MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 20274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017044	ATA	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483342
3	NC_017044	CAA	2	6	257	262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
4	NC_017044	CAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483342
5	NC_017044	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483342
6	NC_017044	TTA	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
7	NC_017044	TTA	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
8	NC_017044	TAA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
9	NC_017044	CTA	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483343
10	NC_017044	TAT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
11	NC_017044	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
12	NC_017044	GAT	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
13	NC_017044	GTA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483343
14	NC_017044	AAT	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
15	NC_017044	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
16	NC_017044	CTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
17	NC_017044	TCT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483343
18	NC_017044	CTC	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483343
19	NC_017044	AGA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483343
20	NC_017044	ACC	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483343
21	NC_017044	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483343
22	NC_017044	ATA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483343
23	NC_017044	GAA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483344
24	NC_017044	TAA	2	6	1826	1831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
25	NC_017044	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
26	NC_017044	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
27	NC_017044	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
28	NC_017044	CTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
29	NC_017044	GAT	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483344
30	NC_017044	TAA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
31	NC_017044	TAA	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483344
32	NC_017044	TTC	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
33	NC_017044	TCA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
34	NC_017044	ATT	2	6	2350	2355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
35	NC_017044	TCT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483344
36	NC_017044	CAT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483344
37	NC_017044	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483344
38	NC_017044	TAT	3	9	2669	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483344
39	NC_017044	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017044	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017044	TGT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017044	CAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017044	ATT	3	9	2849	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017044	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017044	ATA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017044	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017044	ATT	2	6	3116	3121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
48	NC_017044	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
49	NC_017044	ATT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
50	NC_017044	ATG	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
51	NC_017044	ATA	2	6	3536	3541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
52	NC_017044	GTA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483345
53	NC_017044	TTA	2	6	3690	3695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483345
54	NC_017044	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483345
55	NC_017044	TAA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
56	NC_017044	ATA	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483345
57	NC_017044	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017044	TGT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017044	TTG	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017044	ATA	2	6	4257	4262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
61	NC_017044	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
62	NC_017044	GTA	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483346
63	NC_017044	CAA	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483346
64	NC_017044	TAA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483346
65	NC_017044	TCT	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483347
66	NC_017044	ATA	3	9	4829	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
67	NC_017044	GTA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
68	NC_017044	TGA	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483347
69	NC_017044	GAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
70	NC_017044	AAT	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483347
71	NC_017044	AAG	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483347
72	NC_017044	TTA	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483347
73	NC_017044	CAA	3	9	5200	5208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483347
74	NC_017044	CGG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483348
75	NC_017044	AGC	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483348
76	NC_017044	ATA	2	6	5497	5502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
77	NC_017044	ATA	2	6	5635	5640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
78	NC_017044	TAA	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483348
79	NC_017044	ATG	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483348
80	NC_017044	TAT	2	6	5916	5921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483348
81	NC_017044	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483348
82	NC_017044	CTC	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483349
83	NC_017044	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
84	NC_017044	ATT	2	6	6151	6156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
85	NC_017044	ATT	2	6	6264	6269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
86	NC_017044	AGA	2	6	6437	6442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
87	NC_017044	AGA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
88	NC_017044	AGC	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483349
89	NC_017044	TGC	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483349
90	NC_017044	ATT	2	6	6670	6675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
91	NC_017044	GAG	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483349
92	NC_017044	TAT	2	6	6908	6913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
93	NC_017044	GCA	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483349
94	NC_017044	AGA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
95	NC_017044	CTA	2	6	7129	7134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483349
96	NC_017044	TAT	2	6	7185	7190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
97	NC_017044	TTA	2	6	7191	7196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
98	NC_017044	TGT	2	6	7211	7216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483349
99	NC_017044	ATA	2	6	7405	7410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
100	NC_017044	GGC	2	6	7656	7661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483349
101	NC_017044	GCA	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483349
102	NC_017044	GGA	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483349
103	NC_017044	GAA	2	6	7779	7784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
104	NC_017044	AAG	2	6	7810	7815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
105	NC_017044	AAT	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
106	NC_017044	GAA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
107	NC_017044	TAA	2	6	7847	7852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
108	NC_017044	GAG	2	6	7920	7925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483349
109	NC_017044	AAG	2	6	8263	8268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
110	NC_017044	ACG	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483349
111	NC_017044	ATA	2	6	8299	8304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
112	NC_017044	ATT	2	6	8350	8355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
113	NC_017044	TAA	2	6	8372	8377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
114	NC_017044	GAT	2	6	8391	8396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483349
115	NC_017044	TGC	2	6	8429	8434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483349
116	NC_017044	ATT	2	6	8473	8478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
117	NC_017044	TGC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483349
118	NC_017044	CTA	2	6	8581	8586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483349
119	NC_017044	AGT	2	6	8618	8623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483349
120	NC_017044	CGC	2	6	8644	8649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483349
121	NC_017044	TTG	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483349
122	NC_017044	TTA	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483349
123	NC_017044	ATA	2	6	8731	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
124	NC_017044	TAA	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
125	NC_017044	ATA	2	6	8823	8828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
126	NC_017044	GAA	2	6	8829	8834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483349
127	NC_017044	ATA	2	6	8877	8882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483349
128	NC_017044	ATG	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483349
129	NC_017044	GTT	2	6	9122	9127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017044	CTT	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483350
131	NC_017044	TCA	2	6	9182	9187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483350
132	NC_017044	ATA	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483350
133	NC_017044	TAA	2	6	9235	9240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483350
134	NC_017044	GAT	2	6	9300	9305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483350
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