MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 3375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	383494825
2	NC_017046	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	383494826
3	NC_017046	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	383494827
4	NC_017046	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	383494829
5	NC_017046	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017046	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	383494831
7	NC_017046	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017046	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017046	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017046	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	383494836
11	NC_017046	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017046	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	383494837
13	NC_017046	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017046	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	383494841
15	NC_017046	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	383494841
16	NC_017046	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	383494841
17	NC_017046	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	383494842
18	NC_017046	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	383494842
19	NC_017046	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	383494843
20	NC_017046	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	383494844
21	NC_017046	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	383494844
22	NC_017046	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	383494845
23	NC_017046	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	383494846
24	NC_017046	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	383494850
25	NC_017046	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	383494850
26	NC_017046	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	383494851
27	NC_017046	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	383494852
28	NC_017046	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	383494853
29	NC_017046	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017046	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	383494854
31	NC_017046	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017046	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017046	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017046	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	383494856
35	NC_017046	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	383494856
36	NC_017046	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	383494857
37	NC_017046	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	383494858
38	NC_017046	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017046	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017046	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	383494862
41	NC_017046	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	383494862
42	NC_017046	GGGCT	2	10	46562	46571	0 %	20 %	60 %	20 %	383494863
43	NC_017046	GCGTA	2	10	48438	48447	20 %	20 %	40 %	20 %	383494865
44	NC_017046	GACCA	2	10	49043	49052	40 %	0 %	20 %	40 %	383494865
45	NC_017046	CCGGC	2	10	49185	49194	0 %	0 %	40 %	60 %	383494865
46	NC_017046	CAGAC	2	10	50375	50384	40 %	0 %	20 %	40 %	383494865
47	NC_017046	TGTGC	2	10	53136	53145	0 %	40 %	40 %	20 %	383494870
48	NC_017046	GTTTG	2	10	55458	55467	0 %	60 %	40 %	0 %	383494871
49	NC_017046	CACTA	2	10	56589	56598	40 %	20 %	0 %	40 %	383494871
50	NC_017046	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	383494872
51	NC_017046	AGCGC	2	10	57235	57244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017046	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	383494873
53	NC_017046	AAAAT	2	10	58953	58962	80 %	20 %	0 %	0 %	383494875
54	NC_017046	GGAAA	2	10	59740	59749	60 %	0 %	40 %	0 %	383494875
55	NC_017046	CGCTG	2	10	60230	60239	0 %	20 %	40 %	40 %	383494876
56	NC_017046	GCCTG	2	10	64787	64796	0 %	20 %	40 %	40 %	383494879
57	NC_017046	GCGCG	2	10	64941	64950	0 %	0 %	60 %	40 %	383494880
58	NC_017046	CGTGC	2	10	71368	71377	0 %	20 %	40 %	40 %	383494887
59	NC_017046	TTGAT	2	10	71538	71547	20 %	60 %	20 %	0 %	383494887
60	NC_017046	ACCGC	2	10	72098	72107	20 %	0 %	20 %	60 %	383494887
61	NC_017046	ATTTG	2	10	75442	75451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017046	CGATG	2	10	77760	77769	20 %	20 %	40 %	20 %	383494892
63	NC_017046	GCGAA	2	10	78701	78710	40 %	0 %	40 %	20 %	383494892
64	NC_017046	CGTAC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	383494892
65	NC_017046	TTGCC	2	10	81227	81236	0 %	40 %	20 %	40 %	383494894
66	NC_017046	CGTCC	2	10	81337	81346	0 %	20 %	20 %	60 %	383494894
67	NC_017046	AAGCG	2	10	81700	81709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017046	TTCAG	2	10	84454	84463	20 %	40 %	20 %	20 %	383494897
69	NC_017046	GGCCA	2	10	84603	84612	20 %	0 %	40 %	40 %	383494897
70	NC_017046	GTACG	2	10	87174	87183	20 %	20 %	40 %	20 %	383494899
71	NC_017046	CAGAA	2	10	87887	87896	60 %	0 %	20 %	20 %	383494899
72	NC_017046	CCGCA	2	10	90005	90014	20 %	0 %	20 %	60 %	383494901
73	NC_017046	CGGTT	2	10	90510	90519	0 %	40 %	40 %	20 %	383494902
74	NC_017046	GCTCC	2	10	91646	91655	0 %	20 %	20 %	60 %	383494902
75	NC_017046	TGGCG	2	10	92290	92299	0 %	20 %	60 %	20 %	383494904
76	NC_017046	TAAAA	2	10	95765	95774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017046	TTTCC	2	10	96204	96213	0 %	60 %	0 %	40 %	383494908
78	NC_017046	GTGGC	2	10	96773	96782	0 %	20 %	60 %	20 %	383494908
79	NC_017046	GCGCT	2	10	97925	97934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017046	AGCGC	2	10	97992	98001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017046	TGCAC	2	10	98690	98699	20 %	20 %	20 %	40 %	383494909
82	NC_017046	TGGCA	2	10	98759	98768	20 %	20 %	40 %	20 %	383494909
83	NC_017046	TCTGT	2	10	99085	99094	0 %	60 %	20 %	20 %	383494910
84	NC_017046	GCGCT	2	10	99395	99404	0 %	20 %	40 %	40 %	383494910
85	NC_017046	GGCGC	2	10	99809	99818	0 %	0 %	60 %	40 %	383494910
86	NC_017046	GCGAC	2	10	100122	100131	20 %	0 %	40 %	40 %	383494910
87	NC_017046	AACGT	2	10	102579	102588	40 %	20 %	20 %	20 %	383494913
88	NC_017046	CCCAA	2	10	104729	104738	40 %	0 %	0 %	60 %	383494916
89	NC_017046	TTGTT	2	10	105436	105445	0 %	80 %	20 %	0 %	383494916
90	NC_017046	GCTTC	2	10	106816	106825	0 %	40 %	20 %	40 %	383494917
91	NC_017046	TGCGT	2	10	107103	107112	0 %	40 %	40 %	20 %	383494917
92	NC_017046	TGATC	2	10	108803	108812	20 %	40 %	20 %	20 %	383494918
93	NC_017046	AAGCG	2	10	109299	109308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017046	TGGCG	2	10	111963	111972	0 %	20 %	60 %	20 %	383494920
95	NC_017046	AGCGC	2	10	112523	112532	20 %	0 %	40 %	40 %	383494920
96	NC_017046	ACGTT	2	10	113340	113349	20 %	40 %	20 %	20 %	383494921
97	NC_017046	CCGCG	2	10	113608	113617	0 %	0 %	40 %	60 %	383494921
98	NC_017046	TAATT	2	10	116726	116735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017046	ATTTT	2	10	116752	116761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017046	ACAGA	2	10	116935	116944	60 %	0 %	20 %	20 %	383494923
101	NC_017046	CAGCG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	383494925
102	NC_017046	GCCGG	2	10	118410	118419	0 %	0 %	60 %	40 %	383494925
103	NC_017046	CGAGC	2	10	118535	118544	20 %	0 %	40 %	40 %	383494925
104	NC_017046	ATTTG	2	10	118978	118987	20 %	60 %	20 %	0 %	383494925
105	NC_017046	TTGCC	2	10	123482	123491	0 %	40 %	20 %	40 %	383494929
106	NC_017046	AGCAG	2	10	124159	124168	40 %	0 %	40 %	20 %	383494930
107	NC_017046	AGTTT	2	10	126389	126398	20 %	60 %	20 %	0 %	383494931
108	NC_017046	TAGTG	2	10	126807	126816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017046	TCGAT	2	10	128237	128246	20 %	40 %	20 %	20 %	383494932
110	NC_017046	CGGCG	2	10	130548	130557	0 %	0 %	60 %	40 %	383494934
111	NC_017046	CGTTT	2	10	131010	131019	0 %	60 %	20 %	20 %	383494934
112	NC_017046	GACCG	2	10	132454	132463	20 %	0 %	40 %	40 %	383494936
113	NC_017046	GGTTT	2	10	134166	134175	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017046	ATTCC	2	10	136111	136120	20 %	40 %	0 %	40 %	383494938
115	NC_017046	CCCAA	2	10	138180	138189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017046	AAAGC	2	10	138408	138417	60 %	0 %	20 %	20 %	383494940
117	NC_017046	CCGCA	2	10	138941	138950	20 %	0 %	20 %	60 %	383494940
118	NC_017046	TTGTT	2	10	139527	139536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017046	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	383494942
120	NC_017046	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017046	AAGCG	2	10	146065	146074	40 %	0 %	40 %	20 %	383494946
122	NC_017046	GTTTG	2	10	147968	147977	0 %	60 %	40 %	0 %	383494948
123	NC_017046	CGTAT	2	10	149439	149448	20 %	40 %	20 %	20 %	383494949
124	NC_017046	ATCAG	2	10	151275	151284	40 %	20 %	20 %	20 %	383494951
125	NC_017046	CTGCC	2	10	153284	153293	0 %	20 %	20 %	60 %	383494952
126	NC_017046	CGGCG	2	10	156014	156023	0 %	0 %	60 %	40 %	383494955
127	NC_017046	CGCGG	2	10	158664	158673	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017046	CCGGC	2	10	159368	159377	0 %	0 %	40 %	60 %	383494958
129	NC_017046	GATCA	2	10	162686	162695	40 %	20 %	20 %	20 %	383494961
130	NC_017046	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	383494962
131	NC_017046	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	383494964
132	NC_017046	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	383494964
133	NC_017046	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	383494965
134	NC_017046	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	383494966
135	NC_017046	CGAAC	2	10	168680	168689	40 %	0 %	20 %	40 %	383494967
136	NC_017046	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	383494967
137	NC_017046	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	383494968
138	NC_017046	CTGGA	2	10	170502	170511	20 %	20 %	40 %	20 %	383494969
139	NC_017046	CAGAA	2	10	172621	172630	60 %	0 %	20 %	20 %	383494971
140	NC_017046	CGAAG	2	10	175492	175501	40 %	0 %	40 %	20 %	383494973
141	NC_017046	GGCAT	2	10	182771	182780	20 %	20 %	40 %	20 %	383494977
142	NC_017046	GGCCA	2	10	183193	183202	20 %	0 %	40 %	40 %	383494978
143	NC_017046	GCGCC	2	10	183206	183215	0 %	0 %	40 %	60 %	383494978
144	NC_017046	CGTTT	2	10	183708	183717	0 %	60 %	20 %	20 %	383494978
145	NC_017046	GGGGA	2	10	183760	183769	20 %	0 %	80 %	0 %	383494978
146	NC_017046	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	383494981
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150	NC_017046	GCGCA	2	10	193993	194002	20 %	0 %	40 %	40 %	383494987
151	NC_017046	ATCGG	2	10	195384	195393	20 %	20 %	40 %	20 %	383494989
152	NC_017046	TATTG	2	10	196421	196430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017046	GCCGC	2	10	196594	196603	0 %	0 %	40 %	60 %	383494991
154	NC_017046	ATCCA	2	10	201944	201953	40 %	20 %	0 %	40 %	383494994
155	NC_017046	GCTTC	2	10	203902	203911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017046	CGGCG	2	10	204061	204070	0 %	0 %	60 %	40 %	383494997
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159	NC_017046	AGCGC	2	10	207576	207585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017046	CGGCG	2	10	209490	209499	0 %	0 %	60 %	40 %	383495001
161	NC_017046	TTCGG	2	10	210370	210379	0 %	40 %	40 %	20 %	383495002
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164	NC_017046	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_017046	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_017046	GGCGG	2	10	222367	222376	0 %	0 %	80 %	20 %	383495013
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176	NC_017046	TTCAA	2	10	224322	224331	40 %	40 %	0 %	20 %	383495014
177	NC_017046	GGAAT	2	10	225076	225085	40 %	20 %	40 %	0 %	383495014
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179	NC_017046	TGGCG	2	10	226938	226947	0 %	20 %	60 %	20 %	383495016
180	NC_017046	TGGTC	2	10	227066	227075	0 %	40 %	40 %	20 %	383495016
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183	NC_017046	ATATA	2	10	230554	230563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017046	GCACC	2	10	233326	233335	20 %	0 %	20 %	60 %	383495019
185	NC_017046	GCCGC	2	10	234862	234871	0 %	0 %	40 %	60 %	383495021
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210	NC_017046	GACCA	2	10	284906	284915	40 %	0 %	20 %	40 %	383495067
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214	NC_017046	ACCAG	2	10	286580	286589	40 %	0 %	20 %	40 %	383495070
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217	NC_017046	AATGA	2	10	288061	288070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_017046	TGGCA	2	10	297151	297160	20 %	20 %	40 %	20 %	383495075
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249	NC_017046	TATGT	2	10	329675	329684	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017046	AGCGC	2	10	330983	330992	20 %	0 %	40 %	40 %	383495105
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256	NC_017046	AAACA	2	10	339793	339802	80 %	0 %	0 %	20 %	383495112
257	NC_017046	AATGG	2	10	342067	342076	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017046	ACCCC	2	10	342828	342837	20 %	0 %	0 %	80 %	383495114
259	NC_017046	GCGTG	2	10	343639	343648	0 %	20 %	60 %	20 %	383495115
260	NC_017046	GATGG	2	10	345724	345733	20 %	20 %	60 %	0 %	383495116
261	NC_017046	TCTGT	2	10	347646	347655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_017046	TTACT	2	10	348240	348249	20 %	60 %	0 %	20 %	383495118
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264	NC_017046	TTTCA	2	10	350083	350092	20 %	60 %	0 %	20 %	383495119
265	NC_017046	CTGCG	2	10	352934	352943	0 %	20 %	40 %	40 %	383495122
266	NC_017046	GGAAC	2	10	353512	353521	40 %	0 %	40 %	20 %	383495122
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394	NC_017046	CAGGT	2	10	523949	523958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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398	NC_017046	CAGGG	2	10	529255	529264	20 %	0 %	60 %	20 %	383495282
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