MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	CACAGC	2	12	31	42	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017045	TAATTA	2	12	7798	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017045	TAAAGA	2	12	9123	9134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017045	TAAAGA	2	12	11213	11224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017045	GAAATG	2	12	16701	16712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017045	TGGAGT	2	12	17076	17087	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017045	TGAAAA	2	12	17708	17719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017045	TAAAGA	2	12	25841	25852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017045	TCAAAT	2	12	46539	46550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017045	GTTGAT	2	12	49718	49729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017045	TTTTAT	3	18	54251	54268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017045	GGCGTT	2	12	56529	56540	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017045	TAGAAA	2	12	64554	64565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017045	TAAAGT	2	12	73656	73667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017045	TTTAGT	2	12	88082	88093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017045	AAAAAG	2	12	99256	99267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017045	AAATAT	2	12	99393	99404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017045	TTTAAC	2	12	121925	121936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017045	GATTTT	2	12	129342	129353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017045	GGATAC	2	12	174685	174696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017045	GGACAG	2	12	208345	208356	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017045	TGTCTG	2	12	210185	210196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017045	ATAGCC	2	12	211182	211193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017045	CCTGTG	2	12	216673	216684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017045	TTAGAG	2	12	231475	231486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017045	TTGGCT	2	12	235419	235430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017045	ATAAAA	2	12	244506	244517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017045	AAGAAA	2	12	269275	269286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017045	TCTTTT	2	12	270160	270171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017045	ATTCTA	2	12	282085	282096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017045	GATTTA	2	12	290770	290781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017045	GTTCAG	2	12	306068	306079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017045	TTAAAA	2	12	309173	309184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017045	ATTATA	2	12	310500	310511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017045	AAACAT	2	12	338013	338024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017045	CTTTTT	2	12	351195	351206	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017045	AAAATA	2	12	351621	351632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017045	ATAAAA	2	12	351699	351710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017045	ACCTAA	2	12	353144	353155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017045	GGAGCA	2	12	358873	358884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017045	TAAAAA	2	12	364772	364783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017045	AGGTGA	2	12	378387	378398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017045	TGTTGA	2	12	378960	378971	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017045	TTCTAA	2	12	379443	379454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017045	TACTTA	2	12	379581	379592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017045	TAAATA	2	12	440828	440839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017045	TTTACA	2	12	445381	445392	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017045	CAATTA	2	12	445421	445432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017045	GTTTTT	2	12	465828	465839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017045	GTAAAT	2	12	468777	468788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017045	AATAAA	2	12	484518	484529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017045	TAAAAA	2	12	498573	498584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017045	TAATTT	2	12	534583	534594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017045	TTTATT	2	12	558064	558075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017045	ATTTTT	2	12	607740	607751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017045	TTTAAA	2	12	617393	617404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017045	TTTTAG	2	12	620337	620348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017045	TTTTGG	2	12	622000	622011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017045	TTTTTA	2	12	633488	633499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017045	TCTACC	2	12	640858	640869	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017045	TTATAT	2	12	652898	652909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017045	ATTTAG	2	12	666661	666672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017045	TGTACT	2	12	689671	689682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017045	ATTACC	2	12	694072	694083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017045	GCCCAA	2	12	694578	694589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017045	AATCCA	2	12	726176	726187	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017045	AGATTA	2	12	726614	726625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017045	TAATTT	2	12	756857	756868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017045	ATTTAA	2	12	768853	768864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017045	GCTAAG	2	12	789438	789449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017045	AAATAA	2	12	792969	792980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017045	CCCATG	2	12	795512	795523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017045	AAACCA	2	12	824043	824054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017045	TATTTT	2	12	832355	832366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017045	ACAAAA	2	12	876886	876897	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017045	AAACTA	2	12	889507	889518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017045	TATCTT	2	12	900393	900404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017045	TTTTCT	2	12	914406	914417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017045	ATAAAA	2	12	919847	919858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017045	AGATTT	2	12	920571	920582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017045	GTGCTA	2	12	921200	921211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017045	TTTATT	2	12	925517	925528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017045	TCGTTT	2	12	926225	926236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017045	AGTAAT	2	12	926319	926330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017045	ATAAAT	2	12	927557	927568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017045	AAATTA	2	12	950180	950191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017045	TTAATT	2	12	1015705	1015716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017045	TCGCTT	2	12	1052632	1052643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017045	TTAAGT	2	12	1066288	1066299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017045	ATTTTT	2	12	1066360	1066371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017045	ATTATG	2	12	1068615	1068626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017045	ATTAAA	2	12	1073219	1073230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017045	TCTTAC	2	12	1075274	1075285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017045	CTCAAT	2	12	1075568	1075579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017045	GGACAA	2	12	1075829	1075840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017045	TGATGC	2	12	1077460	1077471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017045	ACTACA	2	12	1078809	1078820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017045	CAATGG	2	12	1079002	1079013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017045	TTTAAG	2	12	1079540	1079551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017045	CAACTT	2	12	1079623	1079634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017045	CTAGAG	2	12	1080069	1080080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017045	TAAAAC	2	12	1080612	1080623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017045	AAAAAT	2	12	1097449	1097460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017045	CTGATA	2	12	1104821	1104832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017045	TAAAAA	2	12	1122044	1122055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017045	TAAAAA	2	12	1122117	1122128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017045	TTAAAA	2	12	1131653	1131664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017045	TTAAAG	2	12	1140044	1140055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017045	TTTATT	2	12	1143787	1143798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017045	TTATCT	2	12	1155090	1155101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017045	CATAAA	2	12	1177477	1177488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017045	GAAATA	2	12	1196420	1196431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017045	TAAAAA	2	12	1221647	1221658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017045	ATTTGA	2	12	1295292	1295303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017045	TCGCTT	2	12	1317109	1317120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017045	ATTTTA	2	12	1353747	1353758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017045	TTTTAA	2	12	1390214	1390225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017045	TTGAAT	2	12	1400571	1400582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017045	ATAAAA	2	12	1420002	1420013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017045	TGTAGG	2	12	1466300	1466311	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017045	TTTTTA	2	12	1468595	1468606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017045	AGTAAA	2	12	1469184	1469195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017045	TAAAAA	2	12	1484882	1484893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017045	TGTTTT	2	12	1510345	1510356	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017045	ATTTTT	2	12	1540866	1540877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017045	ATTTAA	2	12	1542595	1542606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017045	TTCTTT	2	12	1553557	1553568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017045	TAAAAG	2	12	1579437	1579448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017045	TAAAGA	2	12	1632479	1632490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.