MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 1160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	AAGAA	2	10	740	749	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017043	GAAAT	2	10	2249	2258	60 %	20 %	20 %	0 %	383482125
3	NC_017043	TAATA	2	10	3307	3316	60 %	40 %	0 %	0 %	383482126
4	NC_017043	AATTA	2	10	3571	3580	60 %	40 %	0 %	0 %	383482126
5	NC_017043	GTAAT	2	10	4786	4795	40 %	40 %	20 %	0 %	383482127
6	NC_017043	ATTTA	2	10	5027	5036	40 %	60 %	0 %	0 %	383482127
7	NC_017043	AATCG	2	10	5126	5135	40 %	20 %	20 %	20 %	383482127
8	NC_017043	TTTCA	2	10	7534	7543	20 %	60 %	0 %	20 %	383482130
9	NC_017043	TTATT	2	10	12393	12402	20 %	80 %	0 %	0 %	383482136
10	NC_017043	TTGAT	3	15	13705	13719	20 %	60 %	20 %	0 %	383482137
11	NC_017043	ATTTT	2	10	13866	13875	20 %	80 %	0 %	0 %	383482137
12	NC_017043	GATAA	2	10	13996	14005	60 %	20 %	20 %	0 %	383482137
13	NC_017043	TAACA	2	10	14853	14862	60 %	20 %	0 %	20 %	383482138
14	NC_017043	AATAT	2	10	15720	15729	60 %	40 %	0 %	0 %	383482139
15	NC_017043	GTATT	2	10	17263	17272	20 %	60 %	20 %	0 %	383482141
16	NC_017043	ATCTT	2	10	18829	18838	20 %	60 %	0 %	20 %	383482143
17	NC_017043	TTTTA	2	10	19639	19648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017043	TATTT	2	10	19814	19823	20 %	80 %	0 %	0 %	383482144
19	NC_017043	TGCTT	2	10	22429	22438	0 %	60 %	20 %	20 %	383482147
20	NC_017043	TTCCA	2	10	24693	24702	20 %	40 %	0 %	40 %	383482148
21	NC_017043	ACTGT	2	10	24799	24808	20 %	40 %	20 %	20 %	383482148
22	NC_017043	ACATA	2	10	26131	26140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017043	TTAGT	2	10	26587	26596	20 %	60 %	20 %	0 %	383482150
24	NC_017043	TTATT	2	10	28491	28500	20 %	80 %	0 %	0 %	383482153
25	NC_017043	TTATT	2	10	29262	29271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017043	ATTTA	2	10	29506	29515	40 %	60 %	0 %	0 %	383482154
27	NC_017043	TATTT	2	10	31352	31361	20 %	80 %	0 %	0 %	383482158
28	NC_017043	TGATA	2	10	31617	31626	40 %	40 %	20 %	0 %	383482159
29	NC_017043	GAAAA	2	10	32479	32488	80 %	0 %	20 %	0 %	383482159
30	NC_017043	GTAGT	2	10	32717	32726	20 %	40 %	40 %	0 %	383482159
31	NC_017043	CAAGC	2	10	33333	33342	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017043	AAATA	2	10	33872	33881	80 %	20 %	0 %	0 %	383482160
33	NC_017043	ATTTA	2	10	34629	34638	40 %	60 %	0 %	0 %	383482161
34	NC_017043	CTATT	2	10	35290	35299	20 %	60 %	0 %	20 %	383482163
35	NC_017043	AATAA	2	10	36845	36854	80 %	20 %	0 %	0 %	383482164
36	NC_017043	AAATA	2	10	36951	36960	80 %	20 %	0 %	0 %	383482164
37	NC_017043	TTAAT	2	10	38255	38264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017043	TGGTA	2	10	39876	39885	20 %	40 %	40 %	0 %	383482167
39	NC_017043	GCAAG	2	10	41028	41037	40 %	0 %	40 %	20 %	383482169
40	NC_017043	CCTCA	2	10	41729	41738	20 %	20 %	0 %	60 %	383482170
41	NC_017043	AACTA	2	10	42042	42051	60 %	20 %	0 %	20 %	383482170
42	NC_017043	AAATG	2	10	43185	43194	60 %	20 %	20 %	0 %	383482170
43	NC_017043	AAATT	2	10	43670	43679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017043	TATAT	2	10	47390	47399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017043	AGTAA	2	10	49819	49828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017043	AAAAT	2	10	52706	52715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017043	ATTAA	2	10	53025	53034	60 %	40 %	0 %	0 %	383482176
48	NC_017043	GTAAA	2	10	53707	53716	60 %	20 %	20 %	0 %	383482177
49	NC_017043	ATTTT	2	10	54986	54995	20 %	80 %	0 %	0 %	383482179
50	NC_017043	ATTAT	2	10	55298	55307	40 %	60 %	0 %	0 %	383482179
51	NC_017043	ACCGG	2	10	56428	56437	20 %	0 %	40 %	40 %	383482180
52	NC_017043	GTCAA	2	10	59233	59242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017043	GCTTG	2	10	61194	61203	0 %	40 %	40 %	20 %	383482185
54	NC_017043	TAACT	2	10	62203	62212	40 %	40 %	0 %	20 %	383482187
55	NC_017043	GAAAA	2	10	63793	63802	80 %	0 %	20 %	0 %	383482188
56	NC_017043	TAATT	2	10	64428	64437	40 %	60 %	0 %	0 %	383482188
57	NC_017043	GCTAT	2	10	64925	64934	20 %	40 %	20 %	20 %	383482188
58	NC_017043	TAGTA	2	10	67257	67266	40 %	40 %	20 %	0 %	383482190
59	NC_017043	TATGA	2	10	67327	67336	40 %	40 %	20 %	0 %	383482190
60	NC_017043	TAATT	2	10	67427	67436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017043	TAGTT	2	10	67859	67868	20 %	60 %	20 %	0 %	383482191
62	NC_017043	GAAAA	2	10	68514	68523	80 %	0 %	20 %	0 %	383482192
63	NC_017043	GGAGG	2	10	68897	68906	20 %	0 %	80 %	0 %	383482192
64	NC_017043	TTAAT	2	10	69708	69717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017043	ATTTT	2	10	70262	70271	20 %	80 %	0 %	0 %	383482194
66	NC_017043	ATAAA	2	10	71310	71319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017043	ATTAC	2	10	72411	72420	40 %	40 %	0 %	20 %	383482196
68	NC_017043	GATAT	2	10	72669	72678	40 %	40 %	20 %	0 %	383482196
69	NC_017043	AATAT	2	10	73303	73312	60 %	40 %	0 %	0 %	383482197
70	NC_017043	TACCG	2	10	75008	75017	20 %	20 %	20 %	40 %	383482199
71	NC_017043	ACCGT	2	10	75111	75120	20 %	20 %	20 %	40 %	383482199
72	NC_017043	CTTGC	2	10	76819	76828	0 %	40 %	20 %	40 %	383482199
73	NC_017043	TGCAC	2	10	77238	77247	20 %	20 %	20 %	40 %	383482200
74	NC_017043	TTAAA	2	10	77373	77382	60 %	40 %	0 %	0 %	383482201
75	NC_017043	TATTT	2	10	78519	78528	20 %	80 %	0 %	0 %	383482202
76	NC_017043	TTGCA	2	10	79055	79064	20 %	40 %	20 %	20 %	383482202
77	NC_017043	TATTT	2	10	79413	79422	20 %	80 %	0 %	0 %	383482202
78	NC_017043	TTTAA	2	10	80055	80064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017043	TAATT	2	10	82930	82939	40 %	60 %	0 %	0 %	383482203
80	NC_017043	TTTAT	2	10	83368	83377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017043	TTTTC	2	10	83501	83510	0 %	80 %	0 %	20 %	383482204
82	NC_017043	TAATA	2	10	84939	84948	60 %	40 %	0 %	0 %	383482205
83	NC_017043	GATAT	2	10	88792	88801	40 %	40 %	20 %	0 %	383482212
84	NC_017043	TAACA	2	10	89786	89795	60 %	20 %	0 %	20 %	383482213
85	NC_017043	GGAGC	2	10	90970	90979	20 %	0 %	60 %	20 %	383482213
86	NC_017043	TTTTG	2	10	91143	91152	0 %	80 %	20 %	0 %	383482213
87	NC_017043	ATTTT	2	10	92373	92382	20 %	80 %	0 %	0 %	383482215
88	NC_017043	CATAT	2	10	94097	94106	40 %	40 %	0 %	20 %	383482215
89	NC_017043	GTGCT	2	10	95805	95814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017043	TAAAA	2	10	101124	101133	80 %	20 %	0 %	0 %	383482220
91	NC_017043	ATATT	2	10	102996	103005	40 %	60 %	0 %	0 %	383482223
92	NC_017043	TGCTA	2	10	104483	104492	20 %	40 %	20 %	20 %	383482227
93	NC_017043	ATTAT	2	10	104581	104590	40 %	60 %	0 %	0 %	383482227
94	NC_017043	TATTT	2	10	106274	106283	20 %	80 %	0 %	0 %	383482228
95	NC_017043	AAATA	2	10	106674	106683	80 %	20 %	0 %	0 %	383482229
96	NC_017043	TGATT	2	10	108629	108638	20 %	60 %	20 %	0 %	383482235
97	NC_017043	GAAAT	2	10	109660	109669	60 %	20 %	20 %	0 %	383482238
98	NC_017043	CTAAG	2	10	109703	109712	40 %	20 %	20 %	20 %	383482238
99	NC_017043	AATGT	2	10	110712	110721	40 %	40 %	20 %	0 %	383482239
100	NC_017043	TGAAA	2	10	110983	110992	60 %	20 %	20 %	0 %	383482239
101	NC_017043	AATAA	2	10	111415	111424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017043	GAAAA	2	10	114511	114520	80 %	0 %	20 %	0 %	383482242
103	NC_017043	ATCAA	2	10	115289	115298	60 %	20 %	0 %	20 %	383482242
104	NC_017043	TCAGA	2	10	116427	116436	40 %	20 %	20 %	20 %	383482243
105	NC_017043	ATTAT	2	10	117949	117958	40 %	60 %	0 %	0 %	383482244
106	NC_017043	TAGGG	2	10	119262	119271	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017043	TTACC	2	10	121500	121509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017043	AATGA	2	10	124249	124258	60 %	20 %	20 %	0 %	383482250
109	NC_017043	AAAAT	2	10	124613	124622	80 %	20 %	0 %	0 %	383482251
110	NC_017043	AATTG	2	10	126145	126154	40 %	40 %	20 %	0 %	383482252
111	NC_017043	TATAT	2	10	128552	128561	40 %	60 %	0 %	0 %	383482257
112	NC_017043	TGGTG	2	10	128756	128765	0 %	40 %	60 %	0 %	383482257
113	NC_017043	CTATG	2	10	132383	132392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017043	CAAAA	2	10	132802	132811	80 %	0 %	0 %	20 %	383482260
115	NC_017043	AAGAT	2	10	133638	133647	60 %	20 %	20 %	0 %	383482261
116	NC_017043	AGAAA	2	10	134751	134760	80 %	0 %	20 %	0 %	383482261
117	NC_017043	TTTAT	2	10	135727	135736	20 %	80 %	0 %	0 %	383482262
118	NC_017043	TATAA	2	10	135761	135770	60 %	40 %	0 %	0 %	383482262
119	NC_017043	ACACT	2	10	136483	136492	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017043	TATCT	2	10	137816	137825	20 %	60 %	0 %	20 %	383482263
121	NC_017043	ATTTT	2	10	139950	139959	20 %	80 %	0 %	0 %	383482263
122	NC_017043	CTATC	2	10	140332	140341	20 %	40 %	0 %	40 %	383482263
123	NC_017043	CATTA	2	10	140673	140682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017043	ACTTT	2	10	142440	142449	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017043	ATTTT	2	10	144010	144019	20 %	80 %	0 %	0 %	383482267
126	NC_017043	TAGTT	2	10	144116	144125	20 %	60 %	20 %	0 %	383482267
127	NC_017043	CCTTA	2	10	144285	144294	20 %	40 %	0 %	40 %	383482267
128	NC_017043	TAAAT	2	10	146198	146207	60 %	40 %	0 %	0 %	383482267
129	NC_017043	AATTT	2	10	146669	146678	40 %	60 %	0 %	0 %	383482268
130	NC_017043	TTTAA	2	10	148498	148507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017043	TATCT	2	10	150201	150210	20 %	60 %	0 %	20 %	383482271
132	NC_017043	GATTT	2	10	150413	150422	20 %	60 %	20 %	0 %	383482271
133	NC_017043	AATAA	2	10	153066	153075	80 %	20 %	0 %	0 %	383482275
134	NC_017043	TTATT	2	10	153093	153102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017043	AGATG	2	10	153947	153956	40 %	20 %	40 %	0 %	383482276
136	NC_017043	GAACT	2	10	154840	154849	40 %	20 %	20 %	20 %	383482276
137	NC_017043	AGTCA	2	10	155902	155911	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017043	ATTAA	2	10	156653	156662	60 %	40 %	0 %	0 %	383482278
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279	NC_017043	ATAAA	2	10	310922	310931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_017043	TGGCA	2	10	455049	455058	20 %	20 %	40 %	20 %	383482576
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