MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 448

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	TCGGAT	2	12	1806	1817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482125
2	NC_017043	AGGAAT	2	12	2797	2808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383482126
3	NC_017043	TCCTAT	2	12	8121	8132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482130
4	NC_017043	CAAGCC	2	12	13039	13050	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383482137
5	NC_017043	TCCGAT	2	12	17052	17063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482140
6	NC_017043	TAGAAT	2	12	17468	17479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482141
7	NC_017043	AAAGTT	2	12	18134	18145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482142
8	NC_017043	TTTTGC	2	12	19431	19442	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383482143
9	NC_017043	ACTATA	2	12	21942	21953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482146
10	NC_017043	ATTACG	2	12	23484	23495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482147
11	NC_017043	TTAAAT	2	12	23654	23665	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
12	NC_017043	ATGATA	2	12	28040	28051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482153
13	NC_017043	AATCTT	2	12	31534	31545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482159
14	NC_017043	TAGATA	2	12	33856	33867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482160
15	NC_017043	ATGGTG	2	12	35770	35781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383482163
16	NC_017043	TAAAAA	2	12	36262	36273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383482164
17	NC_017043	ACAAAA	2	12	38308	38319	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383482166
18	NC_017043	TGCAAA	2	12	39906	39917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482167
19	NC_017043	ATAAAG	2	12	45894	45905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482171
20	NC_017043	CCTGCT	2	12	46874	46885	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383482172
21	NC_017043	GTATAT	2	12	46970	46981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482172
22	NC_017043	ATTCAC	2	12	49423	49434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482174
23	NC_017043	GATAAT	2	12	53793	53804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482177
24	NC_017043	AGCTTA	2	12	55582	55593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482180
25	NC_017043	CCTGCT	2	12	56116	56127	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383482180
26	NC_017043	GAACAG	2	12	57434	57445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482183
27	NC_017043	TCTAAA	2	12	65773	65784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482188
28	NC_017043	TCACCG	2	12	70411	70422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383482194
29	NC_017043	ATGAAT	2	12	73523	73534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482198
30	NC_017043	TCATTG	2	12	74077	74088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482198
31	NC_017043	TTTATC	2	12	74807	74818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383482199
32	NC_017043	AAATAA	2	12	79691	79702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383482202
33	NC_017043	AGGACA	2	12	81244	81255	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482203
34	NC_017043	TTTAAT	2	12	84750	84761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482205
35	NC_017043	CTTTTT	2	12	85800	85811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482206
36	NC_017043	ATTTTA	2	12	86192	86203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482207
37	NC_017043	ATTTAA	2	12	87762	87773	50 %	50 %	0 %	0 %	383482209
38	NC_017043	AATTAT	2	12	88780	88791	50 %	50 %	0 %	0 %	383482212
39	NC_017043	AAATAT	2	12	89854	89865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482213
40	NC_017043	AATTTT	2	12	95277	95288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482216
41	NC_017043	GATATT	2	12	95298	95309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482216
42	NC_017043	AGATTT	2	12	95702	95713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482216
43	NC_017043	CATATG	2	12	97935	97946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482218
44	NC_017043	TAAAAC	2	12	101187	101198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482220
45	NC_017043	TAAATT	2	12	102236	102247	50 %	50 %	0 %	0 %	383482221
46	NC_017043	ATATAA	2	12	102509	102520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482222
47	NC_017043	TTATAT	2	12	103678	103689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482224
48	NC_017043	TACTAA	2	12	104648	104659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482227
49	NC_017043	CTATTA	2	12	104689	104700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482227
50	NC_017043	GATCTT	2	12	107266	107277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482231
51	NC_017043	TCACCG	2	12	110357	110368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383482239
52	NC_017043	GTAGCG	2	12	110903	110914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383482239
53	NC_017043	TTATCC	2	12	114413	114424	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482242
54	NC_017043	TTAAAG	2	12	118248	118259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482244
55	NC_017043	CGCAAA	2	12	118616	118627	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482245
56	NC_017043	GATCTT	2	12	125092	125103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482251
57	NC_017043	ATGATT	2	12	125708	125719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482251
58	NC_017043	AGAAAA	2	12	127810	127821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383482255
59	NC_017043	AAACTA	2	12	128485	128496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482257
60	NC_017043	CCGGTA	2	12	129202	129213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482257
61	NC_017043	TCTTGA	2	12	138432	138443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482263
62	NC_017043	TACCGG	2	12	139528	139539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482263
63	NC_017043	TTAATA	2	12	141837	141848	50 %	50 %	0 %	0 %	383482265
64	NC_017043	GTATTT	2	12	141967	141978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482265
65	NC_017043	TTGATT	2	12	148409	148420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482269
66	NC_017043	TAAAAC	2	12	153370	153381	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482276
67	NC_017043	TTAGTA	2	12	162464	162475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482287
68	NC_017043	TTTTAT	2	12	162756	162767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482287
69	NC_017043	AGTAAA	2	12	166492	166503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482292
70	NC_017043	GCTTAC	2	12	167772	167783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482294
71	NC_017043	ATAAAG	2	12	170588	170599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482300
72	NC_017043	TAAAGA	2	12	184131	184142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482313
73	NC_017043	CATCCT	2	12	185564	185575	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383482316
74	NC_017043	TTTTTA	2	12	189461	189472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482321
75	NC_017043	TATTTT	2	12	191130	191141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482322
76	NC_017043	TAATTT	2	12	195057	195068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482325
77	NC_017043	CGGCAT	2	12	199741	199752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482328
78	NC_017043	GCCGCA	2	12	201278	201289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383482331
79	NC_017043	TTAAAT	2	12	202448	202459	50 %	50 %	0 %	0 %	383482333
80	NC_017043	CTTCCC	2	12	203585	203596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482334
81	NC_017043	TGCTAC	2	12	211822	211833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482343
82	NC_017043	TATTGT	2	12	212546	212557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482343
83	NC_017043	TAAAGC	2	12	216855	216866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482346
84	NC_017043	ATTTAA	2	12	218748	218759	50 %	50 %	0 %	0 %	383482347
85	NC_017043	GATTAT	2	12	223959	223970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482351
86	NC_017043	ATGCCG	2	12	224944	224955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482351
87	NC_017043	CGGTAG	2	12	226668	226679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383482352
88	NC_017043	ATTGAT	2	12	226726	226737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482352
89	NC_017043	TAGCAG	2	12	228464	228475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482353
90	NC_017043	CTTTTT	2	12	233123	233134	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482359
91	NC_017043	TCAATA	2	12	233890	233901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482359
92	NC_017043	AAAGGA	2	12	238314	238325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482363
93	NC_017043	TTTTTC	2	12	238577	238588	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482364
94	NC_017043	CGGTTA	2	12	242698	242709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482369
95	NC_017043	ATAATT	2	12	249550	249561	50 %	50 %	0 %	0 %	383482379
96	NC_017043	AAATTT	2	12	250149	250160	50 %	50 %	0 %	0 %	383482379
97	NC_017043	ATAAAC	2	12	250954	250965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482379
98	NC_017043	AGCGAT	2	12	251353	251364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482379
99	NC_017043	TAAACA	2	12	252012	252023	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482379
100	NC_017043	ATTCCT	2	12	261883	261894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482387
101	NC_017043	AAATTA	2	12	262501	262512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482387
102	NC_017043	CAAAGC	2	12	269184	269195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482392
103	NC_017043	GCCGTA	2	12	269572	269583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482392
104	NC_017043	ATCTTC	2	12	273436	273447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482396
105	NC_017043	TAAGCG	2	12	274879	274890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482399
106	NC_017043	ATATTT	2	12	282242	282253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482405
107	NC_017043	AGCTTC	2	12	285700	285711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482406
108	NC_017043	ACGAAA	2	12	291553	291564	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383482411
109	NC_017043	GCAAAG	2	12	297656	297667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482419
110	NC_017043	TAGGAG	2	12	300035	300046	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383482422
111	NC_017043	AAAGCA	2	12	301232	301243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383482424
112	NC_017043	ATTCAT	2	12	304296	304307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482426
113	NC_017043	TGAACA	2	12	304882	304893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482427
114	NC_017043	TTGATA	2	12	310141	310152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482430
115	NC_017043	AAGCTG	2	12	310638	310649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482431
116	NC_017043	TTTATC	2	12	315265	315276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383482435
117	NC_017043	ATTATG	2	12	316405	316416	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482436
118	NC_017043	TTATAT	2	12	319472	319483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482437
119	NC_017043	TATCAA	2	12	320103	320114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482437
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231	NC_017043	AAAGTA	2	12	645175	645186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482738
232	NC_017043	GTAGGT	2	12	647391	647402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383482741
233	NC_017043	TACAAT	2	12	656472	656483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482751
234	NC_017043	CGGCAT	2	12	657160	657171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482752
235	NC_017043	ATGTTA	2	12	662167	662178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482755
236	NC_017043	AATGAA	2	12	662381	662392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482755
237	NC_017043	TTAGCT	2	12	664526	664537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482757
238	NC_017043	ATTGCT	2	12	671130	671141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482764
239	NC_017043	CATTAT	2	12	677781	677792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482771
240	NC_017043	ATATTT	2	12	679745	679756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482773
241	NC_017043	TAATAT	2	12	679856	679867	50 %	50 %	0 %	0 %	383482773
242	NC_017043	GAAGTA	2	12	682675	682686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383482774
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251	NC_017043	ATACCG	2	12	712081	712092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383482808
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258	NC_017043	CAAAAT	2	12	727073	727084	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482824
259	NC_017043	ACCGTA	2	12	728210	728221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383482827
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263	NC_017043	CTAATT	2	12	736501	736512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482837
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265	NC_017043	ACCGGA	2	12	740009	740020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482842
266	NC_017043	AAAATA	2	12	740803	740814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383482842
267	NC_017043	CAGATG	2	12	742936	742947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482842
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269	NC_017043	GCATTA	2	12	744669	744680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482842
270	NC_017043	TCCGAT	2	12	744786	744797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482842
271	NC_017043	ATTTAA	2	12	745184	745195	50 %	50 %	0 %	0 %	383482842
272	NC_017043	AATTAT	2	12	745407	745418	50 %	50 %	0 %	0 %	383482842
273	NC_017043	CATATA	2	12	753047	753058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482851
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289	NC_017043	TAATAT	2	12	789348	789359	50 %	50 %	0 %	0 %	383482888
290	NC_017043	ATAGTG	2	12	790347	790358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482889
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347	NC_017043	AAGTGA	2	12	947575	947586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383483025
348	NC_017043	TAAATT	2	12	947595	947606	50 %	50 %	0 %	0 %	383483025
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