MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 2884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	AAAT	2	8	458	465	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
2	NC_017044	TAAA	2	8	582	589	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
3	NC_017044	ATAG	2	8	641	648	50 %	25 %	25 %	0 %	383483342
4	NC_017044	TAAT	2	8	1183	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
5	NC_017044	ATTA	2	8	1592	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
6	NC_017044	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	383483344
7	NC_017044	TTAT	2	8	5759	5766	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
8	NC_017044	TTAT	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
9	NC_017044	AACT	2	8	6364	6371	50 %	25 %	0 %	25 %	383483349
10	NC_017044	CAAA	2	8	6410	6417	75 %	0 %	0 %	25 %	383483349
11	NC_017044	TATT	2	8	6677	6684	25 %	75 %	0 %	0 %	383483349
12	NC_017044	TCGC	2	8	6807	6814	0 %	25 %	25 %	50 %	383483349
13	NC_017044	AATA	2	8	8378	8385	75 %	25 %	0 %	0 %	383483349
14	NC_017044	ATTC	2	8	8415	8422	25 %	50 %	0 %	25 %	383483349
15	NC_017044	TTAA	2	8	8547	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	383483349
16	NC_017044	ATTT	2	8	9619	9626	25 %	75 %	0 %	0 %	383483351
17	NC_017044	ATAA	2	8	10171	10178	75 %	25 %	0 %	0 %	383483352
18	NC_017044	ACTT	2	8	10554	10561	25 %	50 %	0 %	25 %	383483353
19	NC_017044	ATTT	2	8	10961	10968	25 %	75 %	0 %	0 %	383483353
20	NC_017044	GCAA	2	8	15039	15046	50 %	0 %	25 %	25 %	383483355
21	NC_017044	TCTT	2	8	15116	15123	0 %	75 %	0 %	25 %	383483355
22	NC_017044	AAAT	2	8	15144	15151	75 %	25 %	0 %	0 %	383483355
23	NC_017044	AGTA	2	8	15368	15375	50 %	25 %	25 %	0 %	383483356
24	NC_017044	GCTT	2	8	15897	15904	0 %	50 %	25 %	25 %	383483357
25	NC_017044	AATT	2	8	16246	16253	50 %	50 %	0 %	0 %	383483357
26	NC_017044	AATA	2	8	16870	16877	75 %	25 %	0 %	0 %	383483358
27	NC_017044	TCTA	2	8	17337	17344	25 %	50 %	0 %	25 %	383483358
28	NC_017044	ACGT	2	8	17760	17767	25 %	25 %	25 %	25 %	383483358
29	NC_017044	CTTG	2	8	17875	17882	0 %	50 %	25 %	25 %	383483358
30	NC_017044	GTAT	2	8	18546	18553	25 %	50 %	25 %	0 %	383483359
31	NC_017044	AGTA	2	8	18942	18949	50 %	25 %	25 %	0 %	383483360
32	NC_017044	ATTA	2	8	18967	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	383483360
33	NC_017044	AATA	2	8	19011	19018	75 %	25 %	0 %	0 %	383483360
34	NC_017044	CTTT	2	8	19056	19063	0 %	75 %	0 %	25 %	383483360
35	NC_017044	TGAA	2	8	19204	19211	50 %	25 %	25 %	0 %	383483360
36	NC_017044	TAAA	2	8	19247	19254	75 %	25 %	0 %	0 %	383483360
37	NC_017044	TAAA	2	8	19602	19609	75 %	25 %	0 %	0 %	383483361
38	NC_017044	GATA	2	8	19683	19690	50 %	25 %	25 %	0 %	383483361
39	NC_017044	AGCA	2	8	19751	19758	50 %	0 %	25 %	25 %	383483361
40	NC_017044	GTAA	2	8	21258	21265	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
41	NC_017044	AGAT	2	8	21512	21519	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
42	NC_017044	AGCA	2	8	21631	21638	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
43	NC_017044	AAAT	2	8	21674	21681	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
44	NC_017044	ATTA	2	8	22134	22141	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
45	NC_017044	ATAG	2	8	22182	22189	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
46	NC_017044	ATAG	2	8	22194	22201	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
47	NC_017044	CGTT	2	8	22603	22610	0 %	50 %	25 %	25 %	383483363
48	NC_017044	CAAA	2	8	22920	22927	75 %	0 %	0 %	25 %	383483363
49	NC_017044	TAGT	2	8	23050	23057	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
50	NC_017044	AGTT	2	8	23150	23157	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
51	NC_017044	GTTA	2	8	23595	23602	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
52	NC_017044	AAGC	2	8	23790	23797	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
53	NC_017044	AAGC	2	8	23994	24001	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
54	NC_017044	TAAA	2	8	24355	24362	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
55	NC_017044	AAGT	2	8	24883	24890	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
56	NC_017044	TTCA	2	8	25441	25448	25 %	50 %	0 %	25 %	383483363
57	NC_017044	AATA	2	8	25934	25941	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
58	NC_017044	TAAA	2	8	26080	26087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
59	NC_017044	TAAT	2	8	27836	27843	50 %	50 %	0 %	0 %	383483366
60	NC_017044	AAGA	2	8	27988	27995	75 %	0 %	25 %	0 %	383483366
61	NC_017044	AAAT	2	8	28080	28087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483366
62	NC_017044	TCTA	2	8	30037	30044	25 %	50 %	0 %	25 %	383483369
63	NC_017044	ATTT	2	8	30081	30088	25 %	75 %	0 %	0 %	383483369
64	NC_017044	TGTC	2	8	30145	30152	0 %	50 %	25 %	25 %	383483369
65	NC_017044	ATAA	2	8	31166	31173	75 %	25 %	0 %	0 %	383483372
66	NC_017044	CACT	2	8	31260	31267	25 %	25 %	0 %	50 %	383483372
67	NC_017044	TATT	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	383483374
68	NC_017044	AATT	2	8	33718	33725	50 %	50 %	0 %	0 %	383483377
69	NC_017044	TACC	2	8	33808	33815	25 %	25 %	0 %	50 %	383483377
70	NC_017044	GTTA	2	8	34190	34197	25 %	50 %	25 %	0 %	383483377
71	NC_017044	AAAC	2	8	35610	35617	75 %	0 %	0 %	25 %	383483379
72	NC_017044	TTAG	2	8	35786	35793	25 %	50 %	25 %	0 %	383483379
73	NC_017044	TTGC	2	8	36081	36088	0 %	50 %	25 %	25 %	383483379
74	NC_017044	ACTA	2	8	36235	36242	50 %	25 %	0 %	25 %	383483379
75	NC_017044	TTCC	2	8	36321	36328	0 %	50 %	0 %	50 %	383483379
76	NC_017044	TGTT	2	8	36789	36796	0 %	75 %	25 %	0 %	383483380
77	NC_017044	TTGT	2	8	37400	37407	0 %	75 %	25 %	0 %	383483381
78	NC_017044	TATT	2	8	37479	37486	25 %	75 %	0 %	0 %	383483381
79	NC_017044	GTAA	2	8	37490	37497	50 %	25 %	25 %	0 %	383483381
80	NC_017044	AATG	2	8	38264	38271	50 %	25 %	25 %	0 %	383483383
81	NC_017044	GTTT	2	8	38803	38810	0 %	75 %	25 %	0 %	383483384
82	NC_017044	GCTT	2	8	39050	39057	0 %	50 %	25 %	25 %	383483385
83	NC_017044	ATTT	2	8	41775	41782	25 %	75 %	0 %	0 %	383483389
84	NC_017044	TAAT	2	8	42949	42956	50 %	50 %	0 %	0 %	383483391
85	NC_017044	GAAA	2	8	43334	43341	75 %	0 %	25 %	0 %	383483392
86	NC_017044	ATTT	2	8	43378	43385	25 %	75 %	0 %	0 %	383483392
87	NC_017044	ACAA	2	8	43645	43652	75 %	0 %	0 %	25 %	383483392
88	NC_017044	AAAT	2	8	43849	43856	75 %	25 %	0 %	0 %	383483393
89	NC_017044	TAAC	2	8	45737	45744	50 %	25 %	0 %	25 %	383483395
90	NC_017044	ATAC	2	8	45964	45971	50 %	25 %	0 %	25 %	383483395
91	NC_017044	ATTC	2	8	46168	46175	25 %	50 %	0 %	25 %	383483395
92	NC_017044	ATGT	2	8	46517	46524	25 %	50 %	25 %	0 %	383483396
93	NC_017044	ATTT	2	8	46675	46682	25 %	75 %	0 %	0 %	383483396
94	NC_017044	TTAC	2	8	46754	46761	25 %	50 %	0 %	25 %	383483396
95	NC_017044	ATCA	2	8	47431	47438	50 %	25 %	0 %	25 %	383483397
96	NC_017044	TGCC	2	8	47741	47748	0 %	25 %	25 %	50 %	383483397
97	NC_017044	TATC	2	8	48300	48307	25 %	50 %	0 %	25 %	383483397
98	NC_017044	TTAA	2	8	48323	48330	50 %	50 %	0 %	0 %	383483397
99	NC_017044	AGTA	2	8	49445	49452	50 %	25 %	25 %	0 %	383483399
100	NC_017044	TTGC	2	8	49808	49815	0 %	50 %	25 %	25 %	383483400
101	NC_017044	CTTG	2	8	50696	50703	0 %	50 %	25 %	25 %	383483401
102	NC_017044	ATCT	2	8	51273	51280	25 %	50 %	0 %	25 %	383483402
103	NC_017044	TGCT	2	8	51439	51446	0 %	50 %	25 %	25 %	383483403
104	NC_017044	TAAA	2	8	53350	53357	75 %	25 %	0 %	0 %	383483404
105	NC_017044	GAGG	2	8	53376	53383	25 %	0 %	75 %	0 %	383483404
106	NC_017044	ATTG	2	8	53759	53766	25 %	50 %	25 %	0 %	383483404
107	NC_017044	TTAT	2	8	53973	53980	25 %	75 %	0 %	0 %	383483404
108	NC_017044	TGCT	2	8	54055	54062	0 %	50 %	25 %	25 %	383483404
109	NC_017044	GTGA	2	8	54162	54169	25 %	25 %	50 %	0 %	383483404
110	NC_017044	CCGC	2	8	54929	54936	0 %	0 %	25 %	75 %	383483404
111	NC_017044	GTTC	2	8	54940	54947	0 %	50 %	25 %	25 %	383483404
112	NC_017044	GACC	2	8	54958	54965	25 %	0 %	25 %	50 %	383483404
113	NC_017044	AAAT	2	8	55678	55685	75 %	25 %	0 %	0 %	383483404
114	NC_017044	TAAG	2	8	56031	56038	50 %	25 %	25 %	0 %	383483405
115	NC_017044	ATAA	2	8	56658	56665	75 %	25 %	0 %	0 %	383483406
116	NC_017044	CTTT	2	8	57358	57365	0 %	75 %	0 %	25 %	383483406
117	NC_017044	TTGC	2	8	58313	58320	0 %	50 %	25 %	25 %	383483407
118	NC_017044	ATAA	2	8	58345	58352	75 %	25 %	0 %	0 %	383483407
119	NC_017044	ATAA	2	8	58399	58406	75 %	25 %	0 %	0 %	383483407
120	NC_017044	CATC	2	8	58536	58543	25 %	25 %	0 %	50 %	383483407
121	NC_017044	ATTT	3	12	58712	58723	25 %	75 %	0 %	0 %	383483407
122	NC_017044	AGAA	2	8	60094	60101	75 %	0 %	25 %	0 %	383483409
123	NC_017044	AAAG	2	8	60474	60481	75 %	0 %	25 %	0 %	383483410
124	NC_017044	TAAA	2	8	60541	60548	75 %	25 %	0 %	0 %	383483410
125	NC_017044	AAGA	2	8	61618	61625	75 %	0 %	25 %	0 %	383483412
126	NC_017044	TAAT	2	8	62269	62276	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
127	NC_017044	ATTA	2	8	62345	62352	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
128	NC_017044	GAAT	2	8	63167	63174	50 %	25 %	25 %	0 %	383483413
129	NC_017044	CAAG	2	8	63398	63405	50 %	0 %	25 %	25 %	383483413
130	NC_017044	ATGG	2	8	63721	63728	25 %	25 %	50 %	0 %	383483413
131	NC_017044	AAGA	2	8	64006	64013	75 %	0 %	25 %	0 %	383483413
132	NC_017044	GAAA	2	8	64092	64099	75 %	0 %	25 %	0 %	383483413
133	NC_017044	TTAA	2	8	65875	65882	50 %	50 %	0 %	0 %	383483416
134	NC_017044	GGAA	2	8	65931	65938	50 %	0 %	50 %	0 %	383483416
135	NC_017044	GCAT	2	8	65983	65990	25 %	25 %	25 %	25 %	383483416
136	NC_017044	TGCT	2	8	66210	66217	0 %	50 %	25 %	25 %	383483416
137	NC_017044	AATT	2	8	67055	67062	50 %	50 %	0 %	0 %	383483418
138	NC_017044	TGTT	2	8	67315	67322	0 %	75 %	25 %	0 %	383483418
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