MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017046	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017046	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017046	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017046	GTGAT	2	10	14912	14921	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017046	TATTG	2	10	17576	17585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017046	TTTTA	2	10	33211	33220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017046	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017046	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017046	TTTTA	2	10	35223	35232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017046	TGAAA	2	10	40127	40136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017046	TAAAA	2	10	44191	44200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017046	AGCGC	2	10	57235	57244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017046	ATTTG	2	10	75442	75451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017046	AAGCG	2	10	81700	81709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017046	TAAAA	2	10	95765	95774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017046	GCGCT	2	10	97925	97934	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017046	AGCGC	2	10	97992	98001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017046	AAGCG	2	10	109299	109308	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017046	TAATT	2	10	116726	116735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017046	ATTTT	2	10	116752	116761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017046	TAGTG	2	10	126807	126816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017046	GGTTT	2	10	134166	134175	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017046	CCCAA	2	10	138180	138189	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017046	TTGTT	2	10	139527	139536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017046	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017046	CGCGG	2	10	158664	158673	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017046	CTATA	2	10	189360	189369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017046	TATTG	2	10	196421	196430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017046	GCTTC	2	10	203902	203911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017046	AGCGC	2	10	207576	207585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017046	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017046	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017046	CTGTC	2	10	229842	229851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017046	ATATA	2	10	230554	230563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017046	TGCTC	2	10	246042	246051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017046	GTCTG	2	10	257102	257111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017046	GCGCT	2	10	279959	279968	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017046	TGTGT	2	10	286350	286359	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017046	AATGA	2	10	288061	288070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017046	GCTTC	2	10	290903	290912	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017046	AGCGA	2	10	292535	292544	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017046	AAATT	2	10	296813	296822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017046	ACAAA	2	10	298100	298109	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017046	TTGTT	2	10	311076	311085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017046	GGCCT	2	10	317535	317544	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017046	AATGC	2	10	329591	329600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017046	TATGT	2	10	329675	329684	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017046	AATGG	2	10	342067	342076	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017046	TCTGT	2	10	347646	347655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017046	CGGGG	2	10	369599	369608	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017046	AAAAT	2	10	370769	370778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017046	GCGTT	2	10	377193	377202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017046	AATGT	2	10	377688	377697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017046	TGAAA	2	10	377972	377981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017046	GATGC	2	10	389642	389651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017046	CGCTT	2	10	401130	401139	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017046	CCCGT	2	10	407851	407860	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017046	CGTTT	2	10	408178	408187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017046	CTTTG	2	10	417406	417415	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017046	TACGG	2	10	418413	418422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017046	GCTAA	2	10	435036	435045	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017046	ACAAT	2	10	441195	441204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017046	TTAAT	2	10	442061	442070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017046	AACGC	2	10	458190	458199	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017046	CTTTT	2	10	471478	471487	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017046	GCGCC	2	10	473056	473065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_017046	ACGAT	2	10	482779	482788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017046	CAGTA	2	10	487157	487166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017046	GCAAC	2	10	487268	487277	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017046	TTTGC	2	10	489552	489561	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017046	GTTTT	2	10	500875	500884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017046	ACTAA	2	10	505004	505013	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017046	GAAGA	2	10	507578	507587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017046	ATGCG	2	10	508011	508020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017046	GCGCT	2	10	521686	521695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017046	CAGGT	2	10	523949	523958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017046	TGTTA	2	10	525807	525816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017046	TTTAT	2	10	581837	581846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017046	AAAAT	2	10	590568	590577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017046	AGGGA	2	10	604175	604184	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017046	TCCTT	2	10	611996	612005	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017046	CTTCA	2	10	613029	613038	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017046	CTTTT	2	10	623539	623548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017046	GTCGC	2	10	638261	638270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017046	TGCGG	2	10	638456	638465	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017046	TGTAA	2	10	660639	660648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017046	TCCTC	2	10	666079	666088	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017046	TTGAT	2	10	669839	669848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017046	CATTT	2	10	670638	670647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017046	TTATT	2	10	691435	691444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017046	TTTGT	2	10	691461	691470	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017046	TTCAA	2	10	695340	695349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017046	ATAAG	2	10	696569	696578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017046	GCTGG	2	10	721298	721307	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017046	GTCCC	2	10	728283	728292	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017046	GGCGG	2	10	743511	743520	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017046	GCGCT	2	10	760848	760857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017046	GTTCT	2	10	780560	780569	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017046	AATAA	2	10	795277	795286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017046	AGCGC	2	10	800692	800701	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017046	TAAAA	2	10	808312	808321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017046	AGTTG	2	10	815263	815272	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017046	GGCGA	2	10	818312	818321	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017046	GGCGA	2	10	818724	818733	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017046	TGCGC	2	10	819264	819273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017046	TAGAT	2	10	822855	822864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017046	ACCGG	2	10	824127	824136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017046	GCGCT	2	10	835531	835540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017046	TATGG	2	10	840858	840867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017046	AGCGT	2	10	841254	841263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017046	AAAAT	2	10	841917	841926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017046	ATTCT	2	10	854079	854088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017046	AAATG	2	10	893927	893936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017046	ACCGC	2	10	901187	901196	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017046	CAGGG	2	10	924130	924139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017046	ATTTT	2	10	925260	925269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017046	GTCAG	2	10	932345	932354	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017046	ACGCG	2	10	945642	945651	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017046	CAAAT	2	10	953596	953605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017046	GCGCT	2	10	957075	957084	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017046	AGCGC	2	10	958089	958098	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017046	AGGCG	2	10	978653	978662	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017046	TTGTA	2	10	983398	983407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017046	CCCTA	2	10	1001707	1001716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017046	AAATC	2	10	1006045	1006054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017046	AAAAT	2	10	1007404	1007413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017046	GAGTT	2	10	1019172	1019181	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017046	TTTGC	2	10	1024794	1024803	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017046	TTTTC	2	10	1032081	1032090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017046	TTAGG	2	10	1041410	1041419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017046	TTTGA	2	10	1047683	1047692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017046	GCCGC	2	10	1051403	1051412	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_017046	TTTCA	2	10	1061153	1061162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017046	CCAAG	2	10	1062384	1062393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017046	CCTCG	2	10	1068992	1069001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017046	TGTGG	2	10	1069992	1070001	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017046	CAACC	2	10	1071425	1071434	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017046	CAGGG	2	10	1075588	1075597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017046	TATTG	2	10	1100005	1100014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017046	CGCTT	2	10	1112870	1112879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017046	TTTTC	2	10	1114180	1114189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017046	TTATT	2	10	1115020	1115029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017046	TTCTT	2	10	1116953	1116962	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017046	CCAGA	2	10	1117492	1117501	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017046	AGTCA	2	10	1133949	1133958	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_017046	GCGCT	2	10	1148815	1148824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017046	AGCGC	2	10	1150557	1150566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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259	NC_017046	CATCA	2	10	1915730	1915739	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_017046	GCGCT	2	10	1945924	1945933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_017046	CCTTC	2	10	1947717	1947726	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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276	NC_017046	TGTCT	2	10	1984838	1984847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_017046	TTTTA	2	10	2034097	2034106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017046	ATCAA	2	10	2034263	2034272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_017046	GGAAA	2	10	2035861	2035870	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017046	CAATA	2	10	2039635	2039644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_017046	AAAAG	2	10	2041121	2041130	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017046	TAGTT	2	10	2061012	2061021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017046	GGTAT	2	10	2063592	2063601	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017046	AATTG	2	10	2080251	2080260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_017046	TGCCG	2	10	2211163	2211172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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419	NC_017046	ATCGA	2	10	3116093	3116102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_017046	TTTGC	2	10	3135261	3135270	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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466	NC_017046	GCGCT	2	10	3554812	3554821	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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483	NC_017046	ATAAA	2	10	3649543	3649552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017046	ACGCT	2	10	3653370	3653379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_017046	GCGCT	2	10	3692110	3692119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_017046	GCGCT	2	10	3813990	3813999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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