MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 9194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017046	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017046	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017046	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017046	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017046	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017046	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017046	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017046	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017046	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017046	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017046	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017046	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017046	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017046	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017046	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017046	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017046	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017046	TTA	2	6	11332	11337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017046	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017046	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017046	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017046	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017046	TTC	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017046	TTG	2	6	14834	14839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017046	CAG	2	6	14877	14882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017046	TAT	2	6	14970	14975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017046	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017046	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017046	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017046	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017046	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017046	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017046	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017046	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017046	CCA	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017046	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017046	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017046	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017046	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017046	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017046	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017046	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017046	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017046	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017046	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017046	ATA	2	6	33134	33139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017046	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017046	TAA	2	6	33255	33260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017046	GTG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017046	ATG	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017046	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017046	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017046	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017046	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017046	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017046	TAG	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017046	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017046	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017046	TGT	2	6	35292	35297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017046	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017046	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017046	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017046	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017046	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017046	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017046	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017046	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017046	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017046	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017046	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017046	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017046	GTT	2	6	44214	44219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017046	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017046	TCA	2	6	46105	46110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017046	TAG	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017046	GAA	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017046	TAA	2	6	51313	51318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017046	ATT	2	6	51895	51900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017046	AGT	2	6	51960	51965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017046	ATT	2	6	51986	51991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017046	TTA	2	6	52014	52019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017046	GGT	2	6	52052	52057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017046	CTT	2	6	52608	52613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017046	GCA	2	6	52652	52657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017046	GCG	2	6	52738	52743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017046	GTG	2	6	57257	57262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017046	TGA	2	6	58772	58777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017046	GAA	2	6	58830	58835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017046	GTC	2	6	58845	58850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017046	TTC	2	6	61798	61803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017046	ATT	2	6	61846	61851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017046	CGA	2	6	61857	61862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017046	GTT	2	6	61927	61932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017046	AAT	2	6	62008	62013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017046	CAA	2	6	62109	62114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017046	CAA	2	6	62157	62162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017046	ATA	2	6	62209	62214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017046	GGT	3	9	62238	62246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017046	TGG	2	6	62282	62287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017046	CTG	3	9	62296	62304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017046	CAG	2	6	62341	62346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017046	TGG	2	6	62355	62360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017046	TGC	2	6	62381	62386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017046	TTG	2	6	62456	62461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017046	TAA	2	6	62469	62474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017046	AAT	2	6	62497	62502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017046	GCG	2	6	62570	62575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017046	AAG	2	6	62584	62589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017046	TGG	2	6	62608	62613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017046	GCG	2	6	62661	62666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017046	GCT	2	6	62771	62776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017046	GCG	2	6	62820	62825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017046	ACA	2	6	62834	62839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017046	CAG	3	9	62844	62852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017046	CGT	2	6	63041	63046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017046	CGC	2	6	63053	63058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017046	TGG	2	6	63329	63334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017046	ACG	2	6	66917	66922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017046	GAC	2	6	66931	66936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017046	TGC	2	6	67023	67028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017046	CCG	2	6	67036	67041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017046	CAT	2	6	67057	67062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017046	CCG	2	6	67097	67102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017046	GCC	2	6	67180	67185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017046	GAT	2	6	67217	67222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017046	GCG	2	6	67292	67297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017046	GAT	2	6	67327	67332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017046	GAA	2	6	67396	67401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017046	GCA	2	6	67463	67468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017046	AGT	2	6	67491	67496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017046	CGC	2	6	67506	67511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017046	CAA	2	6	67536	67541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017046	CAG	2	6	67549	67554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017046	GGT	2	6	67561	67566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017046	CCG	2	6	67584	67589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017046	TCA	2	6	67619	67624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017046	GAG	2	6	67702	67707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017046	GGC	2	6	67708	67713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017046	AAT	2	6	67717	67722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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