MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 4653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017044	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017044	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017044	TGT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017044	CAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017044	ATT	3	9	2849	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017044	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017044	ATA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017044	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017044	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017044	TGT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017044	TTG	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017044	GTT	2	6	9122	9127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017044	TCC	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017044	TCT	2	6	10974	10979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017044	AAT	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017044	GCT	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017044	GAC	2	6	11111	11116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017044	CAA	3	9	11130	11138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017044	TAT	2	6	12248	12253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017044	CAA	2	6	12255	12260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017044	ATG	2	6	12299	12304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017044	AGC	2	6	12316	12321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017044	ATA	2	6	12348	12353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017044	TTC	2	6	12392	12397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017044	CAA	2	6	12423	12428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017044	AAG	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017044	GTA	2	6	12576	12581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017044	TTA	2	6	12607	12612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017044	GTG	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017044	TCG	2	6	12814	12819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017044	TTA	2	6	12926	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017044	TTC	2	6	13083	13088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017044	AGA	2	6	13135	13140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017044	TGA	2	6	13247	13252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017044	CAA	2	6	13255	13260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017044	GCT	2	6	13308	13313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017044	AGT	2	6	13375	13380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017044	AGC	2	6	13416	13421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017044	GAT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017044	GAT	2	6	13555	13560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017044	AAG	2	6	13692	13697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017044	TAT	2	6	13723	13728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017044	GAA	2	6	13796	13801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017044	GAA	2	6	13809	13814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017044	ATT	2	6	13879	13884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017044	TAG	2	6	13934	13939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017044	CAG	2	6	13954	13959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017044	ATT	2	6	14083	14088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017044	AAT	2	6	14204	14209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017044	TAG	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017044	TCT	2	6	14311	14316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017044	CAA	2	6	14387	14392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017044	CTT	2	6	14457	14462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017044	GAA	2	6	14474	14479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017044	CTT	2	6	14613	14618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017044	GAT	2	6	14628	14633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017044	GAT	2	6	14876	14881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017044	TTA	2	6	14922	14927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017044	TAA	2	6	14952	14957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017044	GTT	2	6	14973	14978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017044	TTG	2	6	18070	18075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017044	ATT	2	6	18163	18168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017044	TTA	2	6	18338	18343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017044	TTA	2	6	18348	18353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017044	TTA	2	6	18422	18427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017044	TAT	2	6	18461	18466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017044	TAA	2	6	19394	19399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017044	GTA	2	6	19407	19412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017044	ATC	2	6	19422	19427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017044	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017044	TAA	2	6	19863	19868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017044	TTG	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017044	AAT	2	6	20130	20135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017044	ATT	2	6	20172	20177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017044	AAT	2	6	20267	20272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017044	ACC	2	6	26270	26275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017044	AAT	2	6	26350	26355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017044	CAC	2	6	26369	26374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017044	TAC	2	6	26586	26591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017044	AAC	2	6	26925	26930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017044	TAA	2	6	26976	26981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017044	TTA	2	6	26995	27000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017044	CTT	2	6	27054	27059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017044	AAT	2	6	27133	27138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017044	AAG	2	6	27221	27226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017044	AGT	2	6	27268	27273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017044	TAA	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017044	TAA	2	6	27353	27358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017044	GAT	2	6	27424	27429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017044	GAT	2	6	28131	28136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017044	TAC	2	6	28156	28161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017044	ATT	2	6	28163	28168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017044	GAT	2	6	28461	28466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017044	GTA	2	6	28533	28538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017044	ATG	2	6	28549	28554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017044	TTA	2	6	28594	28599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017044	GAA	2	6	28625	28630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017044	CTT	2	6	28683	28688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017044	TAA	2	6	28705	28710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017044	ATA	2	6	28736	28741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017044	TAT	2	6	28880	28885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017044	AAC	2	6	29052	29057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017044	ATG	2	6	29263	29268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017044	CGA	2	6	31751	31756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017044	TTA	2	6	32671	32676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017044	TAA	2	6	32732	32737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017044	ATA	2	6	32764	32769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017044	GGA	2	6	32806	32811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017044	CAA	2	6	33555	33560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017044	TAA	2	6	35277	35282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017044	ATT	2	6	35604	35609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017044	AAT	2	6	36710	36715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017044	TTC	2	6	37120	37125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017044	TTC	3	9	37132	37140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017044	TGA	2	6	37230	37235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017044	GAT	2	6	37305	37310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017044	ATT	2	6	38461	38466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017044	TTC	2	6	38479	38484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017044	TAA	2	6	38493	38498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017044	TAT	2	6	39391	39396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017044	GAG	2	6	39415	39420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017044	GTG	2	6	39461	39466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017044	TTA	2	6	39502	39507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017044	ATA	2	6	39559	39564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017044	CAC	2	6	40327	40332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017044	ATA	2	6	40674	40679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017044	TTC	2	6	40705	40710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017044	ATT	2	6	40823	40828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017044	CTT	2	6	41330	41335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017044	TAT	2	6	41378	41383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017044	AAT	2	6	41434	41439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017044	TAA	2	6	41634	41639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017044	ATT	2	6	41942	41947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017044	CTT	2	6	41986	41991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017044	ATC	2	6	42080	42085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017044	TCA	2	6	42208	42213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017044	TCT	2	6	42577	42582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017044	TTA	2	6	42610	42615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017044	AAT	2	6	42624	42629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017044	TCT	2	6	42726	42731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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