MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 9366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	383494825
2	NC_017046	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	383494825
3	NC_017046	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	383494826
4	NC_017046	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	383494827
5	NC_017046	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	383494827
6	NC_017046	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	383494827
7	NC_017046	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	383494827
8	NC_017046	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	383494829
9	NC_017046	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	383494829
10	NC_017046	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	383494830
11	NC_017046	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	383494830
12	NC_017046	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	383494832
13	NC_017046	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	383494833
14	NC_017046	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	383494834
15	NC_017046	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	383494834
16	NC_017046	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	383494834
17	NC_017046	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	383494835
18	NC_017046	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	383494835
19	NC_017046	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	383494835
20	NC_017046	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	383494835
21	NC_017046	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	383494835
22	NC_017046	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	383494835
23	NC_017046	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	383494835
24	NC_017046	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	383494836
25	NC_017046	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	383494837
26	NC_017046	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	383494837
27	NC_017046	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	383494837
28	NC_017046	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	383494837
29	NC_017046	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	383494838
30	NC_017046	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	383494839
31	NC_017046	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	383494841
32	NC_017046	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	383494841
33	NC_017046	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	383494841
34	NC_017046	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	383494842
35	NC_017046	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	383494842
36	NC_017046	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	383494842
37	NC_017046	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	383494842
38	NC_017046	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	383494842
39	NC_017046	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	383494842
40	NC_017046	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	383494843
41	NC_017046	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	383494843
42	NC_017046	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	383494844
43	NC_017046	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	383494845
44	NC_017046	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	383494845
45	NC_017046	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	383494846
46	NC_017046	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	383494846
47	NC_017046	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	383494846
48	NC_017046	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	383494846
49	NC_017046	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	383494846
50	NC_017046	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
51	NC_017046	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
52	NC_017046	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	383494846
53	NC_017046	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	383494847
54	NC_017046	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	383494847
55	NC_017046	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	383494848
56	NC_017046	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	383494850
57	NC_017046	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	383494850
58	NC_017046	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	383494850
59	NC_017046	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	383494850
60	NC_017046	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	383494851
61	NC_017046	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	383494852
62	NC_017046	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	383494852
63	NC_017046	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	383494853
64	NC_017046	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	383494853
65	NC_017046	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	383494853
66	NC_017046	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	383494854
67	NC_017046	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	383494854
68	NC_017046	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	383494854
69	NC_017046	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	383494854
70	NC_017046	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	383494855
71	NC_017046	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	383494855
72	NC_017046	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	383494855
73	NC_017046	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	383494855
74	NC_017046	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	383494856
75	NC_017046	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	383494856
76	NC_017046	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	383494857
77	NC_017046	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	383494857
78	NC_017046	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	383494857
79	NC_017046	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	383494857
80	NC_017046	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	383494857
81	NC_017046	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	383494859
82	NC_017046	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	383494859
83	NC_017046	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	383494859
84	NC_017046	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	383494859
85	NC_017046	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	383494859
86	NC_017046	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	383494860
87	NC_017046	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	383494860
88	NC_017046	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	383494860
89	NC_017046	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	383494860
90	NC_017046	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	383494861
91	NC_017046	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	383494861
92	NC_017046	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	383494862
93	NC_017046	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	383494862
94	NC_017046	GAAA	2	8	46907	46914	75 %	0 %	25 %	0 %	383494863
95	NC_017046	TCGC	2	8	46922	46929	0 %	25 %	25 %	50 %	383494863
96	NC_017046	GCTG	2	8	47113	47120	0 %	25 %	50 %	25 %	383494863
97	NC_017046	CACG	2	8	47811	47818	25 %	0 %	25 %	50 %	383494864
98	NC_017046	CAGC	2	8	47838	47845	25 %	0 %	25 %	50 %	383494864
99	NC_017046	CTGC	2	8	47975	47982	0 %	25 %	25 %	50 %	383494864
100	NC_017046	CATG	2	8	48543	48550	25 %	25 %	25 %	25 %	383494865
101	NC_017046	AAGT	2	8	49337	49344	50 %	25 %	25 %	0 %	383494865
102	NC_017046	CCAG	2	8	49395	49402	25 %	0 %	25 %	50 %	383494865
103	NC_017046	TTGA	2	8	50176	50183	25 %	50 %	25 %	0 %	383494865
104	NC_017046	GAAA	2	8	50511	50518	75 %	0 %	25 %	0 %	383494866
105	NC_017046	GCCA	2	8	50852	50859	25 %	0 %	25 %	50 %	383494866
106	NC_017046	TAAA	2	8	51245	51252	75 %	25 %	0 %	0 %	383494866
107	NC_017046	TCTT	2	8	51364	51371	0 %	75 %	0 %	25 %	383494867
108	NC_017046	TGGC	2	8	53615	53622	0 %	25 %	50 %	25 %	383494870
109	NC_017046	GTTC	2	8	56032	56039	0 %	50 %	25 %	25 %	383494871
110	NC_017046	AGCC	2	8	57442	57449	25 %	0 %	25 %	50 %	383494873
111	NC_017046	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	383494873
112	NC_017046	ATGG	2	8	57654	57661	25 %	25 %	50 %	0 %	383494873
113	NC_017046	TGAT	2	8	58326	58333	25 %	50 %	25 %	0 %	383494874
114	NC_017046	TGGA	2	8	58995	59002	25 %	25 %	50 %	0 %	383494875
115	NC_017046	CCTG	2	8	59031	59038	0 %	25 %	25 %	50 %	383494875
116	NC_017046	GATT	2	8	59393	59400	25 %	50 %	25 %	0 %	383494875
117	NC_017046	GATC	2	8	59762	59769	25 %	25 %	25 %	25 %	383494875
118	NC_017046	CTGG	2	8	60887	60894	0 %	25 %	50 %	25 %	383494876
119	NC_017046	GTGG	2	8	61052	61059	0 %	25 %	75 %	0 %	383494876
120	NC_017046	CTGC	2	8	61262	61269	0 %	25 %	25 %	50 %	383494877
121	NC_017046	GCCA	2	8	64748	64755	25 %	0 %	25 %	50 %	383494879
122	NC_017046	GCTG	2	8	65136	65143	0 %	25 %	50 %	25 %	383494880
123	NC_017046	CGCC	2	8	65973	65980	0 %	0 %	25 %	75 %	383494880
124	NC_017046	CCAG	2	8	66168	66175	25 %	0 %	25 %	50 %	383494880
125	NC_017046	CTGC	2	8	66246	66253	0 %	25 %	25 %	50 %	383494880
126	NC_017046	ATTT	2	8	68670	68677	25 %	75 %	0 %	0 %	383494884
127	NC_017046	GTCG	2	8	68702	68709	0 %	25 %	50 %	25 %	383494884
128	NC_017046	GCAG	2	8	68987	68994	25 %	0 %	50 %	25 %	383494884
129	NC_017046	ACCG	2	8	69213	69220	25 %	0 %	25 %	50 %	383494884
130	NC_017046	GATC	2	8	69359	69366	25 %	25 %	25 %	25 %	383494884
131	NC_017046	GGCA	2	8	69736	69743	25 %	0 %	50 %	25 %	383494885
132	NC_017046	TCCA	2	8	69778	69785	25 %	25 %	0 %	50 %	383494885
133	NC_017046	GAAG	2	8	70614	70621	50 %	0 %	50 %	0 %	383494886
134	NC_017046	AAGG	2	8	70871	70878	50 %	0 %	50 %	0 %	383494886
135	NC_017046	CTGA	2	8	71480	71487	25 %	25 %	25 %	25 %	383494887
136	NC_017046	TGGG	2	8	71781	71788	0 %	25 %	75 %	0 %	383494887
137	NC_017046	CAAT	2	8	71914	71921	50 %	25 %	0 %	25 %	383494887
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