MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 2004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	AGTTT	2	10	1625	1634	20 %	60 %	20 %	0 %	383484661
2	NC_017045	TGTGG	2	10	2223	2232	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017045	ATCAA	2	10	4569	4578	60 %	20 %	0 %	20 %	383484665
4	NC_017045	TTCAA	2	10	8197	8206	40 %	40 %	0 %	20 %	383484670
5	NC_017045	TTCAA	2	10	8456	8465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017045	AAAGG	2	10	10325	10334	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017045	AAATG	2	10	11483	11492	60 %	20 %	20 %	0 %	383484672
8	NC_017045	AAGAA	2	10	11849	11858	80 %	0 %	20 %	0 %	383484672
9	NC_017045	AACGC	2	10	12445	12454	40 %	0 %	20 %	40 %	383484673
10	NC_017045	TACTT	2	10	13639	13648	20 %	60 %	0 %	20 %	383484674
11	NC_017045	AAAGA	2	10	15638	15647	80 %	0 %	20 %	0 %	383484676
12	NC_017045	GAATT	2	10	16590	16599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017045	AATAA	2	10	16885	16894	80 %	20 %	0 %	0 %	383484677
14	NC_017045	TTCAA	2	10	17746	17755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017045	ATAAA	2	10	18617	18626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017045	GATGT	2	10	18842	18851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017045	AGGAA	2	10	18900	18909	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017045	TTGAA	2	10	19098	19107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017045	TTCAA	2	10	19794	19803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017045	TTAAA	2	10	20723	20732	60 %	40 %	0 %	0 %	383484680
21	NC_017045	GTTTT	2	10	20891	20900	0 %	80 %	20 %	0 %	383484680
22	NC_017045	TTGAA	2	10	21459	21468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017045	TTCAA	2	10	21497	21506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017045	TGGAA	2	10	21743	21752	40 %	20 %	40 %	0 %	383484681
25	NC_017045	ACTAA	2	10	22420	22429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017045	TAAAG	2	10	22763	22772	60 %	20 %	20 %	0 %	383484682
27	NC_017045	ACTTA	2	10	23446	23455	40 %	40 %	0 %	20 %	383484683
28	NC_017045	TCAAT	2	10	23752	23761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017045	ATTTA	2	10	23768	23777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017045	AAAGG	2	10	24953	24962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017045	AAAAT	2	10	27692	27701	80 %	20 %	0 %	0 %	383484691
32	NC_017045	CGGCT	2	10	28350	28359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017045	ATGGA	2	10	29194	29203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017045	TTGAA	2	10	30778	30787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017045	TCAAT	2	10	34585	34594	40 %	40 %	0 %	20 %	383484700
36	NC_017045	AAAGA	2	10	35383	35392	80 %	0 %	20 %	0 %	383484701
37	NC_017045	TTTAA	2	10	37250	37259	40 %	60 %	0 %	0 %	383484704
38	NC_017045	ATTTT	2	10	38469	38478	20 %	80 %	0 %	0 %	383484705
39	NC_017045	AGACA	2	10	40672	40681	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017045	ACAGA	2	10	41649	41658	60 %	0 %	20 %	20 %	383484708
41	NC_017045	TTTAT	2	10	41953	41962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017045	TAGAG	2	10	45274	45283	40 %	20 %	40 %	0 %	383484713
43	NC_017045	ATTTT	2	10	45444	45453	20 %	80 %	0 %	0 %	383484713
44	NC_017045	TTTTA	2	10	45826	45835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017045	AGAGC	2	10	46083	46092	40 %	0 %	40 %	20 %	383484714
46	NC_017045	TATTT	2	10	46529	46538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017045	ATGTT	2	10	46798	46807	20 %	60 %	20 %	0 %	383484715
48	NC_017045	TTTCA	2	10	47046	47055	20 %	60 %	0 %	20 %	383484715
49	NC_017045	ACCAA	2	10	48933	48942	60 %	0 %	0 %	40 %	383484716
50	NC_017045	TTTGT	2	10	49571	49580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017045	GTAGG	2	10	50109	50118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017045	GGTAA	2	10	50598	50607	40 %	20 %	40 %	0 %	383484717
53	NC_017045	CCTAA	2	10	51081	51090	40 %	20 %	0 %	40 %	383484717
54	NC_017045	TAAAT	2	10	53050	53059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017045	AGAAA	2	10	53214	53223	80 %	0 %	20 %	0 %	383484719
56	NC_017045	TTTTA	2	10	53309	53318	20 %	80 %	0 %	0 %	383484719
57	NC_017045	TCCTA	2	10	54701	54710	20 %	40 %	0 %	40 %	383484721
58	NC_017045	GTAAA	2	10	58670	58679	60 %	20 %	20 %	0 %	383484724
59	NC_017045	CATTA	2	10	59282	59291	40 %	40 %	0 %	20 %	383484725
60	NC_017045	AACTA	2	10	64433	64442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017045	AACCA	2	10	64475	64484	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017045	AACTA	2	10	64517	64526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017045	TATTT	2	10	64672	64681	20 %	80 %	0 %	0 %	383484731
64	NC_017045	AATAC	2	10	65341	65350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017045	AATTT	2	10	65892	65901	40 %	60 %	0 %	0 %	383484732
66	NC_017045	AAGAA	2	10	68981	68990	80 %	0 %	20 %	0 %	383484734
67	NC_017045	ATTAT	2	10	69403	69412	40 %	60 %	0 %	0 %	383484734
68	NC_017045	TAAAA	2	10	70557	70566	80 %	20 %	0 %	0 %	383484734
69	NC_017045	TAAGA	2	10	72772	72781	60 %	20 %	20 %	0 %	383484735
70	NC_017045	AAACT	2	10	75455	75464	60 %	20 %	0 %	20 %	383484739
71	NC_017045	AAAAG	2	10	77199	77208	80 %	0 %	20 %	0 %	383484741
72	NC_017045	TGCTT	2	10	77903	77912	0 %	60 %	20 %	20 %	383484742
73	NC_017045	TTTTC	2	10	78103	78112	0 %	80 %	0 %	20 %	383484742
74	NC_017045	GTAGT	2	10	79533	79542	20 %	40 %	40 %	0 %	383484743
75	NC_017045	TTATA	2	10	80856	80865	40 %	60 %	0 %	0 %	383484745
76	NC_017045	AAAGT	2	10	81072	81081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017045	GGCTT	2	10	81860	81869	0 %	40 %	40 %	20 %	383484746
78	NC_017045	GTGTT	2	10	83032	83041	0 %	60 %	40 %	0 %	383484746
79	NC_017045	TTCCG	2	10	84302	84311	0 %	40 %	20 %	40 %	383484747
80	NC_017045	GTGAA	2	10	85061	85070	40 %	20 %	40 %	0 %	383484747
81	NC_017045	TTTAG	2	10	85288	85297	20 %	60 %	20 %	0 %	383484747
82	NC_017045	AAAAT	3	15	86879	86893	80 %	20 %	0 %	0 %	383484749
83	NC_017045	GAGTA	2	10	88522	88531	40 %	20 %	40 %	0 %	383484751
84	NC_017045	ATCAG	2	10	88770	88779	40 %	20 %	20 %	20 %	383484751
85	NC_017045	GTTTT	2	10	91038	91047	0 %	80 %	20 %	0 %	383484751
86	NC_017045	GGGAA	2	10	91270	91279	40 %	0 %	60 %	0 %	383484752
87	NC_017045	AGTTA	2	10	91424	91433	40 %	40 %	20 %	0 %	383484752
88	NC_017045	TTTTG	2	10	93114	93123	0 %	80 %	20 %	0 %	383484754
89	NC_017045	CGTTT	2	10	93165	93174	0 %	60 %	20 %	20 %	383484754
90	NC_017045	AAGAT	2	10	94564	94573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017045	AGCGG	2	10	95671	95680	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017045	CTTTT	2	10	98476	98485	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017045	TAAAG	2	10	99517	99526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017045	AGCAC	2	10	100535	100544	40 %	0 %	20 %	40 %	383484762
95	NC_017045	CGTGT	2	10	100578	100587	0 %	40 %	40 %	20 %	383484762
96	NC_017045	GGTTT	2	10	106055	106064	0 %	60 %	40 %	0 %	383484767
97	NC_017045	CAACC	2	10	107532	107541	40 %	0 %	0 %	60 %	383484768
98	NC_017045	CATTT	2	10	108088	108097	20 %	60 %	0 %	20 %	383484769
99	NC_017045	CATAG	2	10	108272	108281	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017045	AAACT	2	10	108488	108497	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017045	ATTTT	2	10	108902	108911	20 %	80 %	0 %	0 %	383484771
102	NC_017045	TCATC	2	10	109316	109325	20 %	40 %	0 %	40 %	383484771
103	NC_017045	TCTCT	2	10	109759	109768	0 %	60 %	0 %	40 %	383484771
104	NC_017045	CCTCT	2	10	111485	111494	0 %	40 %	0 %	60 %	383484771
105	NC_017045	ACCCA	2	10	113535	113544	40 %	0 %	0 %	60 %	383484772
106	NC_017045	AAATC	2	10	113963	113972	60 %	20 %	0 %	20 %	383484773
107	NC_017045	CTTTG	2	10	115303	115312	0 %	60 %	20 %	20 %	383484774
108	NC_017045	CAGAA	2	10	115425	115434	60 %	0 %	20 %	20 %	383484775
109	NC_017045	TTTTC	2	10	117116	117125	0 %	80 %	0 %	20 %	383484778
110	NC_017045	GACCC	2	10	117255	117264	20 %	0 %	20 %	60 %	383484778
111	NC_017045	GTAGG	2	10	117575	117584	20 %	20 %	60 %	0 %	383484779
112	NC_017045	TAGTT	2	10	120128	120137	20 %	60 %	20 %	0 %	383484783
113	NC_017045	AAATT	2	10	121270	121279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017045	CTTAT	2	10	121368	121377	20 %	60 %	0 %	20 %	383484786
115	NC_017045	ATAAA	2	10	122242	122251	80 %	20 %	0 %	0 %	383484788
116	NC_017045	GCATA	2	10	123574	123583	40 %	20 %	20 %	20 %	383484791
117	NC_017045	CTTGT	2	10	124007	124016	0 %	60 %	20 %	20 %	383484791
118	NC_017045	GAAAA	2	10	124057	124066	80 %	0 %	20 %	0 %	383484791
119	NC_017045	AAAAG	2	10	127622	127631	80 %	0 %	20 %	0 %	383484795
120	NC_017045	TGCAT	2	10	129097	129106	20 %	40 %	20 %	20 %	383484798
121	NC_017045	TTTGT	2	10	129233	129242	0 %	80 %	20 %	0 %	383484798
122	NC_017045	ATTAA	2	10	129380	129389	60 %	40 %	0 %	0 %	383484799
123	NC_017045	TTTTC	2	10	129449	129458	0 %	80 %	0 %	20 %	383484799
124	NC_017045	CAAAG	2	10	130590	130599	60 %	0 %	20 %	20 %	383484801
125	NC_017045	AAAAT	2	10	130831	130840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017045	TATTT	2	10	130927	130936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017045	TTCTT	2	10	131453	131462	0 %	80 %	0 %	20 %	383484802
128	NC_017045	CTTTT	2	10	131672	131681	0 %	80 %	0 %	20 %	383484802
129	NC_017045	ATTTT	2	10	133320	133329	20 %	80 %	0 %	0 %	383484805
130	NC_017045	TTGTT	2	10	133723	133732	0 %	80 %	20 %	0 %	383484805
131	NC_017045	TTTGG	2	10	136924	136933	0 %	60 %	40 %	0 %	383484815
132	NC_017045	TAAAA	2	10	137867	137876	80 %	20 %	0 %	0 %	383484816
133	NC_017045	GTTTT	2	10	138520	138529	0 %	80 %	20 %	0 %	383484817
134	NC_017045	TTTAG	2	10	138642	138651	20 %	60 %	20 %	0 %	383484817
135	NC_017045	AGGTA	2	10	139984	139993	40 %	20 %	40 %	0 %	383484821
136	NC_017045	CTCTT	2	10	142102	142111	0 %	60 %	0 %	40 %	383484827
137	NC_017045	AGGGG	2	10	143395	143404	20 %	0 %	80 %	0 %	383484829
138	NC_017045	CAAAA	2	10	144611	144620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017045	TATTT	2	10	145477	145486	20 %	80 %	0 %	0 %	383484832
140	NC_017045	TTGGA	2	10	145900	145909	20 %	40 %	40 %	0 %	383484832
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