MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 62654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	CCG	2	6	50	55	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255906
2	NC_017047	GCA	2	6	72	77	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
3	NC_017047	ATA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255906
4	NC_017047	TGC	2	6	272	277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255906
5	NC_017047	GCA	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
6	NC_017047	GCG	3	9	496	504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255906
7	NC_017047	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
8	NC_017047	CAT	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255906
9	NC_017047	GTG	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
10	NC_017047	AAC	2	6	688	693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255906
11	NC_017047	TTC	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255906
12	NC_017047	CTG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255906
13	NC_017047	CAG	2	6	826	831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
14	NC_017047	ATC	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255906
15	NC_017047	AGA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
16	NC_017047	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255906
17	NC_017047	TGA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255906
18	NC_017047	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
19	NC_017047	CTT	2	6	1008	1013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255906
20	NC_017047	ATA	2	6	1172	1177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255906
21	NC_017047	GGT	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
22	NC_017047	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
23	NC_017047	AGA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
24	NC_017047	TTG	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255907
25	NC_017047	AGT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255907
26	NC_017047	GAC	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
27	NC_017047	TTA	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255907
28	NC_017047	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255907
29	NC_017047	CCA	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255907
30	NC_017047	CGA	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
31	NC_017047	ATT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255907
32	NC_017047	GAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255907
33	NC_017047	GCA	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
34	NC_017047	CGC	2	6	2183	2188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255907
35	NC_017047	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255907
36	NC_017047	CGG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255907
37	NC_017047	GGC	2	6	2723	2728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
38	NC_017047	CGG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
39	NC_017047	TGC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255908
40	NC_017047	CGG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
41	NC_017047	CGG	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
42	NC_017047	GTT	2	6	3097	3102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255908
43	NC_017047	TCA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255908
44	NC_017047	AGC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255908
45	NC_017047	CGC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255908
46	NC_017047	TCT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255908
47	NC_017047	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255908
48	NC_017047	CTC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255909
49	NC_017047	CAC	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255909
50	NC_017047	CGA	2	6	3930	3935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
51	NC_017047	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
52	NC_017047	GAA	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
53	NC_017047	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
54	NC_017047	TTC	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
55	NC_017047	TGG	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
56	NC_017047	CGA	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
57	NC_017047	CGG	2	6	4122	4127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255909
58	NC_017047	CGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
59	NC_017047	CCG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255909
60	NC_017047	CTG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
61	NC_017047	ATG	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
62	NC_017047	CAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255909
63	NC_017047	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
64	NC_017047	TCT	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
65	NC_017047	TGA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
66	NC_017047	TGG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
67	NC_017047	ATC	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255909
68	NC_017047	AGC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
69	NC_017047	CCG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255909
70	NC_017047	CAT	4	12	5262	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255909
71	NC_017047	TTC	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
72	NC_017047	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
73	NC_017047	TGG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
74	NC_017047	CGT	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
75	NC_017047	GCT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
76	NC_017047	AGC	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
77	NC_017047	GAA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
78	NC_017047	CGT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
79	NC_017047	ACC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255909
80	NC_017047	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255909
81	NC_017047	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
82	NC_017047	GTT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255909
83	NC_017047	GCA	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255910
84	NC_017047	TCG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255910
85	NC_017047	CAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255910
86	NC_017047	GTT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255910
87	NC_017047	CAA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255910
88	NC_017047	ACT	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255910
89	NC_017047	CAC	2	6	6737	6742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255910
90	NC_017047	ATG	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255910
91	NC_017047	CTG	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255910
92	NC_017047	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255910
93	NC_017047	TGA	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255910
94	NC_017047	GTG	2	6	7385	7390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255911
95	NC_017047	TCA	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255911
96	NC_017047	CCG	2	6	7557	7562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255911
97	NC_017047	CAT	2	6	7721	7726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255911
98	NC_017047	GAA	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255911
99	NC_017047	GTG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255911
100	NC_017047	GTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255911
101	NC_017047	ATG	2	6	7959	7964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255911
102	NC_017047	TGC	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255911
103	NC_017047	CGG	2	6	8182	8187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255911
104	NC_017047	GCA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255911
105	NC_017047	ACT	2	6	8491	8496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255912
106	NC_017047	CGA	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255912
107	NC_017047	GTC	2	6	8532	8537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255912
108	NC_017047	TTC	2	6	8588	8593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255912
109	NC_017047	AAT	2	6	8638	8643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255912
110	NC_017047	GCA	2	6	8650	8655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255912
111	NC_017047	CAG	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255912
112	NC_017047	AAT	2	6	8764	8769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255912
113	NC_017047	CAC	2	6	8779	8784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255912
114	NC_017047	TCG	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255912
115	NC_017047	TCA	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255912
116	NC_017047	GCG	2	6	8845	8850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255912
117	NC_017047	GCG	2	6	9337	9342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255913
118	NC_017047	ACA	2	6	9445	9450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255913
119	NC_017047	TGC	2	6	9451	9456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255913
120	NC_017047	CGT	2	6	9614	9619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255913
121	NC_017047	GTC	2	6	9626	9631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255913
122	NC_017047	TCC	2	6	9878	9883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255914
123	NC_017047	TGA	2	6	9902	9907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255914
124	NC_017047	CGG	2	6	10099	10104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255914
125	NC_017047	ATA	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255915
126	NC_017047	TGT	2	6	10500	10505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255915
127	NC_017047	GTA	2	6	10667	10672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255915
128	NC_017047	TTC	2	6	10721	10726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255915
129	NC_017047	ATT	2	6	10871	10876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255915
130	NC_017047	CTT	2	6	11542	11547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255916
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