MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TGATA	2	10	557	566	40 %	40 %	20 %	0 %	383483342
2	NC_017044	CTACT	2	10	1006	1015	20 %	40 %	0 %	40 %	383483343
3	NC_017044	ATAGA	2	10	1610	1619	60 %	20 %	20 %	0 %	383483343
4	NC_017044	TTCTT	2	10	1687	1696	0 %	80 %	0 %	20 %	383483343
5	NC_017044	CTTTC	2	10	1785	1794	0 %	60 %	0 %	40 %	383483344
6	NC_017044	CACTC	2	10	1889	1898	20 %	20 %	0 %	60 %	383483344
7	NC_017044	TATTT	2	10	2205	2214	20 %	80 %	0 %	0 %	383483344
8	NC_017044	TTGCT	2	10	2558	2567	0 %	60 %	20 %	20 %	383483344
9	NC_017044	TTTTA	2	10	5598	5607	20 %	80 %	0 %	0 %	383483348
10	NC_017044	ATTTA	2	10	5951	5960	40 %	60 %	0 %	0 %	383483348
11	NC_017044	GGTCA	2	10	7198	7207	20 %	20 %	40 %	20 %	383483349
12	NC_017044	TAAAT	2	10	7907	7916	60 %	40 %	0 %	0 %	383483349
13	NC_017044	TCAAT	2	10	8177	8186	40 %	40 %	0 %	20 %	383483349
14	NC_017044	GTAGT	2	10	8233	8242	20 %	40 %	40 %	0 %	383483349
15	NC_017044	ACTTT	2	10	9890	9899	20 %	60 %	0 %	20 %	383483352
16	NC_017044	AATAC	2	10	10431	10440	60 %	20 %	0 %	20 %	383483352
17	NC_017044	ATCCA	2	10	10928	10937	40 %	20 %	0 %	40 %	383483353
18	NC_017044	TAACT	2	10	15185	15194	40 %	40 %	0 %	20 %	383483356
19	NC_017044	ATTTA	2	10	16842	16851	40 %	60 %	0 %	0 %	383483358
20	NC_017044	TTTTA	2	10	17610	17619	20 %	80 %	0 %	0 %	383483358
21	NC_017044	TCAAG	2	10	21409	21418	40 %	20 %	20 %	20 %	383483363
22	NC_017044	ATAAA	2	10	21463	21472	80 %	20 %	0 %	0 %	383483363
23	NC_017044	AGAAA	2	10	21725	21734	80 %	0 %	20 %	0 %	383483363
24	NC_017044	AAAGC	2	10	21957	21966	60 %	0 %	20 %	20 %	383483363
25	NC_017044	TAATA	2	10	22877	22886	60 %	40 %	0 %	0 %	383483363
26	NC_017044	CAAAG	2	10	22969	22978	60 %	0 %	20 %	20 %	383483363
27	NC_017044	AGCAG	2	10	23295	23304	40 %	0 %	40 %	20 %	383483363
28	NC_017044	TACCT	2	10	24845	24854	20 %	40 %	0 %	40 %	383483363
29	NC_017044	ATATT	2	10	27911	27920	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
30	NC_017044	ATATT	2	10	27949	27958	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
31	NC_017044	TTTGT	2	10	30053	30062	0 %	80 %	20 %	0 %	383483369
32	NC_017044	TCATT	2	10	31830	31839	20 %	60 %	0 %	20 %	383483374
33	NC_017044	TTAAT	2	10	37004	37013	40 %	60 %	0 %	0 %	383483380
34	NC_017044	GAGAG	2	10	46053	46062	40 %	0 %	60 %	0 %	383483395
35	NC_017044	CAAAC	2	10	46105	46114	60 %	0 %	0 %	40 %	383483395
36	NC_017044	ACGTA	2	10	46269	46278	40 %	20 %	20 %	20 %	383483395
37	NC_017044	TAACT	2	10	46540	46549	40 %	40 %	0 %	20 %	383483396
38	NC_017044	AGAAA	2	10	47152	47161	80 %	0 %	20 %	0 %	383483397
39	NC_017044	GTTTC	2	10	47592	47601	0 %	60 %	20 %	20 %	383483397
40	NC_017044	ATTTT	2	10	48141	48150	20 %	80 %	0 %	0 %	383483397
41	NC_017044	TTTCT	2	10	51349	51358	0 %	80 %	0 %	20 %	383483402
42	NC_017044	TTGAT	2	10	54322	54331	20 %	60 %	20 %	0 %	383483404
43	NC_017044	TAAAG	2	10	55349	55358	60 %	20 %	20 %	0 %	383483404
44	NC_017044	ATTAT	2	10	55422	55431	40 %	60 %	0 %	0 %	383483404
45	NC_017044	TCGGT	2	10	60827	60836	0 %	40 %	40 %	20 %	383483411
46	NC_017044	GCTTT	2	10	62209	62218	0 %	60 %	20 %	20 %	383483412
47	NC_017044	TAAAA	2	10	66435	66444	80 %	20 %	0 %	0 %	383483416
48	NC_017044	ACTTT	2	10	69489	69498	20 %	60 %	0 %	20 %	383483420
49	NC_017044	GCTTA	2	10	69678	69687	20 %	40 %	20 %	20 %	383483420
50	NC_017044	CATTT	2	10	70381	70390	20 %	60 %	0 %	20 %	383483420
51	NC_017044	TTAAA	2	10	70406	70415	60 %	40 %	0 %	0 %	383483420
52	NC_017044	GATTA	2	10	74830	74839	40 %	40 %	20 %	0 %	383483425
53	NC_017044	TTTCT	2	10	76539	76548	0 %	80 %	0 %	20 %	383483428
54	NC_017044	ATTTA	2	10	76953	76962	40 %	60 %	0 %	0 %	383483429
55	NC_017044	AAAAG	2	10	77729	77738	80 %	0 %	20 %	0 %	383483429
56	NC_017044	GGGTT	2	10	77939	77948	0 %	40 %	60 %	0 %	383483429
57	NC_017044	TTTAT	2	10	78315	78324	20 %	80 %	0 %	0 %	383483429
58	NC_017044	GCTTA	2	10	79597	79606	20 %	40 %	20 %	20 %	383483430
59	NC_017044	ACAAT	2	10	79961	79970	60 %	20 %	0 %	20 %	383483431
60	NC_017044	GTTAT	2	10	80586	80595	20 %	60 %	20 %	0 %	383483432
61	NC_017044	GTAGA	2	10	80892	80901	40 %	20 %	40 %	0 %	383483432
62	NC_017044	CAATG	2	10	83244	83253	40 %	20 %	20 %	20 %	383483434
63	NC_017044	ATAAA	2	10	83707	83716	80 %	20 %	0 %	0 %	383483435
64	NC_017044	ATTAT	2	10	84142	84151	40 %	60 %	0 %	0 %	383483435
65	NC_017044	ATTAA	2	10	84413	84422	60 %	40 %	0 %	0 %	383483435
66	NC_017044	GAAAA	2	10	84966	84975	80 %	0 %	20 %	0 %	383483436
67	NC_017044	TAAAT	2	10	88104	88113	60 %	40 %	0 %	0 %	383483439
68	NC_017044	CGCAT	2	10	92356	92365	20 %	20 %	20 %	40 %	383483443
69	NC_017044	TGAAA	2	10	95586	95595	60 %	20 %	20 %	0 %	383483445
70	NC_017044	TTGAT	2	10	97264	97273	20 %	60 %	20 %	0 %	383483447
71	NC_017044	ATTTA	2	10	98977	98986	40 %	60 %	0 %	0 %	383483449
72	NC_017044	TCAAA	2	10	100634	100643	60 %	20 %	0 %	20 %	383483451
73	NC_017044	TTAAT	2	10	101340	101349	40 %	60 %	0 %	0 %	383483452
74	NC_017044	AAACT	2	10	103916	103925	60 %	20 %	0 %	20 %	383483454
75	NC_017044	TTAGT	2	10	104267	104276	20 %	60 %	20 %	0 %	383483455
76	NC_017044	CCAAA	2	10	106705	106714	60 %	0 %	0 %	40 %	383483457
77	NC_017044	ATTTT	2	10	108257	108266	20 %	80 %	0 %	0 %	383483459
78	NC_017044	TTGAT	2	10	108707	108716	20 %	60 %	20 %	0 %	383483460
79	NC_017044	ATTAT	2	10	108888	108897	40 %	60 %	0 %	0 %	383483460
80	NC_017044	TCTAG	2	10	110103	110112	20 %	40 %	20 %	20 %	383483460
81	NC_017044	ATTTA	2	10	110702	110711	40 %	60 %	0 %	0 %	383483460
82	NC_017044	TTTGA	2	10	112684	112693	20 %	60 %	20 %	0 %	383483460
83	NC_017044	GCAAA	2	10	114655	114664	60 %	0 %	20 %	20 %	383483461
84	NC_017044	TTAGT	2	10	119222	119231	20 %	60 %	20 %	0 %	383483464
85	NC_017044	ATAAA	2	10	120439	120448	80 %	20 %	0 %	0 %	383483464
86	NC_017044	AAGTA	2	10	121045	121054	60 %	20 %	20 %	0 %	383483465
87	NC_017044	TAAAA	2	10	123143	123152	80 %	20 %	0 %	0 %	383483467
88	NC_017044	AAAAC	2	10	123842	123851	80 %	0 %	0 %	20 %	383483467
89	NC_017044	TTTAA	2	10	123918	123927	40 %	60 %	0 %	0 %	383483467
90	NC_017044	GTTAC	2	10	125007	125016	20 %	40 %	20 %	20 %	383483469
91	NC_017044	TGAAA	2	10	125368	125377	60 %	20 %	20 %	0 %	383483469
92	NC_017044	GCAAG	2	10	126022	126031	40 %	0 %	40 %	20 %	383483470
93	NC_017044	CTTGT	2	10	128448	128457	0 %	60 %	20 %	20 %	383483473
94	NC_017044	ATGAT	2	10	129512	129521	40 %	40 %	20 %	0 %	383483474
95	NC_017044	CTTGT	2	10	129850	129859	0 %	60 %	20 %	20 %	383483475
96	NC_017044	AACCT	2	10	132449	132458	40 %	20 %	0 %	40 %	383483478
97	NC_017044	AAATC	2	10	133587	133596	60 %	20 %	0 %	20 %	383483480
98	NC_017044	TTAAC	2	10	134724	134733	40 %	40 %	0 %	20 %	383483481
99	NC_017044	TATAA	2	10	134816	134825	60 %	40 %	0 %	0 %	383483481
100	NC_017044	TTATA	2	10	135190	135199	40 %	60 %	0 %	0 %	383483482
101	NC_017044	TTTTA	2	10	136717	136726	20 %	80 %	0 %	0 %	383483483
102	NC_017044	GCTTT	2	10	138293	138302	0 %	60 %	20 %	20 %	383483484
103	NC_017044	TATGT	2	10	138943	138952	20 %	60 %	20 %	0 %	383483484
104	NC_017044	GTTTT	2	10	141109	141118	0 %	80 %	20 %	0 %	383483485
105	NC_017044	ACAAG	2	10	145640	145649	60 %	0 %	20 %	20 %	383483486
106	NC_017044	AGTTT	2	10	145978	145987	20 %	60 %	20 %	0 %	383483487
107	NC_017044	TTAGT	2	10	146501	146510	20 %	60 %	20 %	0 %	383483487
108	NC_017044	ATATA	2	10	147407	147416	60 %	40 %	0 %	0 %	383483487
109	NC_017044	TGCAG	2	10	147495	147504	20 %	20 %	40 %	20 %	383483487
110	NC_017044	ATGGT	2	10	149075	149084	20 %	40 %	40 %	0 %	383483488
111	NC_017044	AGGAG	2	10	149330	149339	40 %	0 %	60 %	0 %	383483488
112	NC_017044	TATTT	2	10	150006	150015	20 %	80 %	0 %	0 %	383483488
113	NC_017044	AATTT	2	10	157353	157362	40 %	60 %	0 %	0 %	383483495
114	NC_017044	AGGTG	2	10	157459	157468	20 %	20 %	60 %	0 %	383483495
115	NC_017044	AAATT	2	10	164670	164679	60 %	40 %	0 %	0 %	383483503
116	NC_017044	TATCA	2	10	165047	165056	40 %	40 %	0 %	20 %	383483503
117	NC_017044	GGATA	2	10	165103	165112	40 %	20 %	40 %	0 %	383483503
118	NC_017044	TAGCT	2	10	165134	165143	20 %	40 %	20 %	20 %	383483503
119	NC_017044	TATAT	2	10	165361	165370	40 %	60 %	0 %	0 %	383483504
120	NC_017044	TTATT	2	10	165996	166005	20 %	80 %	0 %	0 %	383483504
121	NC_017044	AATTT	2	10	166417	166426	40 %	60 %	0 %	0 %	383483505
122	NC_017044	ATTTT	2	10	166804	166813	20 %	80 %	0 %	0 %	383483505
123	NC_017044	AGCCG	2	10	167009	167018	20 %	0 %	40 %	40 %	383483505
124	NC_017044	TGGTG	2	10	171101	171110	0 %	40 %	60 %	0 %	383483509
125	NC_017044	TTAAT	2	10	171987	171996	40 %	60 %	0 %	0 %	383483512
126	NC_017044	AAGAA	2	10	173599	173608	80 %	0 %	20 %	0 %	383483512
127	NC_017044	CAGGG	2	10	174254	174263	20 %	0 %	60 %	20 %	383483513
128	NC_017044	ATATC	2	10	175029	175038	40 %	40 %	0 %	20 %	383483514
129	NC_017044	TGGAT	2	10	175806	175815	20 %	40 %	40 %	0 %	383483516
130	NC_017044	GTGCC	2	10	177276	177285	0 %	20 %	40 %	40 %	383483516
131	NC_017044	ACATA	2	10	178340	178349	60 %	20 %	0 %	20 %	383483517
132	NC_017044	CTTTT	2	10	179445	179454	0 %	80 %	0 %	20 %	383483519
133	NC_017044	TATAC	2	10	189971	189980	40 %	40 %	0 %	20 %	383483524
134	NC_017044	GTAGA	2	10	190380	190389	40 %	20 %	40 %	0 %	383483524
135	NC_017044	ACTTC	2	10	191781	191790	20 %	40 %	0 %	40 %	383483525
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