MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 2402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	ATTT	2	8	5705	5712	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
2	NC_017048	GTAT	2	8	5756	5763	25 %	50 %	25 %	0 %	383486605
3	NC_017048	TAAA	2	8	6250	6257	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
4	NC_017048	ATTT	2	8	6601	6608	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
5	NC_017048	TAAA	2	8	6664	6671	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
6	NC_017048	TTTC	2	8	7414	7421	0 %	75 %	0 %	25 %	383486606
7	NC_017048	AATG	2	8	7762	7769	50 %	25 %	25 %	0 %	383486607
8	NC_017048	CGGA	2	8	7841	7848	25 %	0 %	50 %	25 %	383486607
9	NC_017048	ATTT	2	8	9036	9043	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
10	NC_017048	AGAA	2	8	9206	9213	75 %	0 %	25 %	0 %	383486608
11	NC_017048	AGTG	2	8	9301	9308	25 %	25 %	50 %	0 %	383486608
12	NC_017048	CAAG	2	8	9328	9335	50 %	0 %	25 %	25 %	383486608
13	NC_017048	CTTG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
14	NC_017048	AAAT	2	8	10253	10260	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
15	NC_017048	ATTT	2	8	10286	10293	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
16	NC_017048	TGGT	2	8	10668	10675	0 %	50 %	50 %	0 %	383486608
17	NC_017048	TAAA	2	8	11066	11073	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
18	NC_017048	TTGC	2	8	11334	11341	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
19	NC_017048	AAAT	2	8	11441	11448	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
20	NC_017048	TATT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
21	NC_017048	CTTG	2	8	11542	11549	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
22	NC_017048	TTAA	2	8	11599	11606	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
23	NC_017048	TAAT	2	8	13295	13302	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
24	NC_017048	ATTA	2	8	13581	13588	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
25	NC_017048	TACT	2	8	13682	13689	25 %	50 %	0 %	25 %	383486609
26	NC_017048	AATA	2	8	14226	14233	75 %	25 %	0 %	0 %	383486609
27	NC_017048	ACTC	2	8	14436	14443	25 %	25 %	0 %	50 %	383486609
28	NC_017048	TACA	2	8	14697	14704	50 %	25 %	0 %	25 %	383486609
29	NC_017048	TAAA	2	8	16194	16201	75 %	25 %	0 %	0 %	383486610
30	NC_017048	AGAA	2	8	16659	16666	75 %	0 %	25 %	0 %	383486611
31	NC_017048	ACAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	0 %	25 %	383486612
32	NC_017048	TAAA	2	8	17571	17578	75 %	25 %	0 %	0 %	383486612
33	NC_017048	ATTA	2	8	17692	17699	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
34	NC_017048	AAAT	2	8	17769	17776	75 %	25 %	0 %	0 %	383486612
35	NC_017048	TGCT	2	8	17904	17911	0 %	50 %	25 %	25 %	383486612
36	NC_017048	TATT	2	8	18036	18043	25 %	75 %	0 %	0 %	383486612
37	NC_017048	ATTT	2	8	18180	18187	25 %	75 %	0 %	0 %	383486612
38	NC_017048	TACT	2	8	18595	18602	25 %	50 %	0 %	25 %	383486612
39	NC_017048	GGAA	2	8	19223	19230	50 %	0 %	50 %	0 %	383486612
40	NC_017048	ATTA	2	8	19264	19271	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
41	NC_017048	TACT	2	8	20409	20416	25 %	50 %	0 %	25 %	383486612
42	NC_017048	TAAT	2	8	21441	21448	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
43	NC_017048	TCAA	2	8	21808	21815	50 %	25 %	0 %	25 %	383486614
44	NC_017048	TTAT	2	8	22281	22288	25 %	75 %	0 %	0 %	383486614
45	NC_017048	GAAT	2	8	22443	22450	50 %	25 %	25 %	0 %	383486614
46	NC_017048	CTAC	2	8	23069	23076	25 %	25 %	0 %	50 %	383486615
47	NC_017048	GCTT	2	8	23760	23767	0 %	50 %	25 %	25 %	383486615
48	NC_017048	AAAT	2	8	26877	26884	75 %	25 %	0 %	0 %	383486616
49	NC_017048	AGAA	2	8	26908	26915	75 %	0 %	25 %	0 %	383486616
50	NC_017048	GTAC	2	8	28371	28378	25 %	25 %	25 %	25 %	383486618
51	NC_017048	ATAA	2	8	29278	29285	75 %	25 %	0 %	0 %	383486618
52	NC_017048	CAAC	2	8	29557	29564	50 %	0 %	0 %	50 %	383486618
53	NC_017048	TAAT	3	12	29896	29907	50 %	50 %	0 %	0 %	383486619
54	NC_017048	CTTT	2	8	29924	29931	0 %	75 %	0 %	25 %	383486619
55	NC_017048	TTCT	2	8	32075	32082	0 %	75 %	0 %	25 %	383486620
56	NC_017048	ATTA	2	8	32387	32394	50 %	50 %	0 %	0 %	383486620
57	NC_017048	CCTA	2	8	32408	32415	25 %	25 %	0 %	50 %	383486620
58	NC_017048	ATCC	2	8	32520	32527	25 %	25 %	0 %	50 %	383486620
59	NC_017048	CTTA	2	8	33684	33691	25 %	50 %	0 %	25 %	383486622
60	NC_017048	AAAT	2	8	33736	33743	75 %	25 %	0 %	0 %	383486622
61	NC_017048	TACT	2	8	34225	34232	25 %	50 %	0 %	25 %	383486622
62	NC_017048	TTGC	2	8	34503	34510	0 %	50 %	25 %	25 %	383486622
63	NC_017048	ATTA	2	8	34791	34798	50 %	50 %	0 %	0 %	383486623
64	NC_017048	ATTA	2	8	35100	35107	50 %	50 %	0 %	0 %	383486623
65	NC_017048	ATTA	2	8	36843	36850	50 %	50 %	0 %	0 %	383486624
66	NC_017048	TCTA	2	8	36982	36989	25 %	50 %	0 %	25 %	383486625
67	NC_017048	AGCA	2	8	37270	37277	50 %	0 %	25 %	25 %	383486625
68	NC_017048	AATA	2	8	37672	37679	75 %	25 %	0 %	0 %	383486626
69	NC_017048	ACCC	2	8	37789	37796	25 %	0 %	0 %	75 %	383486626
70	NC_017048	TAAA	2	8	37836	37843	75 %	25 %	0 %	0 %	383486626
71	NC_017048	ATCA	2	8	38008	38015	50 %	25 %	0 %	25 %	383486626
72	NC_017048	ATTT	2	8	38771	38778	25 %	75 %	0 %	0 %	383486627
73	NC_017048	TCTT	2	8	38926	38933	0 %	75 %	0 %	25 %	383486628
74	NC_017048	TCAG	2	8	39025	39032	25 %	25 %	25 %	25 %	383486628
75	NC_017048	ATTT	2	8	39234	39241	25 %	75 %	0 %	0 %	383486629
76	NC_017048	TCCT	2	8	39394	39401	0 %	50 %	0 %	50 %	383486629
77	NC_017048	TAAT	2	8	39518	39525	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
78	NC_017048	TGCT	2	8	39594	39601	0 %	50 %	25 %	25 %	383486629
79	NC_017048	AATT	2	8	39726	39733	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
80	NC_017048	TACT	2	8	39925	39932	25 %	50 %	0 %	25 %	383486630
81	NC_017048	TAAG	2	8	39939	39946	50 %	25 %	25 %	0 %	383486630
82	NC_017048	AAAG	2	8	40009	40016	75 %	0 %	25 %	0 %	383486630
83	NC_017048	TAAT	2	8	40235	40242	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
84	NC_017048	AAGC	2	8	40823	40830	50 %	0 %	25 %	25 %	383486630
85	NC_017048	ATTT	2	8	40857	40864	25 %	75 %	0 %	0 %	383486630
86	NC_017048	TTTA	2	8	41749	41756	25 %	75 %	0 %	0 %	383486632
87	NC_017048	GATA	2	8	41902	41909	50 %	25 %	25 %	0 %	383486633
88	NC_017048	ACCC	2	8	42072	42079	25 %	0 %	0 %	75 %	383486633
89	NC_017048	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	383486635
90	NC_017048	TATC	2	8	42913	42920	25 %	50 %	0 %	25 %	383486635
91	NC_017048	AGCA	2	8	43001	43008	50 %	0 %	25 %	25 %	383486635
92	NC_017048	TTTA	2	8	43148	43155	25 %	75 %	0 %	0 %	383486635
93	NC_017048	AGAA	2	8	43411	43418	75 %	0 %	25 %	0 %	383486636
94	NC_017048	AATT	2	8	43792	43799	50 %	50 %	0 %	0 %	383486637
95	NC_017048	ACTT	2	8	44041	44048	25 %	50 %	0 %	25 %	383486637
96	NC_017048	ATTA	2	8	44072	44079	50 %	50 %	0 %	0 %	383486638
97	NC_017048	ACTT	2	8	44111	44118	25 %	50 %	0 %	25 %	383486638
98	NC_017048	TAAT	2	8	44185	44192	50 %	50 %	0 %	0 %	383486638
99	NC_017048	ACCT	2	8	44617	44624	25 %	25 %	0 %	50 %	383486639
100	NC_017048	TATT	2	8	45448	45455	25 %	75 %	0 %	0 %	383486641
101	NC_017048	CTTT	2	8	45522	45529	0 %	75 %	0 %	25 %	383486641
102	NC_017048	ACTT	2	8	45786	45793	25 %	50 %	0 %	25 %	383486642
103	NC_017048	TCAT	2	8	45809	45816	25 %	50 %	0 %	25 %	383486642
104	NC_017048	ACCT	2	8	46030	46037	25 %	25 %	0 %	50 %	383486643
105	NC_017048	ATTA	2	8	46233	46240	50 %	50 %	0 %	0 %	383486644
106	NC_017048	TTAT	2	8	46751	46758	25 %	75 %	0 %	0 %	383486644
107	NC_017048	TTAA	2	8	46835	46842	50 %	50 %	0 %	0 %	383486644
108	NC_017048	TTAT	2	8	46938	46945	25 %	75 %	0 %	0 %	383486645
109	NC_017048	ATCT	2	8	47026	47033	25 %	50 %	0 %	25 %	383486645
110	NC_017048	CTTT	2	8	47482	47489	0 %	75 %	0 %	25 %	383486646
111	NC_017048	CCAA	2	8	47735	47742	50 %	0 %	0 %	50 %	383486647
112	NC_017048	TCTT	2	8	48172	48179	0 %	75 %	0 %	25 %	383486647
113	NC_017048	ATTT	2	8	48381	48388	25 %	75 %	0 %	0 %	383486647
114	NC_017048	TATT	2	8	48597	48604	25 %	75 %	0 %	0 %	383486648
115	NC_017048	TTTA	2	8	49240	49247	25 %	75 %	0 %	0 %	383486649
116	NC_017048	ACTA	2	8	50432	50439	50 %	25 %	0 %	25 %	383486651
117	NC_017048	TCAT	2	8	50506	50513	25 %	50 %	0 %	25 %	383486651
118	NC_017048	ATTA	2	8	50602	50609	50 %	50 %	0 %	0 %	383486652
119	NC_017048	TTAA	2	8	50694	50701	50 %	50 %	0 %	0 %	383486652
120	NC_017048	CACC	2	8	51067	51074	25 %	0 %	0 %	75 %	383486652
121	NC_017048	CATT	2	8	51205	51212	25 %	50 %	0 %	25 %	383486652
122	NC_017048	ACCT	2	8	51407	51414	25 %	25 %	0 %	50 %	383486652
123	NC_017048	CCAT	2	8	51486	51493	25 %	25 %	0 %	50 %	383486652
124	NC_017048	CTTT	2	8	51612	51619	0 %	75 %	0 %	25 %	383486652
125	NC_017048	TATG	2	8	52361	52368	25 %	50 %	25 %	0 %	383486653
126	NC_017048	ATAA	2	8	52449	52456	75 %	25 %	0 %	0 %	383486653
127	NC_017048	AATT	2	8	52876	52883	50 %	50 %	0 %	0 %	383486653
128	NC_017048	TCAT	2	8	53027	53034	25 %	50 %	0 %	25 %	383486653
129	NC_017048	AAGC	2	8	53503	53510	50 %	0 %	25 %	25 %	383486654
130	NC_017048	ACAA	2	8	53698	53705	75 %	0 %	0 %	25 %	383486654
131	NC_017048	TTAC	2	8	53897	53904	25 %	50 %	0 %	25 %	383486654
132	NC_017048	CACT	2	8	53956	53963	25 %	25 %	0 %	50 %	383486654
133	NC_017048	TATT	2	8	55450	55457	25 %	75 %	0 %	0 %	383486655
134	NC_017048	AACA	2	8	55678	55685	75 %	0 %	0 %	25 %	383486655
135	NC_017048	AAGA	2	8	56486	56493	75 %	0 %	25 %	0 %	383486655
136	NC_017048	TCCA	2	8	57709	57716	25 %	25 %	0 %	50 %	383486657
137	NC_017048	TAAG	3	12	57976	57987	50 %	25 %	25 %	0 %	383486657
138	NC_017048	GAAA	2	8	63692	63699	75 %	0 %	25 %	0 %	383486659
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