675	46686	50 %	50 %	0 %	0 %	383486644
22	NC_017048	ATTTTT	2	12	47228	47239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383486645
23	NC_017048	CCATGA	2	12	47286	47297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383486646
24	NC_017048	GTTTTA	2	12	49142	49153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486649
25	NC_017048	TTAGCA	2	12	49974	49985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383486650
26	NC_017048	TTTTGC	2	12	51773	51784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383486652
27	NC_017048	TAATCT	2	12	53235	53246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017048	CTCAAA	2	12	53469	53480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383486654
29	NC_017048	TGTGAC	2	12	54430	54441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383486654
30	NC_017048	GGTGCA	2	12	55362	55373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383486655
31	NC_017048	CCAGAA	2	12	58359	58370	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383486657
32	NC_017048	GTACTT	2	12	61819	61830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017048	GTGTAT	2	12	61844	61855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017048	ATATTT	2	12	62969	62980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017048	ATTAAT	2	12	63736	63747	50 %	50 %	0 %	0 %	383486659
36	NC_017048	CTGTAC	2	12	69180	69191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383486663
37	NC_017048	TTTTTA	2	12	69800	69811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017048	TTTTGA	2	12	72392	72403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486666
39	NC_017048	TACAAG	2	12	73450	73461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017048	TAGGAG	2	12	78416	78427	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383486670
41	NC_017048	ATACAG	2	12	83872	83883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383486674
42	NC_017048	AGCAGA	2	12	85313	85324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383486675
43	NC_017048	AATTCT	2	12	91958	91969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486679
44	NC_017048	ACTGAC	2	12	94741	94752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017048	ACCGCT	2	12	95968	95979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383486680
46	NC_017048	CACAAA	2	12	100088	100099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017048	TAACAA	2	12	101777	101788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383486685
48	NC_017048	TTTAAG	2	12	102550	102561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383486686
49	NC_017048	AGGGTT	2	12	107993	108004	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383486689
50	NC_017048	ACTTTT	2	12	111946	111957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383486690
51	NC_017048	GCATTA	2	12	112754	112765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383486690
52	NC_017048	CTAAAC	2	12	113394	113405	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383486690
53	NC_017048	ACTAAT	2	12	115502	115513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383486690
54	NC_017048	ATTTTG	2	12	116717	116728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017048	TTAGAT	2	12	122685	122696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017048	TAATGA	2	12	126299	126310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017048	TTTTTC	2	12	127180	127191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017048	ATACAT	2	12	127593	127604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017048	CTATAT	2	12	127721	127732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017048	GATTTA	2	12	128485	128496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017048	GGTAAA	2	12	129072	129083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017048	GAAGCA	2	12	129655	129666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017048	AATTAA	2	12	130405	130416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017048	AATATG	2	12	130582	130593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017048	GAACCA	2	12	133278	133289	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383486703
66	NC_017048	ATTTTT	2	12	134392	134403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383486704
67	NC_017048	TAGGTT	2	12	144186	144197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383486711
68	NC_017048	ATTTTG	2	12	146605	146616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486713
69	NC_017048	CATTTT	2	12	146939	146950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383486714
70	NC_017048	TCTTTT	2	12	151559	151570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017048	ATACCA	2	12	154589	154600	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383486718
72	NC_017048	ATTGCT	2	12	154706	154717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383486718
73	NC_017048	TTCAAT	2	12	159430	159441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486721
74	NC_017048	GTTTTG	2	12	160142	160153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486721
75	NC_017048	AATAGC	2	12	163816	163827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017048	ATTTTT	2	12	164167	164178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383486726
77	NC_017048	TATGTT	2	12	165179	165190	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017048	TTGTAC	2	12	165778	165789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383486728
79	NC_017048	AAAAGC	2	12	166841	166852	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383486729
80	NC_017048	TATTTG	2	12	166909	166920	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486729
81	NC_017048	CATCTA	2	12	171672	171683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486735
82	NC_017048	AGGATT	2	12	177039	177050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486740
83	NC_017048	TCAAAA	2	12	179317	179328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383486740
84	NC_017048	CGTCAT	2	12	181263	181274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383486741
85	NC_017048	TAAAGA	2	12	185145	185156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383486743
86	NC_017048	AAAGTA	2	12	185179	185190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383486743
87	NC_017048	AATATA	2	12	188722	188733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486747
88	NC_017048	AGTATT	2	12	188742	188753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383486747
89	NC_017048	TAACTT	2	12	194023	194034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486752
90	NC_017048	TTTTGA	2	12	195717	195728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486754
91	NC_017048	TAATAG	2	12	196150	196161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383486755
92	NC_017048	ACGGAT	2	12	197595	197606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383486757
93	NC_017048	TTTAGT	2	12	200591	200602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486758
94	NC_017048	ATATTA	2	12	203053	203064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017048	CCTTTA	2	12	203671	203682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017048	AAGCTG	2	12	207059	207070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017048	ATTTAT	2	12	208731	208742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486760
98	NC_017048	TTACAG	2	12	209562	209573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383486760
99	NC_017048	TAAATA	2	12	213156	213167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017048	TTTATT	2	12	215973	215984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017048	TTTAAT	2	12	220222	220233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486766
102	NC_017048	GGTACG	2	12	221292	221303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383486768
103	NC_017048	GTTTAT	2	12	225113	225124	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383486771
104	NC_017048	ATTTAT	2	12	226535	226546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486772
105	NC_017048	CAATTA	2	12	227833	227844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383486773
106	NC_017048	ATCTGT	2	12	229774	229785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017048	AAAGTC	2	12	230217	230228	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383486774
108	NC_017048	CTTTGT	2	12	233695	233706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383486777
109	NC_017048	AGTTTA	2	12	235503	235514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383486778
110	NC_017048	TCTAAC	2	12	242713	242724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486784
111	NC_017048	CATTTA	2	12	243086	243097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383486784
112	NC_017048	ATTATC	2	12	245563	245574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017048	AAACTA	2	12	259286	259297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383486798
114	NC_017048	CAAAAG	2	12	263606	263617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383486800
115	NC_017048	TTACTG	2	12	265180	265191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017048	AAATTT	2	12	265469	265480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017048	TATTGT	2	12	265661	265672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017048	ATTAAT	2	12	267963	267974	50 %	50 %	0 %	0 %	383486801
119	NC_017048	ACCAGC	2	12	272808	272819	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383486805
120	NC_017048	TTCACT	2	12	279090	279101	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017048	AATGAA	2	12	291095	291106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383486819
122	NC_017048	AAAAAT	2	12	292807	292818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_017048	ATCTCC	2	12	518471	518482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383486992
241	NC_017048	TAAAAT	2	12	526626	526637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_017048	ATCTTG	2	12	528344	528355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383487002
243	NC_017048	AACATT	2	12	528446	528457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383487002
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249	NC_017048	TCCTTT	2	12	537610	537621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487009
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351	NC_017048	TATCTA	2	12	710303	710314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
352	NC_017048	ATGTCT	2	12	711410	711421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383487139
353	NC_017048	TATTAG	2	12	712166	712177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
354	NC_017048	TTGTTT	2	12	716386	716397	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383487143
355	NC_017048	AATTTT	2	12	717581	717592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_017048	TACATG	2	12	718618	718629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383487145
357	NC_017048	ATGTTG	2	12	722521	722532	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383487148
358	NC_017048	CAAATA	2	12	725850	725861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383487152
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479	NC_017048	AAATTA	2	12	955378	955389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487325
480	NC_017048	TCATTA	2	12	955924	955935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383487325
481	NC_017048	CATAAT	2	12	956142	956153	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_017048	TGTGCT	2	12	957201	957212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383487327
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490	NC_017048	ATTTAG	2	12	972638	972649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383487337
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