MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 3759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017045	AAC	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017045	CAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017045	GAC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017045	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017045	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017045	TAG	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017045	AAC	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017045	TTG	2	6	4142	4147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017045	TTG	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017045	AAC	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017045	CAA	2	6	6048	6053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017045	TAA	2	6	6138	6143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017045	CAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017045	TAA	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017045	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017045	TTC	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017045	CGT	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017045	ACA	2	6	8381	8386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017045	GTT	2	6	8670	8675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017045	ATT	3	9	8787	8795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017045	CCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017045	ATA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017045	GAA	2	6	8874	8879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017045	AGG	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017045	ATA	2	6	8951	8956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017045	ACA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017045	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017045	ACA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017045	AAG	2	6	9241	9246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017045	AAC	2	6	9388	9393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017045	AAT	2	6	10130	10135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017045	GAC	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017045	GTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017045	ATT	3	9	10877	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017045	CCT	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017045	ATA	2	6	10941	10946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017045	GAA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017045	ATA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017045	ACA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017045	ATT	2	6	11137	11142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017045	ACA	2	6	11246	11251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017045	TAA	2	6	11337	11342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017045	AGT	2	6	14184	14189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017045	ATA	2	6	14365	14370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017045	GAG	2	6	15162	15167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017045	CAG	2	6	16212	16217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017045	ACT	2	6	16343	16348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017045	ACA	2	6	16511	16516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017045	TTA	2	6	16781	16786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017045	TGT	2	6	16793	16798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017045	CTT	2	6	16828	16833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017045	CCA	2	6	16843	16848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017045	CTG	2	6	17021	17026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017045	CTT	2	6	17111	17116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017045	CTG	2	6	17129	17134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017045	TAA	2	6	18627	18632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017045	AAT	2	6	18663	18668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017045	AGA	2	6	18675	18680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017045	TAA	2	6	18911	18916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017045	ATC	2	6	19310	19315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017045	GTT	2	6	19329	19334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017045	CAT	2	6	19335	19340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017045	ATC	2	6	19348	19353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017045	AAT	2	6	19484	19489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017045	TTC	2	6	19632	19637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017045	TTA	2	6	19810	19815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017045	AAT	2	6	19974	19979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017045	GAC	2	6	20046	20051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017045	TAA	2	6	20464	20469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017045	TAA	2	6	21514	21519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017045	AAC	2	6	22197	22202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017045	CAA	2	6	22210	22215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017045	AAG	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017045	ATT	2	6	22514	22519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017045	AAT	2	6	22587	22592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017045	CGT	2	6	23071	23076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017045	TAA	2	6	23146	23151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017045	AGA	2	6	23891	23896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017045	TAC	2	6	24559	24564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017045	CAA	2	6	24568	24573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017045	TAA	2	6	24658	24663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017045	AAT	2	6	24758	24763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017045	GAC	2	6	24830	24835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017045	ACA	2	6	25742	25747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017045	ATT	2	6	25765	25770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017045	ACA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017045	AAG	2	6	25959	25964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017045	AAT	2	6	25999	26004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017045	ATT	2	6	26011	26016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017045	TTA	2	6	26032	26037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017045	ACA	2	6	26598	26603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017045	TGC	2	6	27541	27546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017045	AAG	2	6	27621	27626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017045	GAC	2	6	28380	28385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017045	CAA	2	6	28389	28394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017045	GAA	2	6	29212	29217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017045	AGC	2	6	29247	29252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017045	AAT	2	6	29281	29286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017045	CTG	2	6	29369	29374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017045	CAT	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017045	CAG	2	6	30023	30028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017045	GAA	2	6	30169	30174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017045	ATA	2	6	30203	30208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017045	AAT	2	6	30834	30839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017045	TTA	2	6	31006	31011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017045	ATA	2	6	31048	31053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017045	TTC	2	6	31103	31108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017045	TGG	2	6	33022	33027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017045	TAT	3	9	33239	33247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017045	GAG	2	6	33898	33903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017045	TTA	2	6	34772	34777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017045	TAA	2	6	34791	34796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017045	ATA	2	6	34947	34952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017045	TAA	2	6	35020	35025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017045	TAA	2	6	35095	35100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017045	ACA	2	6	35129	35134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017045	TAT	2	6	35195	35200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017045	AAT	2	6	35201	35206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017045	AGA	2	6	35230	35235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017045	TGC	2	6	35462	35467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017045	GCA	2	6	36267	36272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017045	AAG	2	6	36366	36371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017045	CGG	2	6	36438	36443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017045	CCG	2	6	36496	36501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017045	AAC	2	6	37693	37698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017045	AAT	2	6	40700	40705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017045	TAG	2	6	41180	41185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017045	TGC	2	6	41201	41206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017045	TAA	2	6	41244	41249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017045	GTT	2	6	41808	41813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017045	CTG	2	6	41882	41887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017045	TGA	2	6	41976	41981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017045	TCA	2	6	41983	41988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017045	GAA	2	6	42015	42020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017045	TAA	2	6	42162	42167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017045	ATG	2	6	42173	42178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017045	TAT	2	6	42186	42191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017045	GAA	3	9	42196	42204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017045	ATG	2	6	42236	42241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017045	GGA	2	6	42258	42263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017045	GGA	3	9	42271	42279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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