MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TAATT	2	10	6455	6464	40 %	60 %	0 %	0 %	383486605
2	NC_017048	ACTAA	2	10	6891	6900	60 %	20 %	0 %	20 %	383486605
3	NC_017048	TTATA	2	10	9738	9747	40 %	60 %	0 %	0 %	383486608
4	NC_017048	CTTGC	2	10	16408	16417	0 %	40 %	20 %	40 %	383486610
5	NC_017048	CTGTT	2	10	17492	17501	0 %	60 %	20 %	20 %	383486612
6	NC_017048	ATTAT	2	10	18368	18377	40 %	60 %	0 %	0 %	383486612
7	NC_017048	TATGC	2	10	19277	19286	20 %	40 %	20 %	20 %	383486612
8	NC_017048	TAATA	2	10	21011	21020	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
9	NC_017048	AATCA	2	10	21365	21374	60 %	20 %	0 %	20 %	383486613
10	NC_017048	AAATT	2	10	21478	21487	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
11	NC_017048	GAAAA	2	10	22495	22504	80 %	0 %	20 %	0 %	383486614
12	NC_017048	GAAAA	2	10	24029	24038	80 %	0 %	20 %	0 %	383486615
13	NC_017048	GATAT	2	10	26612	26621	40 %	40 %	20 %	0 %	383486616
14	NC_017048	AATTA	2	10	32102	32111	60 %	40 %	0 %	0 %	383486620
15	NC_017048	CATCG	2	10	32397	32406	20 %	20 %	20 %	40 %	383486620
16	NC_017048	CGATG	2	10	32478	32487	20 %	20 %	40 %	20 %	383486620
17	NC_017048	CATAC	2	10	32501	32510	40 %	20 %	0 %	40 %	383486620
18	NC_017048	GCATT	2	10	34236	34245	20 %	40 %	20 %	20 %	383486622
19	NC_017048	TTTAC	2	10	35029	35038	20 %	60 %	0 %	20 %	383486623
20	NC_017048	ATTTA	2	10	36696	36705	40 %	60 %	0 %	0 %	383486624
21	NC_017048	TTAAA	2	10	37428	37437	60 %	40 %	0 %	0 %	383486626
22	NC_017048	ATTTT	2	10	39899	39908	20 %	80 %	0 %	0 %	383486630
23	NC_017048	ATTTA	2	10	40395	40404	40 %	60 %	0 %	0 %	383486630
24	NC_017048	ATTTT	2	10	42424	42433	20 %	80 %	0 %	0 %	383486634
25	NC_017048	TTAGC	2	10	42757	42766	20 %	40 %	20 %	20 %	383486634
26	NC_017048	AATTT	2	10	42788	42797	40 %	60 %	0 %	0 %	383486635
27	NC_017048	TTTAA	2	10	43068	43077	40 %	60 %	0 %	0 %	383486635
28	NC_017048	TAAAT	2	10	44088	44097	60 %	40 %	0 %	0 %	383486638
29	NC_017048	TACCT	2	10	44863	44872	20 %	40 %	0 %	40 %	383486639
30	NC_017048	TTTAA	2	10	44927	44936	40 %	60 %	0 %	0 %	383486639
31	NC_017048	TTAAA	2	10	45717	45726	60 %	40 %	0 %	0 %	383486642
32	NC_017048	TTAAT	2	10	47854	47863	40 %	60 %	0 %	0 %	383486647
33	NC_017048	TTTCA	2	10	47942	47951	20 %	60 %	0 %	20 %	383486647
34	NC_017048	CTTGA	2	10	48022	48031	20 %	40 %	20 %	20 %	383486647
35	NC_017048	ATTCT	2	10	48136	48145	20 %	60 %	0 %	20 %	383486647
36	NC_017048	ATTTT	2	10	50496	50505	20 %	80 %	0 %	0 %	383486651
37	NC_017048	GTAAA	2	10	54366	54375	60 %	20 %	20 %	0 %	383486654
38	NC_017048	TGACA	2	10	55961	55970	40 %	20 %	20 %	20 %	383486655
39	NC_017048	CAAAA	2	10	58508	58517	80 %	0 %	0 %	20 %	383486657
40	NC_017048	AAAAT	2	10	64773	64782	80 %	20 %	0 %	0 %	383486660
41	NC_017048	CTATA	2	10	66525	66534	40 %	40 %	0 %	20 %	383486662
42	NC_017048	TTCTA	2	10	67270	67279	20 %	60 %	0 %	20 %	383486662
43	NC_017048	TGTTT	2	10	67914	67923	0 %	80 %	20 %	0 %	383486662
44	NC_017048	ATTGC	2	10	68388	68397	20 %	40 %	20 %	20 %	383486663
45	NC_017048	TAAAA	2	10	68593	68602	80 %	20 %	0 %	0 %	383486663
46	NC_017048	CAATC	2	10	69210	69219	40 %	20 %	0 %	40 %	383486663
47	NC_017048	GATTG	2	10	74995	75004	20 %	40 %	40 %	0 %	383486667
48	NC_017048	AGGAA	2	10	75017	75026	60 %	0 %	40 %	0 %	383486667
49	NC_017048	AAGTA	2	10	77342	77351	60 %	20 %	20 %	0 %	383486669
50	NC_017048	TATTT	2	10	79742	79751	20 %	80 %	0 %	0 %	383486671
51	NC_017048	AATTA	2	10	79775	79784	60 %	40 %	0 %	0 %	383486671
52	NC_017048	GAAAT	2	10	82646	82655	60 %	20 %	20 %	0 %	383486673
53	NC_017048	TGTTT	2	10	83801	83810	0 %	80 %	20 %	0 %	383486674
54	NC_017048	AAGAG	2	10	89477	89486	60 %	0 %	40 %	0 %	383486678
55	NC_017048	TTGAT	2	10	89698	89707	20 %	60 %	20 %	0 %	383486678
56	NC_017048	ACTTT	2	10	92279	92288	20 %	60 %	0 %	20 %	383486679
57	NC_017048	TTTCT	2	10	96716	96725	0 %	80 %	0 %	20 %	383486681
58	NC_017048	TATAT	2	10	98321	98330	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
59	NC_017048	TAATT	2	10	98438	98447	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
60	NC_017048	ATATT	2	10	99433	99442	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
61	NC_017048	GATTG	2	10	100249	100258	20 %	40 %	40 %	0 %	383486684
62	NC_017048	AATCT	2	10	101029	101038	40 %	40 %	0 %	20 %	383486685
63	NC_017048	ATTAT	2	10	101167	101176	40 %	60 %	0 %	0 %	383486685
64	NC_017048	ATTTT	2	10	101366	101375	20 %	80 %	0 %	0 %	383486685
65	NC_017048	ATTAC	2	10	106641	106650	40 %	40 %	0 %	20 %	383486688
66	NC_017048	AAGAT	2	10	107875	107884	60 %	20 %	20 %	0 %	383486689
67	NC_017048	CTTTA	2	10	108046	108055	20 %	60 %	0 %	20 %	383486689
68	NC_017048	TTGGA	2	10	109427	109436	20 %	40 %	40 %	0 %	383486689
69	NC_017048	GCATT	2	10	111831	111840	20 %	40 %	20 %	20 %	383486690
70	NC_017048	TTAAT	2	10	114603	114612	40 %	60 %	0 %	0 %	383486690
71	NC_017048	TTCAA	2	10	115424	115433	40 %	40 %	0 %	20 %	383486690
72	NC_017048	ATTAA	2	10	115766	115775	60 %	40 %	0 %	0 %	383486690
73	NC_017048	CCCTG	2	10	115916	115925	0 %	20 %	20 %	60 %	383486690
74	NC_017048	TTATC	2	10	118226	118235	20 %	60 %	0 %	20 %	383486691
75	NC_017048	TACCA	2	10	118398	118407	40 %	20 %	0 %	40 %	383486691
76	NC_017048	CACAT	2	10	123802	123811	40 %	20 %	0 %	40 %	383486695
77	NC_017048	ATGAG	2	10	125510	125519	40 %	20 %	40 %	0 %	383486699
78	NC_017048	TTCTA	2	10	133827	133836	20 %	60 %	0 %	20 %	383486703
79	NC_017048	TCTAA	2	10	137623	137632	40 %	40 %	0 %	20 %	383486705
80	NC_017048	TTATT	2	10	143475	143484	20 %	80 %	0 %	0 %	383486709
81	NC_017048	TTTTA	2	10	146300	146309	20 %	80 %	0 %	0 %	383486713
82	NC_017048	TAATT	2	10	146447	146456	40 %	60 %	0 %	0 %	383486713
83	NC_017048	AAATT	2	10	147153	147162	60 %	40 %	0 %	0 %	383486714
84	NC_017048	AAGCT	2	10	150071	150080	40 %	20 %	20 %	20 %	383486716
85	NC_017048	ATACC	2	10	150821	150830	40 %	20 %	0 %	40 %	383486716
86	NC_017048	CATTT	2	10	154748	154757	20 %	60 %	0 %	20 %	383486718
87	NC_017048	TTCTA	2	10	156045	156054	20 %	60 %	0 %	20 %	383486719
88	NC_017048	TACTA	2	10	156180	156189	40 %	40 %	0 %	20 %	383486719
89	NC_017048	ATTAA	2	10	156337	156346	60 %	40 %	0 %	0 %	383486719
90	NC_017048	AATAC	2	10	156626	156635	60 %	20 %	0 %	20 %	383486719
91	NC_017048	TATTT	2	10	157180	157189	20 %	80 %	0 %	0 %	383486720
92	NC_017048	TTTTA	2	10	157381	157390	20 %	80 %	0 %	0 %	383486720
93	NC_017048	TGCTT	2	10	158510	158519	0 %	60 %	20 %	20 %	383486720
94	NC_017048	TTTTA	2	10	160655	160664	20 %	80 %	0 %	0 %	383486722
95	NC_017048	TTATA	2	10	160900	160909	40 %	60 %	0 %	0 %	383486723
96	NC_017048	GTTTG	2	10	162721	162730	0 %	60 %	40 %	0 %	383486724
97	NC_017048	AGCAA	2	10	164486	164495	60 %	0 %	20 %	20 %	383486727
98	NC_017048	TTCAT	2	10	167518	167527	20 %	60 %	0 %	20 %	383486729
99	NC_017048	GATAT	2	10	167548	167557	40 %	40 %	20 %	0 %	383486729
100	NC_017048	AAAAT	2	10	167985	167994	80 %	20 %	0 %	0 %	383486731
101	NC_017048	ATATT	2	10	168337	168346	40 %	60 %	0 %	0 %	383486731
102	NC_017048	GTAGA	2	10	169268	169277	40 %	20 %	40 %	0 %	383486733
103	NC_017048	CAAAT	2	10	170014	170023	60 %	20 %	0 %	20 %	383486734
104	NC_017048	ACTCC	2	10	173515	173524	20 %	20 %	0 %	60 %	383486736
105	NC_017048	ATCTA	2	10	175239	175248	40 %	40 %	0 %	20 %	383486739
106	NC_017048	AAATT	2	10	175661	175670	60 %	40 %	0 %	0 %	383486740
107	NC_017048	TAAAT	2	10	177000	177009	60 %	40 %	0 %	0 %	383486740
108	NC_017048	TAAAA	2	10	178224	178233	80 %	20 %	0 %	0 %	383486740
109	NC_017048	TAAAA	2	10	178565	178574	80 %	20 %	0 %	0 %	383486740
110	NC_017048	AAGAA	2	10	178812	178821	80 %	0 %	20 %	0 %	383486740
111	NC_017048	TTTAC	2	10	179179	179188	20 %	60 %	0 %	20 %	383486740
112	NC_017048	AAATT	2	10	182694	182703	60 %	40 %	0 %	0 %	383486742
113	NC_017048	TGATA	2	10	184866	184875	40 %	40 %	20 %	0 %	383486743
114	NC_017048	ATTTT	2	10	185808	185817	20 %	80 %	0 %	0 %	383486744
115	NC_017048	TCAAA	2	10	186651	186660	60 %	20 %	0 %	20 %	383486746
116	NC_017048	GAATC	2	10	187662	187671	40 %	20 %	20 %	20 %	383486746
117	NC_017048	CTTTT	2	10	189229	189238	0 %	80 %	0 %	20 %	383486748
118	NC_017048	ATACT	2	10	190776	190785	40 %	40 %	0 %	20 %	383486749
119	NC_017048	TAAAT	2	10	191275	191284	60 %	40 %	0 %	0 %	383486750
120	NC_017048	TGTGG	2	10	195629	195638	0 %	40 %	60 %	0 %	383486754
121	NC_017048	TAAAT	2	10	196795	196804	60 %	40 %	0 %	0 %	383486756
122	NC_017048	AACTA	2	10	197257	197266	60 %	20 %	0 %	20 %	383486756
123	NC_017048	TTTTA	2	10	198982	198991	20 %	80 %	0 %	0 %	383486757
124	NC_017048	ATATC	2	10	199246	199255	40 %	40 %	0 %	20 %	383486757
125	NC_017048	TACGA	2	10	200956	200965	40 %	20 %	20 %	20 %	383486758
126	NC_017048	TTTCT	2	10	207457	207466	0 %	80 %	0 %	20 %	383486760
127	NC_017048	TAATA	2	10	208051	208060	60 %	40 %	0 %	0 %	383486760
128	NC_017048	TAAAT	2	10	208747	208756	60 %	40 %	0 %	0 %	383486760
129	NC_017048	ATTAA	2	10	209261	209270	60 %	40 %	0 %	0 %	383486760
130	NC_017048	AATTT	2	10	209759	209768	40 %	60 %	0 %	0 %	383486761
131	NC_017048	AAAAC	2	10	210284	210293	80 %	0 %	0 %	20 %	383486761
132	NC_017048	TACAA	2	10	210679	210688	60 %	20 %	0 %	20 %	383486761
133	NC_017048	TGATA	2	10	211559	211568	40 %	40 %	20 %	0 %	383486762
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135	NC_017048	TACTT	2	10	213491	213500	20 %	60 %	0 %	20 %	383486764
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