MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	GAAACA	2	12	1483	1494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383484661
2	NC_017045	AATAAA	2	12	2531	2542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383484662
3	NC_017045	CTTTTT	2	12	3327	3338	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484664
4	NC_017045	TGAATT	2	12	6799	6810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484668
5	NC_017045	CGACAA	2	12	7152	7163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383484669
6	NC_017045	CAAAAA	2	12	12627	12638	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383484673
7	NC_017045	CCCAAG	2	12	14529	14540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383484675
8	NC_017045	AGAAAA	2	12	15069	15080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383484675
9	NC_017045	AATTGC	2	12	18231	18242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484679
10	NC_017045	AATATG	2	12	29593	29604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484693
11	NC_017045	TTTTGT	2	12	44001	44012	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484711
12	NC_017045	ATAAAT	2	12	45414	45425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484713
13	NC_017045	AATAGC	2	12	48972	48983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484716
14	NC_017045	GTTTTG	2	12	58950	58961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484725
15	NC_017045	GTAATG	2	12	65400	65411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484732
16	NC_017045	CGATGG	2	12	66677	66688	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383484733
17	NC_017045	AGGAGA	2	12	69543	69554	50 %	0 %	50 %	0 %	383484734
18	NC_017045	CTTTAG	2	12	77980	77991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484742
19	NC_017045	TAAAAC	2	12	78456	78467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484743
20	NC_017045	AAAAAG	2	12	79834	79845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383484744
21	NC_017045	AACCTA	2	12	80360	80371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383484745
22	NC_017045	TGTTTC	2	12	88588	88599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484751
23	NC_017045	GCCACC	2	12	92134	92145	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383484753
24	NC_017045	GTTTCA	2	12	93938	93949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484754
25	NC_017045	TTTATT	2	12	99055	99066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484759
26	NC_017045	CTGTTG	2	12	100722	100733	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383484762
27	NC_017045	TGCTTC	2	12	104684	104695	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383484767
28	NC_017045	CTTTTG	2	12	109656	109667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484771
29	NC_017045	TAGCTT	2	12	111026	111037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484771
30	NC_017045	GTCTTT	2	12	111147	111158	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484771
31	NC_017045	GCTTCT	2	12	118680	118691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383484781
32	NC_017045	AGGGTT	2	12	120902	120913	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484785
33	NC_017045	TTTACT	2	12	121628	121639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383484787
34	NC_017045	ATTCCT	2	12	121757	121768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484787
35	NC_017045	TTTTTG	2	12	124649	124660	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484791
36	NC_017045	CATATA	2	12	128056	128067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484795
37	NC_017045	TGCTTG	2	12	131900	131911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383484802
38	NC_017045	ATTTTC	2	12	132309	132320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383484803
39	NC_017045	TCGTAT	2	12	135147	135158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484810
40	NC_017045	TACCTT	2	12	139078	139089	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484818
41	NC_017045	TTTTTC	2	12	139184	139195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484818
42	NC_017045	ACATTG	2	12	139533	139544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484820
43	NC_017045	AATGTT	2	12	144100	144111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484830
44	NC_017045	AGACAA	2	12	146133	146144	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383484832
45	NC_017045	GAAAGA	2	12	147997	148008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484834
46	NC_017045	TTTTAT	2	12	148019	148030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484834
47	NC_017045	ATATTG	2	12	148365	148376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484834
48	NC_017045	TTCCGC	2	12	149546	149557	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383484836
49	NC_017045	AACCAG	2	12	153872	153883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383484842
50	NC_017045	GCATAG	2	12	155189	155200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383484842
51	NC_017045	ATCAAA	2	12	158295	158306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484843
52	NC_017045	AGACCC	2	12	159622	159633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383484844
53	NC_017045	TAGTCC	2	12	163259	163270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383484849
54	NC_017045	GATTAA	2	12	166766	166777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484852
55	NC_017045	TCTAAA	2	12	167221	167232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484852
56	NC_017045	TGCATT	2	12	169911	169922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484853
57	NC_017045	CAAACT	2	12	170805	170816	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383484854
58	NC_017045	CTAAAA	2	12	171572	171583	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484855
59	NC_017045	ACTCCA	2	12	172324	172335	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383484857
60	NC_017045	ATAAGA	2	12	173029	173040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484857
61	NC_017045	GTAAAT	2	12	176443	176454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484859
62	NC_017045	CTTTTT	2	12	180818	180829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484865
63	NC_017045	CCAAAA	2	12	183035	183046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484867
64	NC_017045	TCTAAC	2	12	184114	184125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484867
65	NC_017045	AATGCT	2	12	185338	185349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484867
66	NC_017045	TACAGA	2	12	186908	186919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484868
67	NC_017045	AGAATA	2	12	187756	187767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484869
68	NC_017045	GTAAAT	2	12	190587	190598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484870
69	NC_017045	ATCTAA	2	12	198106	198117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484876
70	NC_017045	GTAATG	2	12	200365	200376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484877
71	NC_017045	AGCATT	2	12	202887	202898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484881
72	NC_017045	AGCTCC	2	12	204656	204667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383484882
73	NC_017045	TGGTGC	2	12	218144	218155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383484891
74	NC_017045	TATAGA	2	12	220818	220829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484895
75	NC_017045	GTTAAA	2	12	224364	224375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484897
76	NC_017045	TATGGG	2	12	228406	228417	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484900
77	NC_017045	CAAAAA	2	12	229157	229168	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383484901
78	NC_017045	GTTTGG	2	12	231850	231861	0 %	50 %	50 %	0 %	383484903
79	NC_017045	AATGTA	2	12	232889	232900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484904
80	NC_017045	CGTCAG	2	12	233290	233301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383484905
81	NC_017045	TTTGTT	2	12	233561	233572	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484905
82	NC_017045	CATTTC	2	12	240349	240360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484910
83	NC_017045	TTCTTT	2	12	242292	242303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484912
84	NC_017045	AAACTG	2	12	245427	245438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484915
85	NC_017045	ATGAAA	2	12	247143	247154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484916
86	NC_017045	GCTAGA	2	12	249483	249494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383484917
87	NC_017045	TGAAAG	2	12	257775	257786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383484924
88	NC_017045	TTAGGA	2	12	259805	259816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484925
89	NC_017045	TTAGCA	2	12	259832	259843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484925
90	NC_017045	ATGCTT	2	12	261211	261222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484926
91	NC_017045	TCCTTA	2	12	265250	265261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484929
92	NC_017045	TTTATT	2	12	267449	267460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484930
93	NC_017045	TGAAAA	2	12	270567	270578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484932
94	NC_017045	TTTAAC	2	12	273351	273362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383484932
95	NC_017045	AGGAGA	2	12	276942	276953	50 %	0 %	50 %	0 %	383484938
96	NC_017045	ACTAAA	2	12	283734	283745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484946
97	NC_017045	GTTTTC	2	12	285074	285085	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484947
98	NC_017045	ATCTAC	2	12	285890	285901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484947
99	NC_017045	ATTTCA	2	12	288671	288682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383484950
100	NC_017045	ATTAGC	2	12	289732	289743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484951
101	NC_017045	GGTTAG	2	12	290605	290616	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484952
102	NC_017045	GTTTTG	2	12	292554	292565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484954
103	NC_017045	AAATTA	2	12	298130	298141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484958
104	NC_017045	TAAACT	2	12	299283	299294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484959
105	NC_017045	TAGGTT	2	12	302767	302778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383484962
106	NC_017045	AGGCAA	2	12	308275	308286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383484968
107	NC_017045	TAGTGG	2	12	308738	308749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484968
108	NC_017045	AAGATA	2	12	311055	311066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484970
109	NC_017045	AGTAAA	2	12	312114	312125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484970
110	NC_017045	TGCGGG	2	12	312469	312480	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383484971
111	NC_017045	GCTTTA	2	12	315543	315554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484974
112	NC_017045	TAAAAC	2	12	316373	316384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484974
113	NC_017045	GCATCT	2	12	316613	316624	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383484975
114	NC_017045	CTTTTT	2	12	318829	318840	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484978
115	NC_017045	AAAATA	2	12	323185	323196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383484983
116	NC_017045	GCTAAA	2	12	323436	323447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484983
117	NC_017045	GGTGCT	2	12	325376	325387	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383484986
118	NC_017045	AATAAA	2	12	328034	328045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383484988
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234	NC_017045	AATTTG	2	12	613232	613243	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383485234
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240	NC_017045	GCTAAC	2	12	626878	626889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383485247
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340	NC_017045	TTCGTT	2	12	869325	869336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383485462
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343	NC_017045	CGAAGG	2	12	874005	874016	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383485466
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347	NC_017045	TCTTCC	2	12	881180	881191	0 %	50 %	0 %	50 %	383485473
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