MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 70585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017046	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017046	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017046	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017046	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017046	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
7	NC_017046	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
8	NC_017046	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
9	NC_017046	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
10	NC_017046	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
11	NC_017046	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
12	NC_017046	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
13	NC_017046	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
14	NC_017046	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
15	NC_017046	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
16	NC_017046	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
17	NC_017046	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
18	NC_017046	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
19	NC_017046	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494825
20	NC_017046	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
21	NC_017046	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
22	NC_017046	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
23	NC_017046	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
24	NC_017046	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494825
25	NC_017046	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
26	NC_017046	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
27	NC_017046	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494825
28	NC_017046	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494825
29	NC_017046	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494825
30	NC_017046	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494825
31	NC_017046	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
32	NC_017046	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494825
33	NC_017046	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
34	NC_017046	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
35	NC_017046	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494825
36	NC_017046	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
37	NC_017046	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494825
38	NC_017046	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494825
39	NC_017046	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494825
40	NC_017046	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
41	NC_017046	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
42	NC_017046	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
43	NC_017046	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494825
44	NC_017046	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494825
45	NC_017046	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
46	NC_017046	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494825
47	NC_017046	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494825
48	NC_017046	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494825
49	NC_017046	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494825
50	NC_017046	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
51	NC_017046	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
52	NC_017046	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494826
53	NC_017046	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
54	NC_017046	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
55	NC_017046	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
56	NC_017046	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494826
57	NC_017046	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494826
58	NC_017046	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494826
59	NC_017046	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
60	NC_017046	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494826
61	NC_017046	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
62	NC_017046	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494826
63	NC_017046	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494826
64	NC_017046	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
65	NC_017046	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
66	NC_017046	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
67	NC_017046	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
68	NC_017046	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
69	NC_017046	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
70	NC_017046	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
71	NC_017046	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
72	NC_017046	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494827
73	NC_017046	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
74	NC_017046	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494827
75	NC_017046	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
76	NC_017046	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
77	NC_017046	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494827
78	NC_017046	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
79	NC_017046	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
80	NC_017046	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
81	NC_017046	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494827
82	NC_017046	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494827
83	NC_017046	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494827
84	NC_017046	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494827
85	NC_017046	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494827
86	NC_017046	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494827
87	NC_017046	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017046	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
89	NC_017046	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494828
90	NC_017046	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
91	NC_017046	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494828
92	NC_017046	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494828
93	NC_017046	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494828
94	NC_017046	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494828
95	NC_017046	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494828
96	NC_017046	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494828
97	NC_017046	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494828
98	NC_017046	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494828
99	NC_017046	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017046	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494829
101	NC_017046	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494829
102	NC_017046	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494829
103	NC_017046	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494829
104	NC_017046	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494829
105	NC_017046	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494829
106	NC_017046	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494829
107	NC_017046	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494829
108	NC_017046	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494829
109	NC_017046	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494829
110	NC_017046	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494829
111	NC_017046	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494829
112	NC_017046	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494829
113	NC_017046	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494829
114	NC_017046	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494829
115	NC_017046	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494829
116	NC_017046	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494829
117	NC_017046	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494829
118	NC_017046	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017046	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017046	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017046	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017046	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494830
123	NC_017046	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494830
124	NC_017046	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494830
125	NC_017046	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494830
126	NC_017046	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494830
127	NC_017046	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494830
128	NC_017046	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494830
129	NC_017046	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494830
130	NC_017046	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494830
131	NC_017046	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494830
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258	NC_017046	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017046	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_017046	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017046	TAT	2	6	16153	16158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494838
262	NC_017046	ATA	2	6	16218	16223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494838
263	NC_017046	GGC	2	6	16339	16344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494838
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270	NC_017046	AAT	2	6	17000	17005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494839
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277	NC_017046	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017046	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017046	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017046	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017046	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017046	ACT	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494841
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284	NC_017046	GAT	2	6	17948	17953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494841
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301	NC_017046	CGA	2	6	19387	19392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494841
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312	NC_017046	TCA	2	6	20125	20130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494842
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374	NC_017046	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_017046	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_017046	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_017046	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_017046	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_017046	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494844
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