MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 3800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	AGTA	2	8	92	99	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017043	AATT	2	8	640	647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017043	GATA	2	8	2356	2363	50 %	25 %	25 %	0 %	383482126
4	NC_017043	ATTT	2	8	2845	2852	25 %	75 %	0 %	0 %	383482126
5	NC_017043	ATGC	2	8	3038	3045	25 %	25 %	25 %	25 %	383482126
6	NC_017043	TTAC	2	8	3206	3213	25 %	50 %	0 %	25 %	383482126
7	NC_017043	TAAA	2	8	3606	3613	75 %	25 %	0 %	0 %	383482126
8	NC_017043	AGCA	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	383482126
9	NC_017043	AGTA	2	8	3982	3989	50 %	25 %	25 %	0 %	383482126
10	NC_017043	CTAT	2	8	4187	4194	25 %	50 %	0 %	25 %	383482126
11	NC_017043	TTTA	2	8	5185	5192	25 %	75 %	0 %	0 %	383482127
12	NC_017043	TAAT	2	8	5494	5501	50 %	50 %	0 %	0 %	383482127
13	NC_017043	ATTT	2	8	6049	6056	25 %	75 %	0 %	0 %	383482128
14	NC_017043	AAAT	3	12	6062	6073	75 %	25 %	0 %	0 %	383482128
15	NC_017043	AAGG	2	8	7738	7745	50 %	0 %	50 %	0 %	383482130
16	NC_017043	TAAT	2	8	7973	7980	50 %	50 %	0 %	0 %	383482130
17	NC_017043	GAAC	2	8	8478	8485	50 %	0 %	25 %	25 %	383482130
18	NC_017043	AAAG	2	8	8623	8630	75 %	0 %	25 %	0 %	383482130
19	NC_017043	TCTA	2	8	9476	9483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017043	TAAT	2	8	9936	9943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017043	TAAT	2	8	10154	10161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017043	AGGT	2	8	10945	10952	25 %	25 %	50 %	0 %	383482133
23	NC_017043	CTTT	2	8	11175	11182	0 %	75 %	0 %	25 %	383482134
24	NC_017043	TTTA	2	8	11203	11210	25 %	75 %	0 %	0 %	383482134
25	NC_017043	AAAT	3	12	11561	11572	75 %	25 %	0 %	0 %	383482135
26	NC_017043	AAAT	2	8	11617	11624	75 %	25 %	0 %	0 %	383482135
27	NC_017043	CCTA	2	8	12469	12476	25 %	25 %	0 %	50 %	383482136
28	NC_017043	TAAA	2	8	12526	12533	75 %	25 %	0 %	0 %	383482136
29	NC_017043	GCGA	2	8	12810	12817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017043	AAAT	2	8	12993	13000	75 %	25 %	0 %	0 %	383482137
31	NC_017043	TCCA	2	8	13347	13354	25 %	25 %	0 %	50 %	383482137
32	NC_017043	AGCA	2	8	13541	13548	50 %	0 %	25 %	25 %	383482137
33	NC_017043	TTAT	2	8	14674	14681	25 %	75 %	0 %	0 %	383482138
34	NC_017043	TTTA	2	8	14949	14956	25 %	75 %	0 %	0 %	383482138
35	NC_017043	TGTA	2	8	15017	15024	25 %	50 %	25 %	0 %	383482138
36	NC_017043	AGAC	2	8	15893	15900	50 %	0 %	25 %	25 %	383482139
37	NC_017043	AAGC	2	8	17123	17130	50 %	0 %	25 %	25 %	383482140
38	NC_017043	CTAT	2	8	17170	17177	25 %	50 %	0 %	25 %	383482140
39	NC_017043	TTAT	2	8	18549	18556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017043	TTAC	2	8	18653	18660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017043	TTTA	2	8	18747	18754	25 %	75 %	0 %	0 %	383482143
42	NC_017043	TTCC	2	8	19322	19329	0 %	50 %	0 %	50 %	383482143
43	NC_017043	TTTC	2	8	20419	20426	0 %	75 %	0 %	25 %	383482144
44	NC_017043	ATTT	2	8	20965	20972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017043	ATTA	2	8	21181	21188	50 %	50 %	0 %	0 %	383482145
46	NC_017043	ATTT	2	8	21216	21223	25 %	75 %	0 %	0 %	383482145
47	NC_017043	TAAA	2	8	21655	21662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017043	ACTT	2	8	22048	22055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017043	CTGC	2	8	22466	22473	0 %	25 %	25 %	50 %	383482147
50	NC_017043	TAAA	2	8	22505	22512	75 %	25 %	0 %	0 %	383482147
51	NC_017043	GCAA	2	8	22689	22696	50 %	0 %	25 %	25 %	383482147
52	NC_017043	CTAA	2	8	23068	23075	50 %	25 %	0 %	25 %	383482147
53	NC_017043	TAAA	2	8	23153	23160	75 %	25 %	0 %	0 %	383482147
54	NC_017043	AGTA	2	8	23847	23854	50 %	25 %	25 %	0 %	383482147
55	NC_017043	TATC	2	8	24566	24573	25 %	50 %	0 %	25 %	383482148
56	NC_017043	TAAT	2	8	24890	24897	50 %	50 %	0 %	0 %	383482148
57	NC_017043	TATT	2	8	24964	24971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017043	ATTT	2	8	25043	25050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017043	CTAT	3	12	25270	25281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017043	TTTA	2	8	25482	25489	25 %	75 %	0 %	0 %	383482149
61	NC_017043	ATTA	2	8	25560	25567	50 %	50 %	0 %	0 %	383482149
62	NC_017043	ATAA	2	8	25617	25624	75 %	25 %	0 %	0 %	383482149
63	NC_017043	AAAT	2	8	25682	25689	75 %	25 %	0 %	0 %	383482149
64	NC_017043	ATAA	2	8	25799	25806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017043	TAAT	2	8	25867	25874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017043	ATAA	2	8	26041	26048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017043	TAAC	2	8	26095	26102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017043	ATTC	2	8	26194	26201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017043	ATTT	2	8	26513	26520	25 %	75 %	0 %	0 %	383482150
70	NC_017043	TGCT	2	8	26737	26744	0 %	50 %	25 %	25 %	383482150
71	NC_017043	ATTC	2	8	27139	27146	25 %	50 %	0 %	25 %	383482151
72	NC_017043	TTAA	2	8	27762	27769	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
73	NC_017043	ATGA	2	8	28027	28034	50 %	25 %	25 %	0 %	383482153
74	NC_017043	AGAT	2	8	28178	28185	50 %	25 %	25 %	0 %	383482153
75	NC_017043	ATTG	2	8	28889	28896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017043	TAGC	2	8	28998	29005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017043	CTTT	2	8	29073	29080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017043	TTCA	2	8	29398	29405	25 %	50 %	0 %	25 %	383482154
79	NC_017043	ATTG	2	8	29427	29434	25 %	50 %	25 %	0 %	383482154
80	NC_017043	TAAA	2	8	29620	29627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017043	AGCA	2	8	29847	29854	50 %	0 %	25 %	25 %	383482155
82	NC_017043	ATTA	2	8	30181	30188	50 %	50 %	0 %	0 %	383482156
83	NC_017043	AATT	2	8	31174	31181	50 %	50 %	0 %	0 %	383482158
84	NC_017043	AATA	2	8	31436	31443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017043	TGAT	2	8	31571	31578	25 %	50 %	25 %	0 %	383482159
86	NC_017043	AAAT	2	8	31847	31854	75 %	25 %	0 %	0 %	383482159
87	NC_017043	ACTC	2	8	31888	31895	25 %	25 %	0 %	50 %	383482159
88	NC_017043	GCAA	2	8	31908	31915	50 %	0 %	25 %	25 %	383482159
89	NC_017043	TTGT	2	8	32045	32052	0 %	75 %	25 %	0 %	383482159
90	NC_017043	CGAG	2	8	32538	32545	25 %	0 %	50 %	25 %	383482159
91	NC_017043	CATC	2	8	32569	32576	25 %	25 %	0 %	50 %	383482159
92	NC_017043	TGCT	2	8	32894	32901	0 %	50 %	25 %	25 %	383482159
93	NC_017043	AGTA	2	8	33155	33162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017043	GGGA	2	8	33419	33426	25 %	0 %	75 %	0 %	383482160
95	NC_017043	GATT	2	8	33986	33993	25 %	50 %	25 %	0 %	383482160
96	NC_017043	TCAT	2	8	34339	34346	25 %	50 %	0 %	25 %	383482160
97	NC_017043	ATGA	2	8	34442	34449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017043	GTTT	2	8	34571	34578	0 %	75 %	25 %	0 %	383482161
99	NC_017043	ATTT	2	8	34746	34753	25 %	75 %	0 %	0 %	383482162
100	NC_017043	TTTA	2	8	34921	34928	25 %	75 %	0 %	0 %	383482162
101	NC_017043	TAAA	2	8	34966	34973	75 %	25 %	0 %	0 %	383482162
102	NC_017043	ATAA	2	8	35006	35013	75 %	25 %	0 %	0 %	383482162
103	NC_017043	ATTT	2	8	35079	35086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017043	TTTA	2	8	35685	35692	25 %	75 %	0 %	0 %	383482163
105	NC_017043	TTAT	2	8	35881	35888	25 %	75 %	0 %	0 %	383482163
106	NC_017043	AATT	2	8	36169	36176	50 %	50 %	0 %	0 %	383482164
107	NC_017043	TTAA	2	8	36599	36606	50 %	50 %	0 %	0 %	383482164
108	NC_017043	TTAT	2	8	36675	36682	25 %	75 %	0 %	0 %	383482164
109	NC_017043	GAAA	2	8	36922	36929	75 %	0 %	25 %	0 %	383482164
110	NC_017043	ATGA	2	8	37197	37204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017043	GTAG	2	8	37859	37866	25 %	25 %	50 %	0 %	383482165
112	NC_017043	TAAA	2	8	38160	38167	75 %	25 %	0 %	0 %	383482165
113	NC_017043	ACTT	2	8	38597	38604	25 %	50 %	0 %	25 %	383482167
114	NC_017043	ATTG	2	8	38926	38933	25 %	50 %	25 %	0 %	383482167
115	NC_017043	TGCC	2	8	39182	39189	0 %	25 %	25 %	50 %	383482167
116	NC_017043	TTAA	2	8	39571	39578	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
117	NC_017043	GATG	2	8	40466	40473	25 %	25 %	50 %	0 %	383482168
118	NC_017043	TAAT	2	8	40506	40513	50 %	50 %	0 %	0 %	383482168
119	NC_017043	AGAA	2	8	40593	40600	75 %	0 %	25 %	0 %	383482169
120	NC_017043	CATA	2	8	41592	41599	50 %	25 %	0 %	25 %	383482170
121	NC_017043	TTGC	2	8	41653	41660	0 %	50 %	25 %	25 %	383482170
122	NC_017043	TAAT	2	8	41804	41811	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
123	NC_017043	TGCT	2	8	42755	42762	0 %	50 %	25 %	25 %	383482170
124	NC_017043	AGCT	2	8	42843	42850	25 %	25 %	25 %	25 %	383482170
125	NC_017043	TAAA	2	8	42851	42858	75 %	25 %	0 %	0 %	383482170
126	NC_017043	TAAT	2	8	43534	43541	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
127	NC_017043	AGAT	2	8	44237	44244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017043	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017043	TAAA	2	8	45165	45172	75 %	25 %	0 %	0 %	383482171
130	NC_017043	GATA	2	8	45797	45804	50 %	25 %	25 %	0 %	383482171
131	NC_017043	AATC	2	8	46009	46016	50 %	25 %	0 %	25 %	383482171
132	NC_017043	TAAA	2	8	46579	46586	75 %	25 %	0 %	0 %	383482172
133	NC_017043	ATAA	2	8	46704	46711	75 %	25 %	0 %	0 %	383482172
134	NC_017043	TAAA	2	8	47041	47048	75 %	25 %	0 %	0 %	383482172
135	NC_017043	TAAT	2	8	47355	47362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017043	GCCT	2	8	48333	48340	0 %	25 %	25 %	50 %	383482173
137	NC_017043	ATAG	2	8	49141	49148	50 %	25 %	25 %	0 %	383482174
138	NC_017043	CCGG	2	8	49438	49445	0 %	0 %	50 %	50 %	383482174
139	NC_017043	AAAG	2	8	49687	49694	75 %	0 %	25 %	0 %	383482174
140	NC_017043	ATAA	2	8	49759	49766	75 %	25 %	0 %	0 %	383482174
141	NC_017043	TCAA	2	8	49843	49850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017043	AGAT	2	8	50810	50817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017043	TAAC	2	8	50888	50895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017043	TACT	2	8	51005	51012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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