MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 24761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	GAC	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484661
2	NC_017045	TGA	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
3	NC_017045	TAT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
4	NC_017045	TAT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
5	NC_017045	GGT	2	6	424	429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484661
6	NC_017045	ATG	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
7	NC_017045	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
8	NC_017045	TGT	2	6	507	512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
9	NC_017045	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
10	NC_017045	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
11	NC_017045	ATG	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
12	NC_017045	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
13	NC_017045	ACA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
14	NC_017045	GAT	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
15	NC_017045	ATG	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
16	NC_017045	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
17	NC_017045	CAA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
18	NC_017045	ATG	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
19	NC_017045	ATT	2	6	1874	1879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
20	NC_017045	TTG	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
21	NC_017045	TGG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484662
22	NC_017045	GTT	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
23	NC_017045	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484663
24	NC_017045	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484663
25	NC_017045	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484663
26	NC_017045	TGA	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484663
27	NC_017045	ATT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484663
28	NC_017045	GAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
29	NC_017045	CAA	2	6	3269	3274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
30	NC_017045	ACA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
31	NC_017045	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484664
32	NC_017045	TTG	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484664
33	NC_017045	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484664
34	NC_017045	AAG	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
35	NC_017045	GAC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484664
36	NC_017045	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
37	NC_017045	CAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
38	NC_017045	AAG	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
39	NC_017045	ATA	2	6	4546	4551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484665
40	NC_017045	TGA	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484665
41	NC_017045	CAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
42	NC_017045	TGT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484665
43	NC_017045	AGA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484666
44	NC_017045	TGA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484666
45	NC_017045	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
46	NC_017045	CTT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484666
47	NC_017045	CAA	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
48	NC_017045	TAA	2	6	5682	5687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484666
49	NC_017045	TTG	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484667
50	NC_017045	AGT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484667
51	NC_017045	GAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484667
52	NC_017045	ATT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
53	NC_017045	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
54	NC_017045	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
55	NC_017045	TAC	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484668
56	NC_017045	AAG	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
57	NC_017045	AGA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
58	NC_017045	GAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
59	NC_017045	ATT	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484669
60	NC_017045	GAC	2	6	7085	7090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
61	NC_017045	TGG	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484669
62	NC_017045	GAC	2	6	7415	7420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
63	NC_017045	ATT	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
64	NC_017045	TTA	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
65	NC_017045	GAA	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
66	NC_017045	GTT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484670
67	NC_017045	GAA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
68	NC_017045	ATG	2	6	8274	8279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484670
69	NC_017045	ACA	2	6	9451	9456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
70	NC_017045	ACA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
71	NC_017045	TAC	2	6	9603	9608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484671
72	NC_017045	GAA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484671
73	NC_017045	CAA	2	6	9851	9856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
74	NC_017045	CAA	2	6	11575	11580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
75	NC_017045	AGA	2	6	11590	11595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
76	NC_017045	CAA	2	6	11651	11656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
77	NC_017045	AAT	2	6	11762	11767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484672
78	NC_017045	GAA	2	6	11799	11804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
79	NC_017045	AAG	2	6	11805	11810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
80	NC_017045	TAC	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484672
81	NC_017045	GCC	2	6	11874	11879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383484672
82	NC_017045	CCA	2	6	12099	12104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484672
83	NC_017045	CAA	2	6	12194	12199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
84	NC_017045	AAG	3	9	12317	12325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
85	NC_017045	TTA	2	6	12366	12371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484672
86	NC_017045	GAA	2	6	12393	12398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
87	NC_017045	ATT	2	6	12458	12463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484673
88	NC_017045	ATT	2	6	12527	12532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484673
89	NC_017045	AAG	2	6	12554	12559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
90	NC_017045	GAA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
91	NC_017045	CAA	3	9	12651	12659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484673
92	NC_017045	GAA	2	6	12721	12726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
93	NC_017045	ATA	2	6	12902	12907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484673
94	NC_017045	ATT	2	6	13001	13006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484673
95	NC_017045	AGA	2	6	13143	13148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
96	NC_017045	AAG	2	6	13214	13219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
97	NC_017045	TGA	2	6	13263	13268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484674
98	NC_017045	TCT	2	6	13281	13286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484674
99	NC_017045	CCT	2	6	13351	13356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383484674
100	NC_017045	CCA	3	9	13615	13623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484674
101	NC_017045	ATT	2	6	13697	13702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484674
102	NC_017045	AAG	3	9	13949	13957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484674
103	NC_017045	ACG	2	6	14045	14050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484674
104	NC_017045	ATT	2	6	14064	14069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484674
105	NC_017045	GAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484674
106	NC_017045	TGG	2	6	14721	14726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484675
107	NC_017045	GAA	2	6	14827	14832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484675
108	NC_017045	AAT	2	6	15122	15127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484675
109	NC_017045	GAA	2	6	15503	15508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484676
110	NC_017045	TGG	2	6	15583	15588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484676
111	NC_017045	AGA	2	6	15595	15600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484676
112	NC_017045	GAA	2	6	15690	15695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484676
113	NC_017045	GTT	2	6	15746	15751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484676
114	NC_017045	GGT	2	6	15752	15757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484676
115	NC_017045	AAC	2	6	15820	15825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484676
116	NC_017045	TGG	2	6	15935	15940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484676
117	NC_017045	AAT	2	6	15941	15946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484676
118	NC_017045	ATT	2	6	15948	15953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484676
119	NC_017045	AGA	2	6	16030	16035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484676
120	NC_017045	ATT	2	6	16166	16171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484676
121	NC_017045	GAA	2	6	16945	16950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484677
122	NC_017045	ATG	3	9	17164	17172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484678
123	NC_017045	GAT	2	6	17248	17253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484678
124	NC_017045	TGT	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484678
125	NC_017045	GAA	2	6	17384	17389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484678
126	NC_017045	CAA	2	6	17515	17520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484678
127	NC_017045	GAT	2	6	17521	17526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484678
128	NC_017045	AAT	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484679
129	NC_017045	TAA	3	9	18023	18031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484679
130	NC_017045	ATG	2	6	18065	18070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484679
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